Sequenciamento de mRNA eucariótico-NGS
Características
● Captura de poli mRNA antes da preparação da biblioteca
● Preparação opcional de biblioteca direcional de mRNA para permitir a obtenção de dados de sequenciamento específico de fita
● Análise bioinformática da expressão gênica e estrutura transcrita
Vantagens
●Ampla experiência: Nossa equipe processou mais de 600.000 amostras na BMKgene, abrangendo diversos tipos de amostras, como culturas de células, tecidos e fluidos corporais. Trazemos uma vasta experiência para cada projeto e concluímos com sucesso mais de 100.000 projetos de mRNA-Seq em vários domínios de pesquisa.
●Rigoroso controle de qualidade: Implementamos pontos de controle centrais em todas as etapas, desde a preparação de amostras e bibliotecas até sequenciamento e bioinformática. Esse monitoramento meticuloso garante a entrega de resultados consistentemente de alta qualidade, garantindo que seu projeto esteja em mãos confiáveis.
●Anotação abrangente: Usamos vários bancos de dados para anotar funcionalmente os genes expressos diferencialmente (DEGs) e realizar análises de enriquecimento correspondentes. Essa abordagem abrangente fornece insights sobre os processos celulares e moleculares subjacentes à resposta do transcriptoma, garantindo que você esteja totalmente informado sobre os resultados do seu projeto.
●Suporte pós-venda: Nosso compromisso vai além da conclusão do projeto com um período de serviço pós-venda de 3 meses. Durante esse período, oferecemos acompanhamento do projeto, assistência na solução de problemas e sessões de perguntas e respostas para esclarecer quaisquer dúvidas relacionadas aos resultados.
Requisitos de amostra e entrega
| Biblioteca | Estratégia de sequenciamento | Dados recomendados | Controle de qualidade |
| Poli A enriquecido | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10GB | Q30≥85% |
Requisitos de amostra:
Nucleotídeos:
| Conc.(ng/μl) | Quantidade (μg) | Pureza | Integridade | |
| Biblioteca Padrão | ≥ 10 | ≥ 0,2 | DO260/280=1,7-2,5 DO260/230=0,5-2,5 Contaminação limitada ou inexistente de proteínas ou DNA mostrada no gel. | Para plantas: RIN≥4,0; Para animais: RIN≥4,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; elevação limitada ou nenhuma elevação da linha de base |
| Biblioteca Direcional | ≥ 10 | ≥ 0,2 | DO260/280=1,7-2,5 DO260/230=0,5-2,5 Contaminação limitada ou inexistente de proteínas ou DNA mostrada no gel. | Para plantas: RIN≥4,0; Para animais: RIN≥4,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; elevação limitada ou nenhuma elevação da linha de base |
● Plantas:
Raiz, Caule ou Pétala: 450 mg
Folha ou Semente: 300 mg
Fruta: 1,2g
●Animal:
Coração ou Intestino: 300 mg
Vísceras ou Cérebro: 240 mg
Músculo: 450 mg
Ossos, Cabelo ou Pele: 1g
● Artrópodes:
Insetos: 6g
Crustáceos: 300 mg
● Sangue total: 1 tubo
● Células: 106 células
Entrega de amostra recomendada
Recipiente: tubo de centrífuga de 2 ml (folha de estanho não é recomendada)
Rotulagem da amostra: Grupo+réplica, por exemplo, A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...
Expedição:
1. Gelo seco: As amostras precisam ser embaladas em sacos e enterradas em gelo seco.
2. Tubos de mesa de RNAs: As amostras de RNA podem ser secas em tubo de estabilização de RNA (por exemplo, RNAstable®) e enviadas em temperatura ambiente.
Fluxo de trabalho de serviço
Projeto de experimento
Entrega de amostra
Extração de RNA
Construção de biblioteca
Sequenciamento
Análise de dados
Serviços pós-venda
Bioinformática
Eucariótico Fluxo de trabalho de análise de sequenciamento de mRNA
Bioinformática
ØControle de qualidade de dados brutos
ØAlinhamento do genoma de referência
ØAnálise da estrutura da transcrição
ØQuantificação de expressão
ØAnálise de expressão diferencial
ØAnotação e enriquecimento de função
Alinhamento do Genoma de Referência
Saturação de dados
Correlação de amostras e avaliação de réplicas biológicas
Genes Expressados Diferencialmente (DEGs)
Anotação Funcional de DEGs
Enriquecimento Funcional de DEGs
Explore os avanços facilitados pelos serviços de sequenciamento de mRNA NGS eucariótico da BMKGene por meio de uma coleção selecionada de publicações.
Huang, L. et al. (2023) 'Triclosan e triclocarban enfraquecem a capacidade olfativa do peixinho dourado ao restringir o reconhecimento de odor, interrompendo a transdução do sinal olfativo e perturbando o processamento da informação olfativa', Water Research, 233, p. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus sequestra p11 humano para redirecionar fagossomas contendo fungos para uma via não degradativa', Cell Host & Microbe, 31(3), pp. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) 'Fatores de transcrição TCP envolvidos no desenvolvimento de brotos de Ma Bamboo (Dendrocalamus latiflorus Munro)', Frontiers in Plant Science, 13, p. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. et al. (2022) 'O genoma do Chrysanthemum lavandulifolium e o mecanismo molecular subjacente aos diversos tipos de capítulos', Horticulture Research, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie et al. (2023) 'Um nanorreator em cascata para melhorar a terapia sonodinâmica no câncer colorretal por meio de aumento sinérgico de ROS e bloqueio de autofagia', Nano Today, 49, p. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
