Bibliotecas pré-fabricadas Illumina
Características
●Plataformas:Illumina NovaSeq 6000 e NovaSeq X Plus
●Modos de sequenciamento:PE150 e PE250
●Controle de qualidade de bibliotecas antes do sequenciamento
●Sequenciamento de controle de qualidade e entrega de dados:entrega de relatório de controle de qualidade e dados brutos em formato fastq após demultiplexação e filtragem de leituras Q30
Vantagens do serviço
●Versatilidade dos serviços de sequenciamento:o cliente pode optar por sequenciar por pista, célula de fluxo ou por quantidade de dados necessários (sequenciamento parcial de pista).
●Ampla experiência na plataforma de sequenciamento Illumina:com milhares de projetos fechados com diversas espécies.
●Entrega do relatório de CQ de sequenciamento:com métricas de qualidade, precisão dos dados e desempenho geral do projeto de sequenciamento.
●Processo de sequenciamento maduro:com curto tempo de resposta.
●Rigoroso controle de qualidade: implementamos requisitos rigorosos de controle de qualidade para garantir a entrega de resultados consistentemente de alta qualidade.
Exemplos de plataformas
| Plataforma | Célula de Fluxo | Modo de sequenciamento | Unidade | Produção estimada |
| NovaSeq X | 10B (8 pistas) | PE150 | pista única Pista Parcial | 375 Gb/pista |
| 25B (8 pistas) | PE150 | pista única Pista Parcial | 1000 Gb/via | |
| NovaSeq 6000 | Célula de fluxo SP (2 pistas) | PE250 | Célula de Fluxo pista única Pista Parcial | 325-400 M leituras/pista |
| Célula de fluxo S4 (4 pistas) | PE150 | Célula de Fluxo pista única Pista Parcial | ~800 Gb/pista |
Requisitos de amostra
| Quantidade de dados (X) | Concentração (qPCR/nM) | Volume | |
| Sequenciamento parcial de pista
| X ≤ 10GB | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
| 10 GB <X ≤ 50 GB | ≥ 2nM | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <X ≤ 100 GB | ≥ 3nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 GB | ≥ 4nM | ≥ 25 μl | |
| Sequenciamento de pista | Por pista | ≥ 1,5 nM/conjunto de bibliotecas | ≥ 25 μl/conjunto de biblioteca |
Além da concentração e da quantidade total, também é necessário um padrão de pico adequado.
Nota: O sequenciamento de pistas de bibliotecas de baixa diversidade requer pico de PhiX para garantir chamada de base robusta.
Recomendamos enviar bibliotecas pré-agrupadas como amostras. Se você precisar que o BMKGENE execute o pooling de bibliotecas, consulte
os requisitos da biblioteca para sequenciamento parcial de pistas.
Tamanho da biblioteca (mapa de pico)
O pico principal deve estar entre 300-450 pb.
As bibliotecas devem ter um único pico principal, sem contaminação do adaptador e sem dímeros de primer.
Entre em contato conosco se suas amostras não atenderem aos requisitos de material inicial.
Fluxo de trabalho de serviço
Controle de qualidade da biblioteca
Sequenciamento
Controle de qualidade de dados
Entrega do projeto
Relatório de controle de qualidade da biblioteca
Um relatório sobre a qualidade da biblioteca é fornecido antes do sequenciamento, avaliando a quantidade e a fragmentação da biblioteca.
Relatório de CQ de sequenciamento
Tabela 1. Estatísticas sobre dados de sequenciamento.
| ID da amostra | BMKID | Leituras brutas | Dados brutos (pb) | Leituras limpas (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figura 1. Distribuição de qualidade ao longo das leituras em cada amostra
Figura 2. Distribuição de conteúdo base
Figura 3. Distribuição do conteúdo lido nos dados de sequenciamento
