Exclusive Agency for Korea

Baner-03

Produkty

Sekwencjonowanie całego egzomu człowieka

Sekwencjonowanie całego egzomu człowieka (hWES) jest powszechnie uznawane za opłacalne i skuteczne podejście do sekwencjonowania umożliwiające dokładne określenie mutacji chorobotwórczych. Eksony, mimo że stanowią jedynie około 1,7% całego genomu, odgrywają kluczową rolę, bezpośrednio odzwierciedlając profil funkcji białek całkowitych. Warto zauważyć, że w ludzkim genomie ponad 85% mutacji związanych z chorobami objawia się w regionach kodujących białka. BMKGENE oferuje kompleksową i elastyczną usługę sekwencjonowania całego egzonu ludzkiego z dwiema różnymi strategiami przechwytywania eksonów, dostępnymi w celu spełnienia różnych celów badawczych.


Szczegóły usługi

Wyniki demonstracyjne

Funkcje usługi

● Dostępne są dwa panele egzomów oparte na wzbogacaniu obiektów docelowych sondami: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) i xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

● Sekwencjonowanie na Illumina NovaSeq.

● Potok bioinformatyczny ukierunkowany na analizę chorób lub analizę nowotworów.

Zalety serwisu

Celuje w region kodujący białko: Wychwytując i sekwencjonując regiony kodujące białka, hWES wykorzystuje się do ujawniania wariantów związanych ze strukturą białka.

Opłacalne:hWES daje około 85% mutacji związanych z chorobami ludzkimi z 1% ludzkiego genomu.

Wysoka dokładność: Dzięki dużej głębokości sekwencjonowania hWES ułatwia wykrywanie zarówno powszechnych wariantów, jak i rzadkich wariantów z częstotliwościami niższymi niż 1%.

Rygorystyczna kontrola jakości: Wdrażamy pięć podstawowych punktów kontroli na wszystkich etapach, od przygotowania próbek i bibliotek po sekwencjonowanie i bioinformatykę. To skrupulatne monitorowanie zapewnia niezmiennie wysoką jakość wyników.

Kompleksowa analiza bioinformatyczna: nasz plan wykracza poza identyfikację zmian w genomie referencyjnym, ponieważ obejmuje zaawansowaną analizę zaprojektowaną specjalnie w celu odpowiedzi na pytania badawcze związane z genetycznymi aspektami chorób lub analizą nowotworów.

Wsparcie posprzedażowe:Nasze zaangażowanie wykracza poza realizację projektu i obejmuje 3-miesięczny okres obsługi posprzedażnej. W tym czasie oferujemy monitorowanie projektu, pomoc w rozwiązywaniu problemów oraz sesje pytań i odpowiedzi, aby odpowiedzieć na wszelkie pytania związane z wynikami.

Przykładowe specyfikacje

Strategia przechwytywania egzonów

Strategia sekwencjonowania

Zalecane wyjście danych

Sure Select Human All Exon v6 (Agilent)

lub panel hybrydyzacyjny xGen Exome v2 (IDT)

 

Illumina NovaSeq PE150

5–10 Gb

W przypadku zaburzeń mendlowskich/rzadkich chorób: > 50x

Dla próbek nowotworu: ≥ 100x

Przykładowe wymagania

Typ próbki

 

 Kwota(Qubit®)

 

Stężenie 

Tom

 

 

 Czystość (NanoDrop™)

 

Genomowe DNA

 

≥ 50 ng
≥ 6 ng/µl
≥ 15 µl
 
OD260/280=1,8-2,0
 
bez degradacji i bez zanieczyszczeń

 

Bioinformatyka

WES_BI przepływ pracy_Disease-01

Analiza bioinformatyczna próbek z chorobą hWES obejmuje:

● Kontrola jakości danych sekwencjonowania

● Referencyjne dopasowanie genomu

● Identyfikacja SNP i InDels

● Adnotacja funkcjonalna SNP i InDels

WES_BI przepływ pracy_Tumor-01

Analiza bioinformatyczna próbek nowotworu obejmuje:

● Kontrola jakości danych sekwencjonowania

● Referencyjne dopasowanie genomu

● Identyfikacja SNP, InDels i odmian somatycznych

● Identyfikacja wariantów linii zarodkowej

● Analiza sygnatur mutacji

● Identyfikacja genów napędowych w oparciu o mutacje polegające na wzmocnieniu funkcji

● Adnotacja o mutacji na poziomie wrażliwości na lek

● Analiza heterogeniczności – obliczenie czystości i ploidalności

Przebieg prac serwisowych

dostawa próbek

Dostawa próbek

Eksperyment pilotażowy

Ekstrakcja DNA

Przygotowanie biblioteki

Budowa biblioteki

Sekwencjonowanie

Sekwencjonowanie

Analiza danych

Analiza danych

数据上传-01

Dostarczanie danych

Usługi posprzedażowe

Usługi posprzedażowe


  • Poprzedni:
  • Następny:

  • Data QC – statystyki przechwytywania egzomu

     

    wps_doc_22

     

    Identyfikacja wariantu – InDels

    36

    Zaawansowana analiza: identyfikacja i dystrybucja szkodliwych SNP/InDels – wykres Circos

     

    37

    Analiza nowotworu: identyfikacja i rozkład mutacji somatycznych – wykres Circos

     

    38

     

    Analiza nowotworu: linie klonalne

     

    39

     

    uzyskać wycenę

    Napisz tutaj swoją wiadomość i wyślij ją do nas

    Wyślij do nas wiadomość: