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Sequenciamento de Exoma Completo Humano

O sequenciamento completo do exoma humano (hWES) é amplamente reconhecido como uma abordagem de sequenciamento poderosa e econômica para identificar mutações causadoras de doenças. Apesar de constituir apenas cerca de 1,7% de todo o genoma, os exons desempenham um papel crucial ao refletir diretamente o perfil das funções proteicas totais. Notavelmente, no genoma humano, mais de 85% das mutações relacionadas com doenças manifestam-se nas regiões codificadoras de proteínas. A BMKGENE oferece um serviço abrangente e flexível de sequenciamento de exoma humano completo com duas estratégias diferentes de captura de éxons disponíveis para atender a vários objetivos de pesquisa.


Detalhes do serviço

Resultados de demonstração

Recursos de serviço

● Dois painéis de exoma disponíveis com base no enriquecimento de alvo com sondas: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) e xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

● Sequenciamento no Illumina NovaSeq.

● Pipeline de bioinformática direcionado para análise de doenças ou análise de tumores.

Vantagens do serviço

Tem como alvo a região de codificação de proteínas: Ao capturar e sequenciar regiões codificadoras de proteínas, o hWES é utilizado para revelar variantes relacionadas à estrutura da proteína.

Custo Efetivo:hWES produz aproximadamente 85% das mutações associadas a doenças humanas de 1% do genoma humano.

Alta precisão: Com alta profundidade de sequenciamento, o hWES facilita a detecção de variantes comuns e variantes raras com frequências inferiores a 1%.

Rigoroso controle de qualidade: Implementamos cinco pontos de controle principais em todas as etapas, desde a preparação de amostras e bibliotecas até sequenciamento e bioinformática. Esse monitoramento meticuloso garante a entrega de resultados consistentemente de alta qualidade.

Análise Abrangente de Bioinformática: nosso pipeline vai além da identificação de variações no genoma de referência, pois incorpora análises avançadas projetadas para abordar especificamente questões de pesquisa relacionadas a aspectos genéticos de doenças ou análise de tumores.

Suporte pós-venda:Nosso compromisso vai além da conclusão do projeto, com um período de serviço pós-venda de 3 meses. Durante esse período, oferecemos acompanhamento do projeto, assistência na solução de problemas e sessões de perguntas e respostas para esclarecer quaisquer dúvidas relacionadas aos resultados.

Especificações de amostra

Estratégia de Captura de Exons

Estratégia de sequenciamento

Saída de dados recomendada

Sure Select Humano Todos Exon v6 (Agilent)

ou painel de hibridização xGen Exome v2 (IDT)

 

Illumina NovaSeq PE150

5 -10 GB

Para distúrbios mendelianos/doenças raras: > 50x

Para amostras de tumor: ≥ 100x

Requisitos de amostra

Tipo de amostra

 

 Quantia(Qubit®)

 

Concentração 

Volume

 

 

 Pureza (NanoDrop™)

 

DNA genômico

 

≥ 50ng
≥ 6 ng/μL
≥ 15 μL
 
DO260/280=1,8-2,0
 
sem degradação, sem contaminação

 

Bioinformática

Fluxo de trabalho WES_BI_Disease-01

A análise bioinformática de amostras da doença hWES inclui:

● CQ de dados de sequenciamento

● Alinhamento do Genoma de Referência

● Identificação de SNPs e InDels

● Anotação Funcional de SNPs e InDels

Fluxo de trabalho WES_BI_Tumor-01

A análise bioinformática de amostras de tumores inclui:

● CQ de dados de sequenciamento

● Alinhamento do Genoma de Referência

● Identificação de SNPs, InDels e variações somáticas

● Identificação de variantes germinativas

● Análise de assinaturas de mutação

● Identificação de genes impulsionadores com base em mutações de ganho de função

● Anotação de mutação no nível de suscetibilidade a medicamentos

● Análise de heterogeneidade – cálculo de pureza e ploidia

Fluxo de trabalho de serviço

entrega de amostra

Entrega de amostra

Experiência piloto

Extração de DNA

Preparação da Biblioteca

Construção de biblioteca

Sequenciamento

Sequenciamento

Análise de dados

Análise de dados

数据上传-01

Entrega de dados

Serviços pós-venda

Serviços pós-venda


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  • CQ de dados – Estatísticas de captura de Exome

     

    wps_doc_22

     

    Identificação de variante – InDels

    Foto 36

    Análise avançada: identificação e distribuição de SNPs/InDels deletérios – Gráfico Circos

     

    Foto 37

    Análise tumoral: identificação e distribuição de mutações somáticas – Gráfico Circos

     

    Foto 38

     

    Análise tumoral: linhagens clonais

     

    Foto 39

     

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