Wydajność różnych technologii sekwencjonowania w rozwiązywaniu metagenomiki.
W tym wykładzie przedstawia zastosowania różnych technologii sekwencjonowania w zrozumieniu mikrobiomu, w tym ich technicznych przepływów pracy, wydajności i niektórych studiów przypadków. Rozmowa obejmie następujące aspekty:
● Ogólne wprowadzenie do aktualnych metod profilowania mikrobiomów
● Sekwencjonowanie metabarcodowania oparte na amplikonie: od przygotowania próbki do interpretacji danych
● Czego jeszcze możemy się spodziewać po metabarcodingu: sekwencjonowanie amplikonu oparte na PACBIO
● Sekwencjonowanie metagenomu w palence strzałowej dla bardziej kompleksowego widoku genów funkcjonalnych
● Sekwencjonowanie metagenomu oparte na nanoporach