Zintegrowane podejścia do analizy mikrobiomu
- Od ekstrakcji kwasów nukleinowych po technologie sekwencjonowania
Wysokoprzepustowe badania sekwencjonowania społeczności drobnoustrojów stały się powszechne i znacznie pogłębiły naszą wiedzę na temat mikrobiomu ludzkiego, środowiskowego i zwierzęcego.
Podczas tego seminarium internetowego Ana Vila-Santa, specjalistka ds. zastosowań terenowych w firmie Biomarker Technologies, omawia dwie podstawowe metody sekwencjonowania kluczowe w badaniach nad mikrobiomami: sekwencjonowanie amplikonu i metagenomika typu shotgun. Prowadzi nas przez analizę porównawczą technologii sekwencjonowania krótkiego odczytu (np. Illumina) i długiego odczytu (np. Nanopore, PacBio), oceniając ich skuteczność w kontekście różnych celów badania.
Następnie dr Cui, menedżer produktu zespołu ds. rynków eksportowych TIANGEN, przechodzi do udoskonaleń w zakresie zautomatyzowanych rozwiązań do ekstrakcji kwasów nukleinowych. Bada zasady, metody i wyzwania związane z próbkami mikroorganizmów, czego kulminacją jest wprowadzenie najnowocześniejszej platformy do automatycznej ekstrakcji kwasów nukleinowych (NAE). Dr Cui szczegółowo omawia kompleksowe rozwiązanie TIANGEN do przygotowywania próbek i analizy kwasów nukleinowych w badaniach mikrobiomu, uwzględniając przyszłe wyzwania i ulepszenia.