lncrna

Os RNAs não codificadores longos (lncRNA) são RNAs maiores que 200 nucleotídeos com baixo potencial de codificação, mas com funções regulatórias críticas. O pipeline BMKCloud LncRNA foi projetado para analisar bibliotecas esgotadas com rRNA com um genoma de referência de alta qualidade e bem anotado, analisando a expressão de lncRNA e mRNA juntos. Após o corte e o controle de qualidade da leitura, as leituras estão alinhadas ao genoma de referência para montar transcrições, e a análise subsequente da estrutura de genes revela splicing alternativo e novos genes. As transcrições são identificadas como mRNAs ou lncRNAs, e a análise de expressão diferencial identifica lncRNAs expressos diferencialmente, seus alvos e genes diferencialmente expressos (DEGs). Os alvos de LNCRNA expressos diferencialmente e diferencialmente são anotados funcionalmente para encontrar categorias funcionais enriquecidas.