مقایسه جینومکس
د خدماتو ګټې
●پراخه تجربه او د خپرولو ریکارډونه: د جمع کولو سره، BMKGene د 90 پرتله کولو جینومیک پروژې بشپړې کړې، د مجموعي اغیزې فکتور سره 900 ته رسیدلي.
●د بایو انفارماتیک جامع تحلیل: د تحلیلونو کڅوړه اته خورا عام اړین تحلیلونه لري چې د خپرولو لپاره ښه ډیزاین شوي ارقام چمتو کوي او د پایلو اسانه تفسیر ته اجازه ورکوي.
●د لوړ مهارت لرونکي بایو انفارماتیک ټیم او د لنډ تحلیل دورې: د نسبي جینومیک تحلیل کې د عالي تجربې سره ، د BMKGene ټیم په لنډ وخت کې د مختلف شخصي تحلیل غوښتنې پوره کوي
●د پلور وروسته ملاتړ:زموږ ژمنتیا د پروژې بشپړیدو هاخوا د 3 میاشتو پلور وروسته خدمت مودې سره غزوي. د دې وخت په جریان کې، موږ د پروژې تعقیب، د ستونزو حل کولو مرستې، او د پوښتنې او ځواب ناستې وړاندیز کوو ترڅو د پایلو پورې اړوند کومې پوښتنې حل کړي.
د خدماتو مشخصات
| اټکل شوی د بدلون وخت | د ډولونو شمیر | تحلیل کوي |
| 30 کاري ورځې | ۶ - ۱۲ | د جین کورنۍ کلستر کول د جین کورنۍ پراختیا او انقباض Phylogenetic د ونې جوړول د انحراف وخت اټکل (فوسیل کیلیبریشن ته اړتیا ده) د LTR داخلولو وخت (د نباتاتو لپاره) د بشپړ جینوم نقل (د نباتاتو لپاره) انتخابي فشار د ترکیب تحلیل |
بایو انفارماتیک تحلیلونه
● د جین کورنۍ
● Phylogenetics
● د انحراف وخت
● انتخابي فشار
● د ترکیب تحلیل
د نمونې اړتیاوې او تحویلي
د نمونې اړتیاوې:
نسج یا DNA د جینوم ترتیب او راټولولو لپاره
د نسج لپاره
| ډولونه | نسج | سروې | PacBio CCS |
| څاروی | عصبي نسج | 0.5 ~ 1 ګرامه | ≥ 3.5 ګرامه |
| د عضلاتو نسج | |||
| ≥ 5.0 ګرامه | |||
| ≥ 5.0 ملی لیتر | |||
| د تی لرونکو وینه | |||
| ≥ 0.5 ملی لیتر | |||
| د چرګانو / کبانو وینه | |||
| نبات | تازه پاڼي | 1 ~ 2 ګرامه | ≥ 5.0 ګرامه |
| پاڼی/ ډډ | 1 ~ 2 ګرامه | ≥ 10.0 ګرامه | |
| ريښه/تخم | 1 ~ 2 ګرامه | ≥ 20.0 ګرامه | |
| حجرې | کلتوري حجره | - | ≥ 1 x 108 |
ډاټا
د جینوم ترتیب فایلونه (.fasta) او د تشریح فایلونه (.gff3) د نږدې اړوند ډولونو
د خدمت کاري جریان
د تجربې ډیزاین
د نمونې سپارل
د کتابتون جوړول
ترتیب کول
د معلوماتو تحلیل
د پلور وروسته خدمتونه
*د ډیمو پایلې دلته ښودل شوي ټول د بایومارکر ټیکنالوژیو سره خپاره شوي جینومونو څخه دي
1. د LTR داخلولو وخت اټکل: دا ارقام د نورو ډولونو په پرتله په وینینګ رائی جینوم کې د LTR-RTs داخلولو وختونو کې یو ځانګړی بایموډال ویش ښودل شوی. تر ټولو وروستۍ څوکه شاوخوا 0.5 ملیون کاله وړاندې ښکاره شوه.
