Genética evolutiva

Estudos genéticos evolutivos visam entender a trajetória evolutiva das populações usando informações de polimorfismo em sequências genômicas. O pipeline de genética evolutiva do BMKCloud foi projetado para analisar dados de WGS ou fragmento amplificado de Locus específico (SLAF) de grandes populações. Após o controle de qualidade dos dados brutos, as leituras estão alinhadas ao genoma de referência e as variantes são chamadas. O oleoduto inclui construção de árvores filogenéticas, análise de componentes principais (PCA), análise da estrutura populacional, desequilíbrio de ligação (LD), análise de varredura seletiva e análise de genes candidatos.