د بشپړ جینوم بیسلفائٹ ترتیب (WGBS)
د بشپړ جینوم بیسلفائٹ تسلسل (WGBS) د DNA میتیلیشن ژورې سپړنې لپاره د سرو زرو معیاري میتودولوژي په توګه ولاړ دی ، په ځانګړي توګه په سایټوسین (5-mC) کې پنځم ځای ، د جین څرګندولو او سیلولر فعالیت یو مهم تنظیم کونکی. د WGBS اصلي اصل د بیسلفائٹ درملنه شامله ده، د غیر میتیلیټ سایټوسینونو uracil (C ته U) ته د بدلون هڅوي، پداسې حال کې چې میتیل شوي سایټوزینونه بدلیږي. دا تخنیک د واحد اساس حل وړاندیز کوي، څیړونکو ته اجازه ورکوي چې په هر اړخیزه توګه د میتیلوم تحقیق وکړي او د مختلفو شرایطو سره تړلي غیر معمولي میتیلیشن نمونې ښکاره کړي، په ځانګړې توګه سرطان. د WGBS په ګمارلو سره، ساینس پوهان کولی شي د جینوم پراخه میتیلیشن منظرو په اړه بې ساري بصیرت ترلاسه کړي، د ایپیګینیټیک میکانیزمونو په اړه دقیق پوهاوی چمتو کوي چې مختلف بیولوژیکي پروسو او ناروغیو لاندې راولي.
د خدماتو ځانګړتیاوې
● د حوالې جینوم ته اړتیا لري.
● Lambda DNA د بایسلفائٹ تبادلې موثریت څارلو لپاره اضافه شوی.
● په Illumina NovaSeq کې ترتیب کول.
د خدماتو ګټې
●د DNA میتیلیشن څیړنې لپاره د سرو زرو معیار: دا بالغ میتیلیشن تبادله پروسس کولو ټیکنالوژي لوړ دقت او ښه تولید وړتیا لري.
●پراخه پوښښ او د واحد اساس حل:د جینوم په کچه د میتیلیشن سایټونو کشف.
●بشپړ پلیټ فارم:د نمونې پروسس کولو، کتابتون جوړونې، د بایو انفارماتیک تحلیلونو ترتیب کولو څخه یو ځای غوره خدمت چمتو کړئ.
●پراخه تجربه: د WGBS د ترتیب کولو پروژو سره چې په بریالیتوب سره د مختلفو ډولونو په اوږدو کې بشپړ شوي، BMKGENE د یوې لسیزې څخه زیات تجربه، یو ډیر ماهر تحلیلي ټیم، هراړخیز منځپانګې، او د پلور وروسته غوره ملاتړ راوړي.
●د ټرانسکرټومیک تحلیل سره د یوځای کیدو امکان: د نورو omics ډیټا لکه RNA-seq سره د WGBS مدغم تحلیل ته اجازه ورکول.
د نمونې مشخصات
| کتابتون | د ترتیب کولو ستراتیژي | وړاندیز شوي ډاټا تولید | د کیفیت کنټرول |
| د بیسلفیت درملنه | Illumina PE150 | 30x ژوروالی | Q30 ≥ 85% د بیسلفیټ تبادله > 99٪ |
د نمونې اړتیاوې
| غلظت (ng/µL) | ټول مقدار (µg) | اضافي اړتیاوې | |
| جینومیک DNA | ≥ 5 | ≥ 400 ng | محدود تخریب یا ککړتیا |
د خدمت کاري جریان
د نمونې سپارل
د DNA استخراج
د کتابتون جوړول
ترتیب کول
د معلوماتو تحلیل
د معلوماتو تحویل
لاندې تحلیلونه شامل دي:
● د خام ترتیب کیفیت کنټرول؛
● د جینوم حواله کولو لپاره نقشه کول؛
● د 5mC میتیل شوي اډې کشف؛
● د میتیلیشن توزیع او تشریح تحلیل؛
● د متفاوت میتیل شوي سیمو تحلیل (DMRs)؛
● د DMRs سره تړلي جینونو فعالیتي تشریح.
د 5mC میتیلیشن کشف: د میتیل شوي سایټونو ډولونه
د میتیلینشن نقشه. د 5mC میتیلیشن جینوم پراخه توزیع
د لوړ میتیل شوي سیمو تشریح
په توپیر سره میتیل شوي سیمې: اړوند جینونه
په متفاوت ډول میتیل شوي سیمې: د اړونده جینونو تشریح (جین اونټولوژي)
د څیړنې پرمختګونه وپلټئ چې د BMKGene د بشپړ جینوم بیسلفائٹ ترتیب کولو خدماتو لخوا چمتو شوي د خپرونو د ترتیب شوي ټولګې له لارې چمتو شوي.
فین، Y. et al. (2020) 'د بشپړ جینوم بیسلفائٹ ترتیب په کارولو سره د پسونو کنکال عضلاتو پراختیا په جریان کې د DNA میتیلیشن پروفایلونو تحلیل'،BMC جینومکس, 21(1)، مخ 1-15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
Zhao، X. et al. (2022) 'ناول deoxyribonucleic acid methylation perturbations په هغو کارګرانو کې چې د وینیل کلورایډ سره مخ شوي'،توکسیکولوژي او صنعتي روغتیا, 38(7)، مخونه 377-388. doi: 10.1177/07482337221098600
زو، J. et al. (2020) د روميانو د ميوو په پخولو کې د جينوم ميتيليشن، د غير کوډ کولو RNAs، mRNAs او ميټابوليټونو تر منځ اړيکې،د نبات ژورنال, 103(3)، مخونه 980-994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
