BMKMANU S3000_Spatial Transscriptome
BMKMANU S3000 د ځایی ټرانسکریټوم تخنیکي سکیم
ځانګړتیاوې
- حل: 3.5 µM
- د ځای قطر: 2.5 µM
- د ځایونو شمیر: نږدې 4 ملیون
- د 3 ممکنه نیول شوي ساحې شکلونه: 6.8 mm * 6.8 mm، 11 mm * 11 mm یا 15 mm * 20 mm
- هر بارکوډ شوی مالګه د پریمرونو سره بار شوې چې له 4 برخو څخه جوړه شوې ده:
• پولی (dT) دم د mRNA پریمینګ او cDNA ترکیب لپاره،
• ځانګړی مالیکولر پیژندونکی (UMI) د امپلیفیکیشن تعصب سمولو لپاره
• ځایی بارکوډ
• د جزوي لوستلو 1 ترتیب کولو پرائمر پابند ترتیب
- H&E او د برخو فلوروسینټ داغ
- د حجرو د قطع کولو ټیکنالوژۍ کارولو امکان: د H&E داغونو ادغام ، فلوروسینټ سټینینګ ، او د RNA تسلسل ترڅو د هرې حجرې حدود وټاکي او هر حجرې ته د جین څرګندونه په سمه توګه وټاکي. د سیل بن پر بنسټ د لاندې جریان ځایي پروفایل تحلیل پروسس کول.
- د څو درجې ریزولوشن تحلیل ترلاسه کولو امکان: د انعطاف وړ څو کچې تحلیل له 100um څخه تر 3.5 um پورې پورې اړه لري ترڅو په غوره ریزولوشن کې متنوع نسجونه حل کړي.
د BMKMANU S3000 ګټې
-د نیول ځایونو دوه چنده کول 4 ملیون ته: د 3.5 uM د ښه ریزولوشن سره، په هر حجره کې د لوړ جین او UMI کشف لامل کیږي. دا د انتقالي پروفایلونو پراساس د حجرو ښه کلستر کولو پایله لري، د ښه توضیحاتو سره چې د نسج جوړښت سره سمون لري.
- فرعي سیلولر حل:په هر نیول شوي ساحه کې د 2 ملیون ځایي بارکوډ شوي ځایونه شتون لري چې د 2.5 µm قطر سره او د ځای مرکزونو ترمینځ 5 µm فاصله لري ، د فرعي سیلولر ریزولوشن (5 µm) سره د ځایي ټرانسکریټوم تحلیل فعالوي.
-د څو کچې حل تحلیل:د انعطاف وړ څو درجې تحلیلونه د 100 μm څخه تر 5 μm پورې د مختلف نسجونو ځانګړتیاو په غوره حل کې حل کولو لپاره.
-د "درې په یوه سلایډ کې" د حجرو ویشلو ټیکنالوژۍ کارولو امکان:په یو سلایډ کې د فلوروسینس سټینینګ ، H&E سټینینګ ، او RNA تسلسل سره یوځای کول ، زموږ د "درې په یوه کې" تحلیل الګوریتم د راتلونکو حجرو پراساس ټرانسکرټومیکونو لپاره د حجرو حدود پیژندلو ته ځواک ورکوي.
-د ډیری ترتیب کولو پلیټ فارمونو سره مطابقت لري: دواړه NGS او اوږد لوستل شوي ترتیب شتون لري.
-د 1-8 فعال نیول ساحې انعطاف وړ ډیزاین: د نیول شوي ساحې اندازه انعطاف وړ ده، د 3 شکلونو کارولو امکان لري (6.8 mm * 6.8 mm.، 11 mm * 11 mm او 15 mm * 20 mm)
-یو بند خدمت: ټول تجربه او د مهارت پر بنسټ مرحلې مدغم کوي، پشمول د کریو سیکشن کول، داغونه، د نسج اصلاح کول، ځایي بارکوډینګ، د کتابتون چمتو کول، ترتیب کول، او بایو انفارمیټکس.
-جامع بایو انفارماتیک او د کاروونکي دوستانه پایلو لید:په بسته کې 29 تحلیلونه او 100+ لوړ کیفیت لرونکي ارقام شامل دي، د کور جوړ شوي سافټویر کارولو سره یوځای د حجرو ویشلو او د ځای کلستر کولو لید او دودیز کولو لپاره.
-د شخصي معلوماتو تحلیل او لید: د مختلفو څیړنو غوښتنو لپاره شتون لري
-د لوړ مهارت تخنیکي ټیم: د انسان، موږک، تی لرونکي، کب او نباتاتو په شمول د 250 څخه ډیر نسج ډولونو او 100+ ډولونو کې تجربه سره.
-په ټوله پروژه کې ریښتیني وخت تازه معلومات: د تجربوي پرمختګ بشپړ کنټرول سره.