لي ګوانګ او نورد طبیعت جینیات، 2021
2. د چایوټ (Sechium edule) په اړه د فیلوجیني او جین کورنۍ تحلیل : د چایوټ او د جین په کورنۍ کې د نورو 13 اړوندو ډولونو تحلیل کولو سره، چایوټ د مارانو (Trichosanthes anguina) سره خورا نږدې تړاو درلود. چایوټ د 27-45 Mya په شاوخوا کې د سانپ له غوښې څخه اخیستل شوی او ټول جینوم نقل (WGD) په 25±4 Mya کې په چایوټ کې لیدل شوی، چې په ccuibitaceae کې د WGD دریمه پیښه ده.
فو او نور.د باغدارۍ څیړنه، 2021
3. Synteny شننه: د میوو په وده کې د فایټو هورمونونو پورې اړوند ځینې جینونه په چایوټو، مارانو او اسکواش کې موندل شوي. د چایوټ او اسکواش تر مینځ اړیکه د چایوټ او مارغانو تر مینځ یو څه لوړه ده.
فو او نور.د باغدارۍ څیړنه، 2021
4. د جین کورنۍ تحلیل: په G.thurberi او G.davidsonii جینومونو کې د جین کورنۍ پراختیا او انقباض په اړه د KEGG بډایه کول وښودله چې د سټرایډ بایوسینتیسز او براسینوسټرایډ بایوسینتیز پورې اړوند جینونه پراخ شوي.
Yang Z et al.BMC بیولوژي، 2021
5. د بشپړ جینوم نقل کولو تحلیل: د 4DTV او Ks توزیع تحلیل د جینوم د نقل کولو ټوله پیښه ښودلې. د intraspecies لوړوالی د نقل پیښې ښودل شوي. د انواعو د ځنځیرونو لوړوالی د ځانګړتیاوو پیښې ښودل شوي. تحلیل په ډاګه کړه چې د نورو دریو نږدې ډولونو سره پرتله کول، O. europaea په دې وروستیو کې په لویه پیمانه د جین نقل کولو څخه تیریږي.
راو جی او نور.د باغدارۍ څیړنه، 2021
د BMK قضیه
ګلاب پرته له ټوټو څخه: جینومیک بصیرت د رطوبت موافقت سره تړاو لري
خپور شوی: د ملي ساینس بیاکتنه، 2021
د ترتیب کولو تګلاره:
بسیبې رنګه' (آر.ویچورینانجینوم:
نږدې 93 X PacBio + نږدې. 90 ایکس نانوپور + 267 ایکس ایلومینا
کلیدي پایلې
1. د لوړ کیفیت R.wichuraiana جینوم د اوږده لوستلو ترتیب کولو تخنیکونو په کارولو سره جوړ شوی، کوم چې د 530.07 Mb اسمبلۍ تولیدوي (د اټکل شوي جینوم اندازه نږدې 525.9 Mb د فلو سایټومیټري او 525.5 د جینوم سروې له مخې شاوخوا 31.0٪ وه). د BUSCO اټکل شوی نمره 93.9٪ وه. د "زاړه بلش" (haploOB) سره پرتله کول، د دې جینوم کیفیت او بشپړتیا د اساس واحد اساس دقت او د LTR اسمبلی شاخص (LAI = 20.03) لخوا تایید شوی. R.wichuraiana جینوم 32,674 پروټین کوډینګ جینونه لري.
2. د ملټي اومکس ګډ تحلیل، چې د نسبي جینومیکونو، ټرانسکرټومیکونو، د جنیتیک نفوس QTL تحلیلونو څخه جوړ دی، د R. wichuraiana او Rosa chinensis ترمنځ مهم ځانګړتیا څرګنده کړه. همدارنګه، په QTL کې د اړونده جینونو د بیان توپیر ممکن د ډډ ډبرې نمونې سره تړاو ولري.
د Basyes Thornless او Rosa chinensis تر منځ مقایسه جینومیک تحلیل په شمول د ترکیب تحلیل، د جین کورنۍ کلستر، پراختیا او انقباض تحلیل، لوی شمیر توپیرونه په ګوته کړل، کوم چې په ګلاب کې د مهمو ځانګړتیاوو سره تړاو لري. په NAC او FAR1/FRS جین کورنۍ کې بې ساري پراخوالی د تور ځای په وړاندې مقاومت سره تړلی و.
د BT او haploOB جینومونو ترمنځ مقایسه جینومیک تحلیل.
ژونګ، ایم، او نور. "بې له ټوټو ګلاب: جینومیک بصیرت د رطوبت موافقت سره تړاو لري"د ملي ساینس بیاکتنه، 2021؛، nwab092.
