-
د واحد نیوکلی RNA تسلسل
د واحد حجرې نیول او د دودیز کتابتون جوړونې تخنیکونو پراختیا، د لوړې کچې ترتیب سره یوځای، د حجرو په کچه د جین بیان مطالعاتو کې انقلاب راوستی دی. دا پرمختګ د پیچلي حجرو نفوس ژور او هراړخیز تحلیل ته اجازه ورکوي ، په ټولو حجرو کې د اوسط جین څرګندولو پورې اړوند محدودیتونو باندې بریالي کیږي او د دې نفوس دننه ریښتیني توپیر ساتي. پداسې حال کې چې د واحد حجرې RNA ترتیب کول (scRNA-seq) د نه منلو وړ ګټې لري، دا په ځینو نسجونو کې له ننګونو سره مخ کیږي چیرې چې د واحد حجرې تعلیق رامینځته کول ستونزمن ثابتوي او تازه نمونو ته اړتیا لري. په BMKGene کې، موږ د عصري 10X جینومکس کرومیم ټیکنالوژۍ په کارولو سره د واحد نیوکلیوس RNA ترتیب (snRNA-seq) وړاندیز کولو سره دا خنډ حل کوو. دا طریقه د نمونو طیف پراخه کوي چې د واحد حجرې په کچه د ټرانسکریپټوم تحلیل لپاره مناسب وي.
د نیوکلی جلا کول د نوښتګر 10X جینومکس کرومیم چپ له لارې ترسره کیږي، چې د اتو چینل مایکرو فلوایډیک سیسټم سره د ډبل کراسنګ سره وړاندې کیږي. د دې سیسټم دننه، د جیل موتی بارکوډونه، پرائمرونه، انزایمونه، او یو واحد نیوکلیوس د نانوالیټر په اندازه د تیلو څاڅکو کې پوښل شوي، د جیل بیډ ان ایمولشن (GEM) جوړوي. د GEM جوړیدو وروسته، د حجرو لیسز او د بارکوډ خوشې کول په هر GEM کې واقع کیږي. وروسته، د mRNA مالیکولونه په cDNAs کې د 10X بارکوډونو او یونیک مالیکولر پیژندونکي (UMIs) شاملولو سره د برعکس لیږد څخه تیریږي. دا cDNAs بیا د معیاري ترتیب کتابتون جوړونې تابع دي ، د واحد حجرې په کچه د جین بیان پروفایلونو قوي او پراخه سپړنه اسانه کوي.
پلیټ فارم: 10 × جینومکس کرومیم او ایلومینا نووا سیق پلیټ فارم
-
10x جینومکس ویزیم سپیشل ټرانسکرټوم
ځایی ټرانسکریټومکس یوه عصري ټیکنالوژي ده چې څیړونکو ته اجازه ورکوي چې په نسجونو کې د جین بیان نمونې وپلټي پداسې حال کې چې د دوی ځایي شرایط ساتي. په دې ډومین کې یو پیاوړی پلیټ فارم د 10x جینومکس ویزیم دی چې د ایلومینا ترتیب سره یوځای شوی. د 10X ویزیم اصول په ځانګړي چپ باندې د ټاکل شوي نیول شوي ساحې سره پروت دی چیرې چې د نسج برخې ځای په ځای شوي. دا د نیولو ساحه د بارکوډ شوي ځایونه لري، هر یو د نسج دننه د ځانګړي ځایي موقعیت سره مطابقت لري. د نسج څخه نیول شوي RNA مالیکولونه بیا د ریورس لیږد پروسې په جریان کې د ځانګړي مالیکولر پیژندونکي (UMIs) سره لیبل شوي. دا بارکوډ شوي ځایونه او UMIs دقیق ځایي نقشه کول او د جین څرګندولو مقدار په یو واحد حجرو ریزولوشن کې فعالوي. د ځایي بارکوډ شوي نمونو او UMIs ترکیب د تولید شوي ډیټا دقت او ځانګړتیا ډاډ ورکوي. د دې ځایي ټرانسکرټومیک ټیکنالوژۍ په کارولو سره ، څیړونکي کولی شي د حجرو ځایي تنظیم او په نسجونو کې د پیچلي مالیکول تعاملاتو ژوره پوهه ترلاسه کړي ، په ډیری برخو کې د بیولوژیکي پروسو لاندې میکانیزمونو کې ارزښتناکه لید وړاندې کوي ، پشمول د آنکولوژي ، عصبي ساینس ، پرمختیایی بیولوژي ، معافیت. ، او د نباتاتو مطالعات.
پلیټ فارم: 10X جینومکس ویزیم او ایلومینا نووا سیق
-
بشپړ اوږدوالی mRNA ترتیب کول - نانوپور
پداسې حال کې چې د NGS پر بنسټ د mRNA ترتیب د جین بیان مقدار کولو لپاره یو څو اړخیزه وسیله ده، په لنډو لوستلو باندې تکیه د پیچلو ټرانسکریټومیک تحلیلونو کې د هغې اغیزمنتوب محدودوي. له بلې خوا، د نانوپور ترتیب د اوږد لوستلو ټیکنالوژي کاروي، د بشپړ اوږدوالي mRNA لیږدونو ترتیب کولو توان ورکوي. دا طریقه د بدیل سپلیسینګ، جین فیوژن، پولی-اډینیلیشن، او د mRNA isoforms اندازه کولو جامع سپړنه اسانه کوي.
د نانوپور تسلسل، یو میتود چې د نانوپور واحد مالیکول ریښتیني وخت بریښنایی سیګنالونو باندې تکیه کوي ، په ریښتیني وخت کې پایلې وړاندې کوي. د موټرو پروټینونو لخوا لارښود شوی، دوه ګونی ډنډ شوی DNA په بایوفیلم کې ځای پرځای شوي نانوپور پروټینونو پورې تړلی دی، په داسې حال کې چې دا د ولتاژ توپیر لاندې د نانوپور چینل څخه تیریږي. د DNA سټینډ کې د مختلف اډو لخوا رامینځته شوي ځانګړي بریښنایی سیګنالونه په ریښتیني وخت کې کشف او طبقه بندي کیږي ، د دقیق او دوامداره نیوکلیوټایډ ترتیب اسانه کوي. دا نوښتګر چلند د لنډ لوستلو محدودیتونو باندې بریالي کیږي او د پیچلي جینومیک تحلیلونو لپاره متحرک پلیټ فارم چمتو کوي ، پشمول د پیچلي ټرانسکرټومیک مطالعاتو سره ، د سمدستي پایلو سره.
پلیټ فارم: Nanopore PromethION 48
-
د بشپړ اوږدوالي mRNA ترتیب کول -PacBio
پداسې حال کې چې د NGS پر بنسټ د mRNA ترتیب د جین بیان مقدار کولو لپاره یو څو اړخیزه وسیله ده، په لنډ لوستلو باندې تکیه د پیچلو ټرانسکرټومیک تحلیلونو کې د هغې کارول محدودوي. له بلې خوا، د PacBio تسلسل (Iso-Seq) د اوږد لوستلو ټیکنالوژي کاروي، د بشپړ اوږدوالي mRNA لیږدونو ترتیب کولو توان ورکوي. دا طریقه د بدیل جلا کولو، جین فیوژن، او پولی-اډینیلیشن هراړخیز سپړنه اسانه کوي. په هرصورت، د اړتیا وړ ډیټا د لوړ مقدار له امله د جین څرګندولو مقدار کولو لپاره نور انتخابونه شتون لري. د PacBio ترتیب کولو ټیکنالوژي په واحد مالیکول ، ریښتیني وخت (SMRT) تسلسل تکیه کوي ، د بشپړ اوږدوالي mRNA لیږدونو په نیولو کې ځانګړې ګټه چمتو کوي. دا نوښتګر چلند د صفر موډ ویوګایډونو (ZMWs) او مایکرو فابریکټ شوي څاګانو کارول شامل دي چې د ترتیب کولو پرمهال د DNA پولیمیریز فعالیت ریښتیني وخت مشاهده وړوي. د دې ZMWs دننه، د PacBio د DNA پولیمیریز د DNA بشپړونکي سټینډ ترکیب کوي، اوږد لوستونه رامینځته کوي چې د mRNA ټول لیکونو پورې اړه لري. د PacBio عملیات د سرکلر توافق ترتیب (CCS) حالت کې د ورته مالیکول په مکرر ترتیب کولو سره دقت لوړوي. د HiFi تولید شوي لوستل د NGS سره د پرتلې وړ دقت لري، د پیچلو ټرانسکرټومیک ځانګړتیاو جامع او معتبر تحلیل کې نور هم مرسته کوي.
