Isoformas alternativas complexas e variáveis nos organismos são mecanismos genéticos importantes para regular a expressão gênica e a diversidade de proteínas. A identificação precisa das estruturas de transcrição é a base para o estudo aprofundado dos padrões de regulação da expressão gênica. A plataforma de sequenciamento de nanoporos trouxe com sucesso o estudo transcriptômico para o nível de isoforma. Esta plataforma de análise foi projetada para analisar os dados de RNA-seq gerados na plataforma Nanopore na base do genoma de referência, que atinge análises qualitativas e quantitativas no nível do gene e no nível de transcrições.