-د واحد حجرې mRNA ترتیب سره اختیاري ګډ تحلیل
د خدماتو مشخصات
| د نمونې اړتیاوې | کتابتون | د ترتیب کولو ستراتیژي | ډاټا وړاندیز شوی | د کیفیت کنټرول |
| د OCT- ایمبیډ شوي کریو نمونې (غوره قطر: نږدې. 6×6×6 mm³) په هر نمونه کې 2 بلاکونه 1 د تجربې لپاره، 1 د بیک اپ لپاره | S3000 cDNA کتابتون | Illumina PE150 | 160K PE لوستل په هر 100υM (250 Gb) کې | RIN > 7 |
د نمونې چمتو کولو لارښود او د خدماتو کاري فلو په اړه د نورو جزیاتو لپاره ، مهرباني وکړئ وړیا خبرې وکړئ a سرهد BMKGENE متخصص
د خدمت کاري جریان
د نمونې د چمتو کولو په مرحله کې، د RNA د استخراج لومړنۍ ازموینه ترسره کیږي ترڅو ډاډ ترلاسه شي چې د لوړ کیفیت RNA ترلاسه کیدی شي. د نسج اصلاح کولو مرحله کې برخې داغ شوي او لیدل کیږي او د نسج څخه د mRNA خوشې کیدو لپاره د پارمیابیل کولو شرایط غوره شوي. مطلوب پروتوکول بیا د کتابتون جوړولو په جریان کې پلي کیږي، وروسته د ترتیب او ډاټا تحلیل.
د بشپړ خدمت کاري فلو کې د ریښتیني وخت تازه معلومات او د پیرودونکي تاییدات شامل دي ترڅو د ځواب ویونکي فیډبیک لوپ وساتي ، د پروژې اسانه اجرا کول ډاډمن کړي.
د BMKMANU S3000 لخوا تولید شوي ډاټا د "BSTMatrix" سافټویر په کارولو سره تحلیل کیږي، کوم چې په خپلواکه توګه د BMKGENE لخوا ډیزاین شوی، د حجرو کچه او څو اړخیزه ریزولوشن جین ایکسپریشن میټریکس تولیدوي. له هغه ځایه، یو معیاري راپور رامینځته کیږي چې پکې د معلوماتو کیفیت کنټرول، داخلي نمونې تحلیل او د بین ګروپ تحلیل شامل دي.
- د معلوماتو کیفیت کنټرول:
- د معلوماتو محصول او د کیفیت نمرې ویش
- په هر ځای کې د جین کشف
- د نسج پوښښ
- د داخلي نمونې تحلیل:
- د جینونو بډایه
- د ځای کلستر کول، په شمول د کم شوي ابعاد تحلیل
- د کلسترونو تر مینځ د توپیر بیان تحلیل: د مارکر جینونو پیژندنه
- د مارکر جینونو فعال تشریح او بډایه کول
- د ډله ایز تحلیل
- د دواړو نمونو څخه د ځایونو بیا ترکیب (د بیلګې په توګه ناروغ او کنټرول) او بیا کلستر
- د هر کلستر لپاره د مارکر جینونو پیژندنه
- د مارکر جینونو فعال تشریح او بډایه کول
- د ګروپونو ترمنځ د ورته کلستر توپیر څرګندول
سربیره پردې ، د BMKGene رامینځته شوی "BSTViewer" د کارونکي دوستانه وسیله ده چې کارونکي ته دا وړتیا ورکوي چې د جین بیان او په مختلف ریزولوشنونو کې د کلستر کولو ځای وګوري.
BMKGene د ځایی پروفایل کولو خدمتونه په دقیق واحد سیل ریزولوشن کې وړاندې کوي (د سیل بن یا څو لیول مربع بن له 100um څخه تر 3.5um پورې).
د S3000 سلایډ کې د نسج برخو څخه د ځایي پروفایل کولو ډاټا په لاندې ډول ښه ترسره شوي.
د قضیې مطالعه 1: د موږک مغز
د S3000 سره د موږک دماغ برخې تحلیل په پایله کې د ~ 94 000 حجرو پیژندلو سره، په هر حجره کې د 2000 جینونو منځنۍ ترتیب سره. د 3.5 uM ښه ریزولوشن په پایله کې د انتقالي نمونو پراساس د حجرو خورا مفصل کلسترینګ رامینځته شوی ، د حجرو کلسترونه د دماغ مختلف جوړښتونو سره تقلید کوي. دا په اسانۍ سره د oligodendrocytes او مایکروګلیا حجرو په توګه د کلستر شوي حجرو ویش لیدلو سره لیدل کیږي، کوم چې تقریبا په ځانګړي ډول په خړ او سپینه ماده کې موقعیت لري.
د قضیې مطالعه 2: د موږک جنین
د S3000 سره د موږک جنین برخې تحلیل د ~ 2200 000 حجرو پیژندلو پایله درلوده، په هر حجره کې د 1600 جینونو منځنۍ ترتیب سره. د 3.5 uM ښه ریزولوشن په پایله کې د انتقالي نمونو پراساس د حجرو خورا مفصل کلسترینګ رامینځته شوی ، د سترګو په ساحه کې 12 کلسترونه او د دماغ په ساحه کې 28 کلسترونه.
د داخلي نمونې تحلیلي حجرې کلستر کول:
د مارکر جین پیژندنه او ځایی ویش:
- د لوړ فرعي سیلولر ریزولوشن: د S1000 سلایډ سره پرتله کول، د S3000 هر نیول شوي ساحه کې د 4 ملیون ځایي بارکوډ شوي ځایونه شتون لري چې د 2.5 µm قطر او د ځای مرکزونو ترمینځ 3.5 µm فاصله لري ، د لوړ فرعي سیلولر ریزولوشن سره د ځایي ټرانسکریټوم تحلیل فعالوي. (مربع بن: 3.5 µm).
- د لوړ نیول موثریت: د S1000 سلایډ په پرتله ، میډیان_UMI له 30٪ څخه 70٪ ته زیاتوالی ، میډیان_جین له 30٪ څخه 60٪ ته زیاتوالی
د S1000 چپ سکیم:
د S3000 چپ سکیم:
