O transcriptoma é o vínculo entre informações genéticas genômicas e o proteoma da função biológica. A regulação do nível transcricional é o modo de regulação mais importante e mais amplamente estudado de organismos. O sequenciamento do transcriptoma pode sequenciar o transcriptoma em qualquer momento no tempo ou sob qualquer condição, com uma resolução precisa para um único nucleotídeo. Amostra de transcrições específicas.
Atualmente, a tecnologia de sequenciamento de transcriptoma tem sido amplamente utilizada em agronomia, medicina e outros campos de pesquisa, incluindo regulação de desenvolvimento de animais e plantas, adaptação ambiental, interação imunológica, localização de genes, evolução genética de espécies e detecção de doenças genéticas e de doenças genéticas.