ټوله جینوم ریلینینګ
د SARS-Cov-2 نظارت
نانوپور | ایلومینا | ټوله جینوم وارناوې | میټریژنومیک | rna-saq | صدر
فولټریکر ټیکنالوژیو پدې څیړنه کې د نمونې په ترتیب کې تخنیکي ملاتړ چمتو کړ.
مهم ټکي
1.سارونه - COV-2 ژبو ترتیب او د فلګنیټیک تحلیل د 35 سینګ او 4 ډالرو په شمول 35 تکثیر.
.
مهم بدلونونه
د NSP 1 کوډ کولو سیمه کې Δ500-532 د ټیټ ویښتو سره
3. پورته او سیرم کهک.
.4 د Δ500-532 تغیر سره حواله لرونکي اسپلیټونه
په ناروغۍ اخته حجرو کې ځواب.
تجربوي ډیزاین
لاسته راوړنې
1. COVID-19 د ایپیډیمولوژیک او ژومومیک سرویلانس
کلینیکي ډاټا په سیچان ولایت کې راټول شوي وو، چې د جنوري 22nd 22، 2020 پورې چین د ولایت په صفتان کې د QPVE-20 قضیې لخوا تایید شوي وو چې د ولایت څخه ووتل مرکز. په جنت کې په شیکان کې تایید شوي پیښې په ښکاره ډول، په جنوري 30 مه همدارنګه، معلومات ملاتړ کیږي چې ټولنیز ډایبونه د ویروس د خپریدو مخنیوي کې کلیدي فاکتور کیدی شي.
لومړۍ شمیره. د سیډیوان په ولایت کې د کیوډ - 19 په کرکجی زده کړه
2. سرس - COV-2 جینوم جوړونې او د مثبتو پیژندنه
د نیوکسور انډولشن سره وروسته د نانوپور ترتیب وروسته، ټولټال 310 نږدې 610 ناروغانو ته نږدې یا جزوي بشپړ شوي جنومم د نږدې 248 ناروغانو سره رامینځته شوي. 80٪ جینونه د 10 لوستلو په واسطه پوښل شوي (معنی ژور: 0.39 M په هر نمونه کې لوستل شوي).
شکل 2. په سیفوان پخولو کې د هر ډولونو فریکونسۍ
په مجموعي ډول 104 SNPs او 18 ملنډې د سرس - Cov-2 جینیمونو څخه پیژندل شوي، په کوم کې چې 31 سنپونه او 4 هیلونه د پیل شوي جنیټیکونو په توګه پیژندل شوي. د دوی په پرتله د وان څخه د 169 نمونې په پرتله کول او د 81،391 لوړ کیفیت عام عام حالت سره، 29 د 35 تنو په نورو برادینو کې موندل شوي. د پام وړ، څلور ګنده په شمول Δ500-532، ACCACONA18at او T1343c په ګډون وموندل شول چې یوازې د Whanh څخه رامینځته شوي، چې دا توپیرونه خورا بریالي شوي دي د ناروغانو سفرونه.
د اعظمي احتمال (ML) میتود او بیسیسین مالیکولر ساعت ته د نوي ویروس SFROM SIFUOUMS او 250 درملنې لپاره د نورو ویروس سکروان او 250 درملنې لپاره پروسس شوي. د Δ500-532 سره جنجالونه (د NSP 1 کوډینګ سیمه کې حذف شوي د فلوجنیټیک په ونې کې توزیع شوي. په NSP11 کې د هپولوټسپ تحلیل تحلیل له دوی څخه 5 له ډیری ښارونو څخه پیژندلي. دې پایلو وړاندیز وکړ چې دا Δ500-533 په څو ښارونو کې پیښ شوي او ممکن ډیری ځله له وان څخه وارد شي.
