O estudo da associação em todo o genoma (GWAS) visa identificar variantes genéticas (genótipo) que associadas a características específicas (fenótipo). Os estudos da GWA investiga marcadores genéticos cruzam o genoma inteiro de grande número de indivíduos e prevê associações de fenótipo genótipo por análise estatística em nível populacional. O resequivamento do genoma inteiro pode descobrir todas as variantes genéticas. Acoplamento com dados fenotípicos, os GWAs podem ser processados para identificar SNPs, QTLs e genes candidatos relacionados ao fenótipo, o que apóia fortemente a criação moderna de animais/plantas. O SLAF é uma estratégia de seqüenciamento de genoma simplificado auto-desenvolvido, que descobre marcadores distribuídos em todo o genoma, SNP. Esses SNPs, como marcadores genéticos moleculares, podem ser processados para estudos de associação com características direcionadas. É uma estratégia econômica na identificação de características complexas associadas a variações genéticas.