پلیټ فارم: PacBio Sequel II؛ PacBio Revio
-
Eukaryotic mRNA Sequencing-NGS
د mRNA ترتیب کول، یو څو اړخیزه ټیکنالوژي، د ځانګړو شرایطو لاندې په حجرو کې د ټولو mRNA لیږدونو جامع پروفایل کولو ځواک ورکوي. د دې پراخو غوښتنلیکونو سره، دا خورا مهم وسیله د جین څرګندولو پیچلي پروفایلونه، د جین جوړښتونه، او مالیکول میکانیزمونه چې د متنوع بیولوژیکي پروسو سره تړاو لري افشا کوي. په پراخه کچه په بنسټیزو څیړنو، کلینیکي تشخیصاتو، او د مخدره توکو پراختیا کې منل شوي، د mRNA ترتیب د سیلولر متحرکاتو او جینیاتي مقرراتو پیچلتیاو ته بصیرت وړاندې کوي، په مختلفو برخو کې د دې د احتمال په اړه تجسس راپاروي.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq X؛ DNBSEQ-T7
-
د غیر حوالې پر بنسټ د mRNA تسلسل-NGS
د mRNA ترتیب کول د ځانګړو شرایطو لاندې په حجرو کې د ټولو mRNA لیږدونو جامع پروفایل کولو ځواک ورکوي. دا عصري ټیکنالوژي د یوې پیاوړې وسیلې په توګه کار کوي، د پیچلي جین بیان پروفایلونه، د جین جوړښتونه، او د مختلفو بیولوژیکي پروسو سره تړلي مالیکول میکانیزمونه افشا کوي. په پراخه کچه په بنسټیزو څیړنو، کلینیکي تشخیص، او د مخدره توکو پراختیا کې منل شوي، د mRNA ترتیب د سیلولر متحرکاتو او جینیاتي مقرراتو پیچلتیاو کې بصیرت وړاندې کوي.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq X؛ DNBSEQ-T7
-
اوږد غیر کوډ کولو ترتیب - ایلومینا
اوږده غیر کوډ کولو RNAs (lncRNAs) له 200 نیوکلیوټایډونو څخه اوږد دي چې د کوډ کولو لږترلږه ظرفیت لري او د غیر کوډ کولو RNA کې مهم عناصر دي. په نیوکلیوس او سایتوپلازم کې موندل شوي، دا RNAs په ایپی جینیټیک، ټرانسکرپشن، او د لیږد وروسته مقرراتو کې مهم رول لوبوي، د سیلولر او مالیکولر پروسو په جوړولو کې د دوی اهمیت په ګوته کوي. د LncRNA ترتیب کول د حجرو توپیر ، اونټوجینیسیس او انساني ناروغیو کې یو پیاوړی وسیله ده.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq
-
کوچني RNA ترتیب کول - ایلومینا
کوچني RNA (sRNA) مالیکولونه، مایکرو آر این اے (miRNAs)، کوچني مداخله کونکي RNAs (siRNAs)، او piwi-interacting RNAs (piRNAs) شامل دي. د دې په منځ کې، miRNAs، شاوخوا 18-25 نیوکلیوټایډونه اوږد دي، په ځانګړې توګه د مختلفو حجرو پروسو کې د دوی د اساسي تنظیمي رول لپاره د پام وړ دي. د نسج ځانګړي او مرحلې ځانګړي بیان نمونو سره، miRNAs په مختلفو ډولونو کې لوړ محافظت څرګندوي.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq
-
CircRNA ترتیب کول - ایلومینا
د سرکلر RNA ترتیب کول (circRNA-seq) د سرکلر RNAs پروفایل او تحلیل کول دي، د RNA مالیکولونو یوه ټولګه چې د غیر کینونیکي سپلاینګ پیښو له امله تړل شوي لوپونه جوړوي، دا RNA د زیاتیدونکي ثبات سره چمتو کوي. پداسې حال کې چې ځینې circRNAs د مایکرو آر این اے سپنجونو په توګه کار کولو لپاره ښودل شوي، د مایکرو آر این اے جلا کوي او د دوی د هدف mRNAs تنظیم کولو څخه مخنیوی کوي، نور circRNAs ممکن د پروټینونو سره تعامل وکړي، د جین بیان تعدیل کړي، یا د سیلولر پروسو کې رول ولري. د circRNA بیان تحلیل د دې مالیکولونو تنظیمي رولونو او د دوی اهمیت په مختلفو سیلولر پروسو، پرمختیایي مرحلو، او د ناروغیو شرایطو کې بصیرت وړاندې کوي، د جین بیان په شرایطو کې د RNA مقرراتو پیچلتیا ژوره پوهه کې مرسته کوي.
-
د بشپړ ټرانسکریټوم ترتیب کول - ایلومینا
د بشپړ ټرانسکریپټوم ترتیب د RNA د متنوع مالیکولونو پروفایل کولو لپاره یوه جامع طریقه وړاندې کوي، د کوډ کولو (mRNA) او غیر کوډ کولو RNAs (lncRNA، circRNA، او miRNA). دا تخنیک په یوه ټاکلې شیبه کې د ځانګړو حجرو ټول ټرانسکریپټوم نیسي، د سیلولر پروسو هولیسټیک پوهه ته اجازه ورکوي. د "ټول RNA ترتیب" په نوم هم پیژندل کیږي، دا موخه د ټرانسکریپټوم په کچه پیچلې تنظیمي شبکې افشا کول دي، د ژورې تحلیل وړ کول لکه د Endogenous RNA (ceRNA) او ګډ RNA تحلیل. دا د فعال ځانګړتیاوو په لور لومړنی ګام په نښه کوي، په ځانګړې توګه د تنظیمي شبکو په کشفولو کې چې د circRNA-miRNA-mRNA-based CERNA تعاملات پکې شامل دي.