شکل 2. په سرس - Cov-2 جینینټ کې د تغیراتو جنیټیک توپیر او د سرلیک تحلیل
3. د کلینیکي اغیزو سره د تکراري جنیټیک اشتبایل انجمن
117 کلینیکي فینیټونه د Covid 19 شدید سره تړاو درلود، چیرې چې 19 شدید او غیر شدید ځانګړتیاو سره طبقه بندي شوې وې. د دې ځانګړتیاو تر مینځ اړیکې او 35 د بیالبیلو جنیټیک اندازه په دوه بنګار هایټس کې شتون درلود. د ګیسا په څیر درجې د بډایه کولو تحلیل ښودل شوی چې Δ500-532 په وینو کې منفي تړاو لري. سربیره پردې، د QPCR اجرا ځایونه ښودلې چې ناروغان د ویروس هاربسینګ Δ500-532 ترټولو لوړ ارزښت لري، د بیلګې په توګه ویروسي بار.
شکل 3. د کلینیکي فینوټایپونو سره د 21 پرلرینټ جینیک تکنالوژیو همکاران
.. د ویښتو اړونده کلینیکي فینټیټونو ته اعتبار
د NSP 1 دندو کې د 0050000000035353 تاثیراتو د پوهیدلو لپاره، د هیلسیمډ حجرو د بشپړ اوږدوالي، WT NSP1 څرګندول او د حذفاتو سره د متقابل شکلونو څرګندول. د درملو د WEK239T حجرو د تبادلې پروفایل د PCA تحلیلونو لپاره پروسس شوي، ښیې چې تخفیف نسبتا نږدې ځای په ځای شوي او د WT NSPS1 څخه نسبتا مختلف دي. جینونه چې په تیارو کې د پام وړ تیرې وې په زوره "د پیپټایډ بایسني / میتابولیک پروسې"، "نور حذف کول د WT څخه یو ځانګړی د پیل نمونه وښودل شوې.
شکل 4. د HEK239T حجرو په اړه د پذیز ډوللو تحلیلونه د WT NSP1 لخوا لیږدول شوي او دا د حذفاتو سره
د IFN-1 ځواب باندې د حذفاتو تاثیر هم په ډیر متوسطه مطالعه کې ازموینه شوې. ټول ازمول شوي حذفات د دې لپاره ښودل شوي و چې د ACN-1 د تذکري شوي HEK239T او د پروټین سطح کې د ټیکن - 1 ازمایښت کمولو لپاره ښودل شوي وو. په زړه پورې خبره، په ویجاړینو کې د پام وړ جریان لرونکي جینونه "ویروس جمنوم نقل" کې بډایه شوي "،" د RNA پولیمراراژره تنظیم "،".
5 شکل. په Δ5000000000000353 کې د پرله پسفیرن سیګنالونو لارې تنظیم کړئ
پدې څیړنه کې، په ویروس د توزیع کولو تاثیر نور د ویرون انتاناتو له لارې تصدیق شوي. د ځانګړو متخصصینو سره ویروسونه د کلینیکي نمونې څخه جلا شوي او د یخ-3 حجرو ته په ناروغۍ اخته شوي. د ویروس انفیکشن مطالعې ته تفصيلي پایلې په کاغذ کې لوستل کیدی شي.
ډی:10.1016 / J.chom.2021.01.015
حواله
لیت J، ټانګ سی، WII H، او نور. د SSRS-Cov -2 د NSP1 د حذف کولو ډولونه د SPRS1 تخفیف اختلال کوي چې ماډل کوي زه د مداخلي ځواب / j]. د حجرو کوربه او مایکروس، 2021.
خبرونه او مهم ټکي د تحریکلکو ټیکنالوژۍ وروستي بریالي قضیو شریکول د بیو مارکر ټیکنالوژیو سره شریکوي، د ناول عنجي لاسته راوړنې او همدارنګه د مطالعې په جریان کې لومړني تخنیکونه پلي کیږي.
د پوسټ وخت: جنوري-06-2022