Eukariotyczne sekwencjonowanie mRNA-NG
Cechy
● Schwytanie mRNA Poly przed przygotowaniem biblioteki
● Opcjonalne przygotowanie biblioteki kierunkowej mRNA, aby umożliwić uzyskanie danych sekwencjonowania specyficznych dla nici
● Analiza bioinformatyczna ekspresji genów i struktury transkryptu
Zalety
●Rozległa wiedza specjalistyczna: Nasz zespół przetworzył ponad 600 000 próbek w BMKGENE, obejmując różnorodne typy próbek, takie jak kultury komórkowe, tkanki i płyny ustrojowe. W każdym projekcie wprowadzamy bogate doświadczenie i pomyślnie ukończyliśmy ponad 100 000 projektów sekwencyjnych mRNA w różnych dziedzinach badań.
●Rygorystyczna kontrola jakości: Wdrażamy podstawowe punkty sterowania na wszystkich etapach, od przygotowania próbek i biblioteki po sekwencjonowanie i bioinformatykę. To skrupulatne monitorowanie zapewnia dostarczanie konsekwentnie wysokiej jakości wyników, zapewniając, że Twój projekt jest w wiarygodnych rękach.
●Kompleksowa adnotacja: Używamy wielu baz danych do funkcjonalnego adnotacji genów o różnej ekspresji (DEG) i przeprowadzania odpowiednich analiz wzbogacania. To kompleksowe podejście zapewnia wgląd w procesy komórkowe i molekularne leżące u podstaw reakcji transkryptomu, zapewniając w pełni poinformowanie o wynikach projektu.
●Wsparcie po sprzedaży: Nasze zobowiązanie wykracza poza zakończenie projektu z 3-miesięcznym okresem usług po sprzedaży. W tym czasie oferujemy obserwację projektu, pomoc w rozwiązywaniu problemów oraz sesje pytań i odpowiedzi, aby rozwiązać wszelkie zapytania związane z wynikami.
Przykładowe wymagania i dostawa
| Biblioteka | Strategia sekwencjonowania | Zalecane dane | Kontrola jakości |
| Poli A wzbogacony | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 GB | Q30 ≥85% |
Przykładowe wymagania:
Nukleotydy:
| Conc. (Ng/μl) | Ilość (μg) | Czystość | Uczciwość | |
| Standardowa biblioteka | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Ograniczone lub brak zanieczyszczenia białka lub DNA pokazanego na żelu. | Dla roślin: rin ≥4,0; Dla zwierząt: rin ≥4,5; 5.0 ≥28S/18S ≥1,0; Ograniczona lub brak wyjściowej wzniesienia |
| Biblioteka kierunkowa | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Ograniczone lub brak zanieczyszczenia białka lub DNA pokazanego na żelu. | Dla roślin: rin ≥4,0; Dla zwierząt: rin ≥4,5; 5.0 ≥28S/18S ≥1,0; Ograniczona lub brak wyjściowej wzniesienia |
● Rośliny:
Korzeń, łodyga lub płatek: 450 mg
Liść lub nasiona: 300 mg
Owoce: 1,2 g
●Zwierzę:
Serce lub jelita: 300 mg
Wnętrzności lub mózg: 240 mg
Mięsień: 450 mg
Kości, włosy lub skóra: 1G
● Stawonogi:
Owady: 6G
Crustacea: 300 mg
● Cała krew: 1 rurka
● Komórki: 106 komórki
Zalecana dostawa próbki
Pojemnik: 2 ml rurki wirówki (folia cyny nie jest zalecana)
Etykietowanie przykładowe: grupa+replikuj EG A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Wysyłka:
1. Suche ice: Próbki należy pakować w torby i zakopane w suchym lodzie.
2. RNA RNA: Próbki RNA można wysuszyć w rurce stabilizacji RNA (np. Rnastable®) i wysyłania w temperaturze pokojowej.
Przepływ pracy usług
Projekt eksperymentu
Dostawa próbki
Ekstrakcja RNA
Konstrukcja biblioteki
Sekwencjonowanie
Analiza danych
Usługi po sprzedaży
Bioinformatyka
Eukariotyczny Analiza sekwencjonowania mRNA przepływ pracy
Bioinformatyka
ØSurowa kontrola jakości danych
ØWyrównanie genomu odniesienia
ØAnaliza struktury transkrypcji
ØKwantyfikacja ekspresji
ØAnaliza różnicowa
ØAdnotacja funkcji i wzbogacenie
Wyrównanie genomu odniesienia
Nasycenie danych
Korelacja próbki i ocena powtórzeń biologicznych
Geny o różnej ekspresji (DEG)
Funkcjonalna adnotacja DEG
Funkcjonalne wzbogacenie DEG
Przeglądaj postępy ułatwione przez eukariotyczne usługi sekwencjonowania MRNA BMKGENE w celu wyselekcjonowanego zbioru publikacji.
Huang, L. i in. (2023) „Triclosan i triklocarban osłabiają zdolność węchową złotej rybki poprzez ograniczenie rozpoznawania zapachu, zakłócanie transdukcji sygnału węchowego i zakłócające przetwarzanie informacji o węchu”, Water Research, 233, s. 1. 119736. Doi: 10.1016/j.watres.2023.119736.
Jia, LJ i in. (2023) „Aspergillus fumigatus porusza ludzki P11, aby przekierować fagosomy zawierające grzyb do szlaku niezarodnego”, Host Cell i Microbe, 31 (3), s. 373-388.e10. doi: 10.1016/j.chom.2023.02.002.
Jin, K. i in. (2022) „Czynniki transkrypcyjne TCP zaangażowane w opracowywanie pędów MA Bamboo (Dendrocalamus latiflorus munro)”, Frontiers in Plant Science, 13, s. 1. 884443. Doi: 10.3389/fpls.2022.884443/bibtex.
Wen, X. i in. (2022) „Genom chryzantemu lavandulifolium i mechanizm molekularny leżący u podstaw różnorodnych rodzajów kapitulum”, Horticulture Research, 9. DOI: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie i in. (2023) „Nanoreaktor kaskadowy do poprawy terapii synodynamicznej na raka jelita grubego poprzez synergiczne rozszerzenie ROS i blokadę autofagii”, Nano Today, 49, s. 101798. Doi: 10.1016/j.nantod.2023.101798.
