Genoma

Montagem em escala cromossômica e análise do genoma de Biomassa Crop Crop Miscanthus Lutarioriparius
Sequenciamento de nanoporos | Ilumina | Hi-C | Sequenciamento de RNA | Filogenia
Neste estudo, as tecnologias de biomarcadores forneceram suporte técnico no sequenciamento de nanoporos, montagem de genoma de novo, montagem assistida pelo Hi-C, etc.
Resumo
Miscanthus, uma planta perene rizomatosa, tem um grande potencial para a produção de bioenergia para sua alta biomassa e tolerância ao estresse. Relatamos uma assembléia em escala cromossômica deMISSATHUS LUTARIORIARIUSGenoma combinando o sequenciamento de nanoporos de Oxford e tecnologias Hi-C. A montagem de 2,07-GB cobre 96,64% do genoma, com contig n50 de 1,71 Mb. As seqüências de centrômero e telômeros são montadas para todos os 19 cromossomos e cromossomo 10, respectivamente. A origem alotetraplóide do M. lutarioriparius é configurada usando repetições de satélite centroméricas. A estrutura do genoma tetraplóide e vários rearranjos cromossômicos em relação ao sorgo são claramente demonstrados. Genes duplicados em tandem deM. Lutarioripariussão enriquecidos funcionais não apenas em termos relacionados à resposta ao estresse, mas na biossíntese da parede celular. Famílias de genes relacionados à resistência a doenças, biossíntese da parede celular e transporte de íons metálicos são bastante expandidos e evoluídos. A expansão dessas famílias pode ser uma base genômica importante para o aprimoramento de traços notáveis deM. Lutarioriparius.
Estatísticas -chave da montagem do genoma


Figura. Visão geral da assembléia do genoma de M. lutariparius
Notícias e destaques Visa compartilhar os casos mais recentes de sucesso com as tecnologias de biomarcadores, capturando novas realizações científicas e técnicas proeminentes aplicadas durante o estudo.
Hora de postagem: Jan-05-2022