د بشپړ اوږدوالي mRNA ترتیب کول -PacBio
ځانګړتیاوې
● د پولی-A mRNA څخه د cDNA ترکیب وروسته د کتابتون چمتو کول
● په CCS حالت کې ترتیب کول، د HiFi لوستلو تولید کول
● د بشپړ اوږدوالي لیږدونو ترتیب
● تحلیل د جینوم حواله ته اړتیا نلري؛ په هرصورت، دا کیدای شي کار واخیستل شي
● بایو انفارماتیک تحلیل د لیږدونو تحلیل د isoform lncRNA، جین فیوژن، پولی اډینیلیشن، او د جین جوړښت توانوي.
د خدماتو ګټې
●لوړ دقت: HiFi دقت سره لوستل کیږي> 99.9٪ (Q30)، د NGS سره پرتله کولو وړ
● د جلا جلا کولو بدیل تحلیل: د ټول نقلونو ترتیب د isoform پیژندنه او ځانګړتیا وړ کوي
●پراخه تجربه: د 1100 څخه د PacBio بشپړ اوږدوالي ټرانسکریټوم پروژې بشپړولو او له 2300 څخه زیاتو نمونو پروسس کولو تعقیب ریکارډ سره ، زموږ ټیم هرې پروژې ته د تجربې بډایه راوړي.
●د پلور وروسته ملاتړ: زموږ ژمنتیا د پروژې بشپړیدو هاخوا د 3 میاشتو پلور وروسته خدمت مودې سره غزوي. د دې وخت په جریان کې، موږ د پروژې تعقیب، د ستونزو حل کولو مرستې، او د پوښتنې او ځواب ناستې وړاندیز کوو ترڅو د پایلو پورې اړوند کومې پوښتنې حل کړي.
د نمونې اړتیاوې او تحویلي
| کتابتون | د ترتیب کولو ستراتیژي | د معلوماتو سپارښتنه | د کیفیت کنټرول |
| PolyA بډایه mRNA CCS کتابتون | د PacBio سیکویل II PacBio Revio | 20/40 جي بي 5/10 M CCS | Q30≥85% |
د نمونې اړتیاوې:
نیوکلیوټایډونه:
● نباتات:
ریښه، ډډ یا پاڼی: 450 ملی ګرامه
پاڼی یا تخم: 300 ملی ګرامه
ميوه: 1.2 ګرامه
● حیوانات:
زړه یا کولمو: 300 ملی ګرامه
ویزرا یا دماغ: 240 ملی ګرامه
عضلات: 450 mg
هډوکي، ویښتان یا پوستکي: 1 ګرامه
● ارتروپډونه:
حشرات: 6g
Crustacea: 300 mg
● ټوله وینه: 1 ټیوب
● حجرې: 106 حجرې
| Conc.(ng/μl) | مقدار (μg) | پاکوالی | بشپړتیا |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 محدود یا هیڅ پروټین یا DNA ککړتیا په جیل کې ښودل شوي. | د نباتاتو لپاره: RIN≥7.5؛ د څارویو لپاره: RIN≥8.0؛ 5.0≥ 28S/18S≥1.0; محدود یا هیڅ اساسی لوړوالی |
وړاندیز شوي نمونې تحویلي
کانټینر: 2 ملی لیتر سینټرفیوج ټیوب (د ټین ورق سپارښتنه نه کیږي)
د نمونې لیبل کول: ګروپ + نقل کول لکه A1, A2, A3; B1، B2، B3.
بار وړل:
1. وچه یخ: نمونې باید په کڅوړو کې بسته شي او په وچه یخ کې ښخ شي.
2. د RNAstable ټیوبونه: د RNA نمونې د RNA ثبات ټیوب کې وچې کیدی شي (د بیلګې په توګه RNAstable®) او د خونې په حرارت درجه کې لیږدول کیدی شي.
د خدمت کاري جریان
د تجربې ډیزاین
د نمونې سپارل
د RNA استخراج
د کتابتون جوړول
ترتیب کول
د معلوماتو تحلیل
د پلور وروسته خدمتونه
لاندې تحلیلونه شامل دي:
● د خامو معلوماتو کیفیت کنټرول
● د بدیل پولیډینیلیشن تحلیل (APA)
● د فیوژن لیږد تحلیل
● د جلا جلا کولو بدیل تحلیل
● د یونیورسل واحد کاپي آرتولوګس (BUSCO) تحلیل بینچ مارکینګ
● د ناول لیږد تحلیل: د کوډ کولو ترتیب وړاندوینه (CDS) او فعال تشریح
● lncRNA تحلیل: د lncRNA او هدفونو وړاندوینه
● د مایکرو سټیلایټ پیژندنه (SSR)
د BUSCO تحلیل
د بدیل جلا کولو تحلیل
د بدیل پولیډینیلیشن تحلیل (APA)
د ناول لیکونو فعالیتي تشریح
په دې ځانګړې خپرونه کې د BMKGene د نانوپور بشپړ اوږدوالي mRNA ترتیب کولو خدماتو لخوا چمتو شوي پرمختګونه وپلټئ.
ما، Y. et al. (2023) 'د Nemopilema Nomurai زهر پیژندنې لپاره د PacBio او ONT RNA ترتیب کولو میتودونو مقایسه تحلیل'، جینومکس، 115(6)، مخ. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
چاو، Q. et al. (2019) 'د پاپولس سټیم ټرانسکریټوم پرمختیایی تحرک'، د نبات بایو ټیکنالوژۍ ژورنال، 17(1)، مخونه 206-219. doi: 10.1111/PBI.12958.
ډینګ، ایچ او نور. (2022) 'د ایکټینیډیا لاتیفولیا (د اسکاربیټ بډایه میوو فصل) د میوو د ودې او پخیدو پرمهال د اسکاربیک اسید مینځپانګې کې متحرک بدلونونه او د مالیکولر ساینس نړیوال ژورنال ، 23 (10) ، مخ. 5808. doi: 10.3390/IJMS23105808/S1.
Hua، X. et al. (2022) 'په پاریس پولیفیلا کې د بایو اکټیو پولیفیلین کې د بایو سینتیټیک لارې جینونو مؤثره وړاندوینه'، د مخابراتو بیولوژي 2022 5:1، 5(1)، مخونه 1-10. doi: 10.1038/s42003-022-03000-z.
لیو، ایم او نور. (2023) 'د PacBio Iso-Seq او Illumina RNA-Seq ګډ تحلیل د توتا مطلق (میریک) ټرانسکریټوم او سایټوکروم P450 جینز'، حشرات، 14 (4)، مخ. 363. doi: 10.3390/INSECTS14040363/S1.
وانګ، Lijun et al. (2019) 'د PacBio واحد مالیکول ریښتیني وخت تحلیل په کارولو سره د ټرانسکریټوم پیچلتیا یوه سروې چې په Ricinus communis کې د ricinoleic acid biosynthesis د ښه پوهیدو لپاره د Illumina RNA ترتیب سره یوځای کیږي'، BMC جینومکس، 20(1)، pp. 1-17. doi: 10.1186/S12864-019-5832-9.
