BMK کلاډ ننوتل
1

MRNA-SEQ (NGS) د حوالې ژورې سره

百迈客云网站 -11

MRNA-SEQ (NGS) د حوالې ژورې سره

RNA-seq د ژوند او محصولاتو علومو کې یو معیاري وسیله ده، د جینومونو او پروټیمونو ترمنځ واټن پلونه کوي. د دې ځواک د نوي لیکنو کشف کولو کې دی او په یوه اسکر کې د دوی څرګندونې کموي. دا په پراخه کچه کارول کیږي د تقریبا ټیسټومي مطالعاتو لپاره کارول کیږي، د مختلف ځانګړتیاوو یا فینوټیلونو پورې اړوند جسدونه د ځانګړي شرایطو سره سم - د جین څرګندونو ته د جین څرګندونو څرګندولو لپاره د متقابونو پرتله کول. BMKCloud mRNA(Reference) APP integrates expression quantification, differential expression analysis(DEG), and sequence structure analyses into the mRNA-seq(NGS) bioinformatics pipeline and amalgamates the strengths of similar software, ensuring convenience and user-friendliness. کارونکي کولی شي خپل RNA-SEQ ډاټا بادل ته ورسیږي، چیرې چې ایپ هراړخیز، یو له بیوډیز بایټ فارمیک تحلیلونو وړاندې کوي. سربیره پردې، دا د پیرودونکي تجربې ته لومړیتوب ورکوي، چې شخصي عملیات د کاروونکو ځانګړي اړتیاو سره تنظیم کوي وړاندیز کوي. کارونکي کولی شي پیرامونه تنظیم کړي او پخپله د پایپ لاین ماموریت وګوري، ډاټا / ډیانې د کان کیندنې، ډایګرام لرونکی فعال، وغيره.

د ډیمو پایلې
د معلوماتو کانونه
د واردولو اړتیا
اصلي تحلیل
حواله
د ډیمو پایلې

د معلوماتو کانونه

د واردولو اړتیا

پلیټ فارم:ایلومینا، مګي
ستراتیژي:rna-seq
ترتیب: درول، پاک معلومات.
د کتابتون ډول:FR- بې خبره، FR-Forsstratrandrendrand یا Fr-دوهم ثانیې
د لوستلو اوږدوالی:150 bp
د دوتنې ډول:*. بلقه، * .FQ، *. بلیک. ګز یا * .فق.ګز. سیسټم بهپه اتوماتيک ډول د وینډوز نومونو سره مطابق فایلونه جوړه کړئ،د مثال په توګه * _1. هفورم د * ._.1.mpq سره جوړه شوی.
د نمونو شمیره:په شمیر کې هیڅ محدودیت شتون نلريد نمونو، مګر تحلیل وخت به د شمیر په توګه ډیر شينمونې وده کوي.
د سپارښتنې مقدار مقدار:په هر نمونه 6G

اصلي تحلیل
د ښاغلي آیق (حوالې) اصلي تحلیل او بایو انفارمیک وسیلېپایپ لاین په لاندې ډول دي:
1. د جوډاټا د کیفیت کنټرول:
c د ټیټ کیفیت سلسلو، ایپیپوپامو ځای،نور؛
• وسیلې: د کور دننه پایپ لاین؛
2. د حوالې ژورې ته د معلوماتو سخم:
allising د دې په مقابل کې د سپلیکس پیژندنې الفګرمیم سره لوستل کیږيجیندو.
• اوزار:Hhat2, سیمټولز
.. د کتابتون کیفیت تحلیل:
til د اوږدوالي تحلیل، ترتیب ترتیب کولو ترتیب تحلیل، او داسې نور داخل کړئ؛
• اوزار:سیمټولز;
.. د ترتیب جوړښت تحلیل:
• د بدیل ځنګلونو تحلیل، د جین جوړښت مطلوب،د ناول وړاندوینه، او نور؛
• اوزار:سټینګتی, gffcocree, ګیټک،الماس, Affroprosscanاوحمد.
5. د بیان مختلف تحلیل تحلیل:
• درجې سکرینینګ، د مرستې تحلیل، فعالبډایه کول؛
د لید کولو مختلف پایلې;
Rسرهسرګسق, DESQ2, ggptot2, dexseq
حواله
1. کیم، داوان او نور. "د ګراف پر بنسټ جینوم ساحاتو اود شات 2 او شات-جینټایپ سره جیلامي کول. "طبیعتبایو ټیکنالوژي37 (2019):: 907 - 915.
2. مالیکا، هارون او نور. "د جینیدس شنونکي شنکټیکټ: aد راتلونکي نسل DNA تحلیل کولو لپاره د میپیډیډ چوکاټد توضیحاتو ډاټا. "جیند څیړنه20 9 (2010): 1297-303.
3. لی، هیگ او نور. "د تیز منظوری / نقشه ب format ه اوسیمټولونه. "بیوینفورماتیکونه25 (2009): 2078 - 2079.
4. پیرویا، Mehaelela او نور. "سټینګتی ښه ښه کويد RNA-SEQ څخه د تذکرو بیارغونه. "طبیعتبایو ټیکنالوژي33 (2015): 290-295.
5. مینه، مایکل I. او نور. "د فولډ بدلون اعتدال اود DNA-SEQ ډیټا لپاره د RNA-SeQ ډاټا لپاره د DESQ2 سره. "جينهبیولوژي15 (2014): n. پیګ.
. ایډډي، سان آر .. "ګړندي پروفایل Hmm لټونونه."PLOS کمپیوټري بیولوژي7 (2011): n. پیګ.

نرخ ترلاسه کړئ

خپل پیغام دلته ولیکئ او موږ ته یې واستوئ

خپل پیغام موږ ته واستوئ: