د نباتاتو/حیواناتو ټول جینوم ترتیب کول
د خدماتو ځانګړتیاوې
● د کتابتون چمتو کول معیاري یا د PCR وړیا وي
● په 4 ترتیب کولو پلیټ فارمونو کې شتون لري: Illumina NovaSeq، MGI T7، Nanopore Promethion P48، یا PacBio Revio.
● بایو انفارماتیک تحلیل د ډولونو په موندلو تمرکز کوي: SNP، InDel، SV او CNV
د خدماتو ګټې
●پراخه تجربه او د خپرولو ریکارډونه: د 1000 څخه زیاتو ډولونو لپاره د جینوم ترتیب کولو کې راټولې شوې تجربې په پایله کې له 1000 څخه ډیر خپاره شوي قضیې رامینځته شوي چې د 5000 څخه ډیر د مجموعي اغیزې فکتور سره.
●د بایو انفارماتیک جامع تحلیل: د تغیر کال کولو او فعالیت تشریح په شمول.
● د پلور وروسته ملاتړ:زموږ ژمنتیا د پروژې بشپړیدو هاخوا د 3 میاشتو پلور وروسته خدمت مودې سره غزوي. د دې وخت په جریان کې، موږ د پروژې تعقیب، د ستونزو حل کولو مرستې، او د پوښتنې او ځواب ناستې وړاندیز کوو ترڅو د پایلو پورې اړوند کومې پوښتنې حل کړي.
●جامع تشریح: موږ ډیری ډیټابیسونه کاروو ترڅو جینونه په فعاله توګه د پیژندل شوي تغیراتو سره تشریح کړو او د اړونده غني کولو تحلیل ترسره کړو، د ډیری څیړنیزو پروژو په اړه بصیرت چمتو کوو.
د خدماتو مشخصات
| ډولونه باید وپیژندل شي | د ترتیب کولو ستراتیژي | سپارښتنه شوې ژوره |
| SNP او InDel | Illumina NovaSeq PE150 یا MGI T7 | 10x |
| SV او CNV (لږ دقیق) | 30x | |
| SV او CNV (ډیر دقیق) | نانوپور پروم P48 | 20x |
| SNPs، Indels، SV او CNV | PacBio Revio | 10x |
د نمونې اړتیاوې
| نسج یا استخراج شوي نیوکلیک اسیدونه | Illumina/MGI | نانوپور | PacBio
| ||
| د څارویو ویسرا | 0.5-1 ګرامه | ≥ 3.5 ګرامه
| ≥ 3.5 ګرامه
| ||
| د څارویو عضلات | ≥ 5 ګرامه
| ≥ 5 ګرامه
| |||
| د تی لرونکو وینه | 1.5 ملی لیتر | ≥ 0.5 ملی لیتر
| ≥ 5 ملی لیتر
| ||
| د چرګانو/ماهيانو وينه | ≥ 0.1 ملی لیتر
| ≥ 0.5 ملی لیتر
| |||
| نبات - تازه پاڼي | 1-2 ګرامه | ≥ 2 ګرامه
| ≥ 5 ګرامه
| ||
| کلتوري حجرې |
| ≥ 1x107
| ≥ 1x108
| ||
| د حشراتو نرم نسج / انفرادي | 0.5-1 ګرامه | ≥ 1 ګرامه
| ≥ 3 ګرامه
| ||
| د DNA استخراج
| غلظت: ≥ 1 ng/ µL اندازه: ≥ 30 ng محدود یا هیڅ تخریب یا ککړتیا
| تمرکز مقدار
OD260/280
OD260/230
محدود یا هیڅ تخریب یا ککړتیا
| ≥ 40 ng/ µL 4 µg/روغ حجره/نمونه
1.7-2.2
≥1.5 | تمرکز مقدار
OD260/280
OD260/230
محدود یا هیڅ تخریب یا ککړتیا | ≥ 50 ng/ µL 10 µg/روغ حجره/نمونه
1.7-2.2
1.8-2.5 |
| د PCR وړیا کتابتون چمتو کول: غلظت ≥ 40 ng/ µL اندازه ≥ 500 ng | |||||
د خدمت کاري جریان
د نمونې سپارل
د DNA استخراج
د کتابتون جوړول
ترتیب کول
د معلوماتو تحلیل
د معلوماتو تحویل
لاندې تحلیلونه شامل دي:
- د خام معلوماتو کیفیت کنټرول
- د جینوم حواله کولو لپاره د سمون احصایې
- د توپیر پیژندنه: SNP، InDel، SV او CNV
- د ډولونو فعالیت تشریح
د حوالې جینوم ته د سیده کولو احصایې - د ترتیب ژور ویش
د ډیری نمونو په مینځ کې د SNP زنګ وهل
د InDel پیژندنه - د CDS سیمه او د جینوم پراخه سیمه کې د InDel اوږدوالي احصایې
د جینوم په اوږدو کې د توپیر ویش - سرکوس پلاټ
د پیژندل شوي ډولونو سره د جینونو فعال تشریح - د جین اونټولوژي
چای، Q. et al. (2023) 'A glutathione S-transferase GhTT19 په پنبه کې د انتوکیانین جمع تنظیمولو له لارې د ګل پاڼي رنګ ټاکي'، د نبات بایو ټیکنالوژۍ ژورنال، 21 (2) مخ. 433. doi: 10.1111/PBI.13965.
چینګ، H. et al. (2023) 'د کروموزوم په کچه ځنګلي هیوا بریزیلینسس جینوم د جینومیک په مرسته نسل ورکولو او د ربړ حاصل لوړولو لپاره ارزښتناکه لوسي لپاره نوي اوزار چمتو کوي'، د نبات بایو ټیکنالوژۍ ژورنال، 21(5)، مخونه 1058-1072. doi: 10.1111/PBI.14018.
لی، A. et al. (2021) 'جینوم آف دی ایسټیورین اویسټر د اقلیم د اغیزو او تطابق وړ پلاستیکیت په اړه بصیرت وړاندې کوي'، مخابراتو بیولوژي 2021 4:1، 4(1)، مخونه 1-12. doi: 10.1038/s42003-021-02823-6.
Zeng، T. et al. (2022) 'د وخت په تیریدو سره د چینایي اصلي مرغانو کې د جینوم او میتیلیشن بدلونونو تحلیل د ډولونو د ساتنې په اړه بصیرت وړاندې کوي'، مخابراتو بیولوژي، 5(1)، مخونه 1-12. doi: 10.1038/s42003-022-03907-7.
