Sequenciamento de transcriptoma completo baseado em nanoporos
O sequenciamento Nanopore se distingue de outras plataformas de sequenciamento, pois os nucleotídeos são lidos diretamente sem síntese de DNA e geram leituras longas em dezenas de quilobases. Isso permite a leitura direta de transcrições completas e enfrenta os desafios dos estudos transcriptômicos.
√ Baixo viés específico de sequência
√ Leitura completa de cDNA para estudos de estrutura genética
√ Menos dados necessários para cobrir o mesmo número de transcrições
√ Identificação de múltiplas isoformas por gene
√ Quantificação de expressão em nível de isoforma
Pipeline típico de bioinformática
Últimos casos de sucesso com tecnologias de biomarcadores
1. Análises comparativas de transcriptomas completos revelam a dinâmica de desenvolvimento do caule Gnetum luofuense
Jornal: Fronteiras na Genética
Publicado: março de 2021
Palavras-chave: MinION | Emenda alternativa | APA | lncRNA | Transcrições diferencialmente expressas
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2. Movimento unidirecional de pequenos RNAs dos brotos às raízes em heteroenxertos interespecíficos
Diário: Plantas da Natureza
Publicado: janeiro de 2021
Palavras-chave: Nanoporo | Iluminar | detecção de mRNA móvel completo
3. A análise completa do transcriptoma de raízes de aspargos revela o mecanismo molecular de tolerância ao sal induzida por fungos micorrízicos arbusculares
Revista: Botânica Ambiental e Experimental
Publicado: janeiro de 2021
Palavras-chave: MinION | Transcrições expressas diferencialmente | Fatores de transcrição | Emenda alternativa
4. Mudanças características fisiológicas e transcriptoma completo de raízes e folhas de rosa (Rosa chinensis) em resposta ao estresse hídrico
Revista: Fisiologia Vegetal e Celular
Publicado: outubro de 2020
Palavras-chave: PromethION | Transcrições expressas diferencialmente | Previsão funcional | Isoformas emendadas | TF e lncRNA
5. Análise e comparação abrangente do sequenciamento de RNA baseado em PacBio e nanoporos do transcriptoma de Arabidopsis
Diário: Método Planta
Publicado: abril de 2020
Palavras-chave: GridION | PromethION | Sequela PacBio | Illumina NovaSeq | Alinhamento do genoma | Identificação da transcrição | Emenda alternativa | RSS | LncRNA | Quantificação de isoformas
Notícias e Destaques visa compartilhar os mais recentes casos de sucesso com Biomarker Technologies, capturando novas conquistas científicas, bem como técnicas proeminentes aplicadas durante o estudo.
Horário da postagem: 08 de janeiro de 2022