د غیر حوالې پر بنسټ د mRNA تسلسل-NGS
ځانګړتیاوې
● د کتابتون د چمتو کولو دمخه د پولی mRNA نیول
● د هر ډول حوالې جینوم څخه خپلواک: د نقلونو د نوي اسمبلۍ پراساس، د یونیجینز لیست رامینځته کول چې د ډیری ډیټابیسونو سره تشریح شوي (NR, Swiss-Prot, COG, KOG, eggNOG, Pfam, GO, KEGG)
● د جین بیان او لیږد جوړښت جامع بایو انفارمیټیک تحلیل
د خدماتو ګټې
●پراخه تجربه: په BMKGENE کې د 600,000 څخه زیاتو نمونو پروسس کولو تعقیب ریکارډ سره، د مختلفو نمونو ډولونه لکه د حجرو کلتور، نسجونه، او د بدن مایعات، زموږ ټیم هرې پروژې ته د تجربې بډایه راوړي. موږ په مختلفو څیړنیزو ډومینونو کې د 100,000 mRNA-Seq پروژې په بریالیتوب سره تړلې دي.
●د کیفیت سخت کنټرول: موږ په ټولو مرحلو کې د کنټرول اصلي نقطې پلي کوو، د نمونې او کتابتون چمتو کولو څخه تر ترتیب او بایو انفارماتیک پورې. دا دقیقه څارنه په دوامداره توګه د لوړ کیفیت پایلې وړاندې کوي.
● جامع تشریح: موږ ډیری ډیټابیسونه کاروو ترڅو په فعاله توګه د توپیر څرګند شوي جینونه (DEGs) تشریح کړي او د ورته بډایه کولو تحلیل ترسره کړي، د ټرانسکریټوم غبرګون لاندې د سیلولر او مالیکولر پروسو په اړه بصیرت چمتو کوي.
●د پلور وروسته ملاتړ: زموږ ژمنتیا د پروژې بشپړیدو هاخوا د 3 میاشتو پلور وروسته خدمت مودې سره غزوي. د دې وخت په جریان کې، موږ د پروژې تعقیب، د ستونزو حل کولو مرستې، او د پوښتنې او ځواب ناستې وړاندیز کوو ترڅو د پایلو پورې اړوند کومې پوښتنې حل کړي.
د نمونې اړتیاوې او تحویلي
| کتابتون | د ترتیب کولو ستراتیژي | د معلوماتو سپارښتنه | د کیفیت کنټرول |
| پولی A غني شوی | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 جي بي | Q30≥85% |
د نمونې اړتیاوې:
نیوکلیوټایډونه:
| Conc.(ng/μl) | مقدار (μg) | پاکوالی | بشپړتیا |
| ≥ ۱۰ | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 محدود یا هیڅ پروټین یا DNA ککړتیا په جیل کې ښودل شوي. | د نباتاتو لپاره: RIN≥4.0؛ د څارویو لپاره: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; محدود یا هیڅ اساسی لوړوالی |
● نباتات:
ریښه، ډډ یا پاڼی: 450 ملی ګرامه
پاڼی یا تخم: 300 ملی ګرامه
ميوه: 1.2 ګرامه
● حیوانات:
زړه یا کولمو: 300 ملی ګرامه
ویزرا یا دماغ: 240 ملی ګرامه
عضلات: 450 mg
هډوکي، ویښتان یا پوستکي: 1 ګرامه
● ارتروپډونه:
حشرات: 6g
Crustacea: 300 mg
● ټوله وینه: 1 ټیوب
● حجرې: 106 حجرې
وړاندیز شوي نمونې تحویلي
کانټینر: 2 ملی لیتر سینټرفیوج ټیوب (د ټین ورق سپارښتنه نه کیږي)
د نمونې لیبل کول: ګروپ + نقل کول لکه A1, A2, A3; B1، B2، B3.
بار وړل:
1. وچه یخ: نمونې باید په کڅوړو کې بسته شي او په وچه یخ کې ښخ شي.
2. د RNAstable ټیوبونه: د RNA نمونې د RNA ثبات ټیوب کې وچې کیدی شي (د بیلګې په توګه RNAstable®) او د خونې په حرارت درجه کې لیږدول کیدی شي.
د خدمت کاري جریان
د تجربې ډیزاین
د نمونې سپارل
د RNA استخراج
د کتابتون جوړول
ترتیب کول
د معلوماتو تحلیل
د پلور وروسته خدمتونه
بایو انفارماتیک
د ټرانسکریټوم اسمبلۍ او یونیګین انتخاب
د یونیګین تشریح
د بیولوژیکي نقلونو نمونه اړیکه او ارزونه
په متفاوت ډول څرګند شوي جینونه (DEGs)
د DEGs فعالیت تشریح
د DEGs فعالیت بډایه کول
هغه پرمختګونه وپلټئ چې د BMKGene د یوکریوټیک NGS mRNA ترتیب کولو خدماتو لخوا چمتو شوي د خپرونو د راټولولو له لارې چمتو شوي.
شین، F. et al. (2020) 'د نوو ټرانسکریټوم مجلس او د امور کیټ فش (سیلوروس اسوټس) په ګوناډونو کې د جنسي پلوه جین بیان'، جینومکس، 112(3)، مخونه 2603-2614. doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.
Zhang، C. et al. (2016) 'په پیاز کې د بلب پړسوب او پراختیا په جریان کې د سوکروز میټابولیزم ټرانسکریټوم تحلیل (Alium cepa L.)'، د نباتاتو په ساینس کې سرحدونه، 7 (سپتمبر)، مخ. 212763. doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.
Zhu، C. et al. (2017) 'De novo اسمبلی، ځانګړتیا او تشریح د سرکوچییلیچتیس سینینسیس د ټرانسکریپټوم لپاره'، PLOS ONE، 12 (2). doi: 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966.
Zou، L. et al. (2021) 'De novo transscriptome analysis د مالګې د فشار لاندې د Podocarpus macrophyllus د مالګې زغم په اړه بصیرت وړاندې کوي'، BMC نبات بیولوژي، 21(1)، مخونه 1-17. doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9.
