Illumina gotowe biblioteki
Cechy
●Platformy:Illumina Novaseq 6000 i Novaseq x Plus
●Tryby sekwencjonowania:PE150 i PE250
●Kontrola jakości bibliotek przed sekwencjonowaniem
●Sekwencjonowanie danych QC i dostawa:Dostarczanie raportu QC i surowych danych w formacie FASTQ po demultipleksowaniu i filtrowaniu odczytów Q30
Zalety serwisowe
●Wszechstronność usług sekwencjonowania:Klient może wybrać sekwencję według linii, komórki przepływowej lub liczby wymaganych danych (częściowe sekwencjonowanie linii).
●Rozległe doświadczenie na platformie sekwencjonowania Illumina:z tysiącami zamkniętych projektów z różnymi gatunkami.
●Dostawa sekwencjonowania Raport QC:Dzięki wskaźnikom jakości, dokładności danych i ogólnej wydajności projektu sekwencjonowania.
●Proces dojrzałego sekwencjonowania:z krótkim czasem skrętu.
●Rygorystyczna kontrola jakości: Wdrażamy ścisłe wymagania QC, aby zagwarantować dostarczanie konsekwentnie wysokiej jakości wyników.
Przykładowe platformy
| Platforma | Komórka przepływowa | Tryb sekwencjonowania | Jednostka | Szacowana wydajność |
| Novaseq x | 10b (8 pasów) | PE150 | Pojedynczy pas Częściowy pas | 375 GB / pas |
| 25b (8 pasów) | PE150 | Pojedynczy pas Częściowy pas | 1000 GB/pas | |
| Novaseq 6000 | Komórka przepływu SP (2 pasy) | PE250 | Komórka przepływowa Pojedynczy pas Częściowy pas | 325-400 m odczytów / pasa |
| S4 Flow Cell (4 pasy) | PE150 | Komórka przepływowa Pojedynczy pas Częściowy pas | ~ 800 GB / pas |
Wymagania przykładowe
| Kwota danych (x) | Stężenie (QPCR/nm) | Tom | |
| Częściowe sekwencjonowanie linii
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 gb <x ≤ 100 gb | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
| Sekwencjonowanie linii | Na pas | ≥ 1,5 nm / pula biblioteki | ≥ 25 μl / pula biblioteki |
Oprócz stężenia i całkowitej ilości wymagany jest również odpowiedni wzór szczytowy.
UWAGA: Sekwencjonowanie pasów bibliotek o niskiej różnorodności wymaga Phix Spike-In, aby zapewnić solidne wywołanie podstawowe.
Zalecamy przesłanie bibliotek wstępnie nabranych jako próbek. Jeśli potrzebujesz BMKGENE do wykonania puli bibliotek, zapoznaj się
Wymagania biblioteczne dotyczące częściowego sekwencjonowania pasów.
Rozmiar biblioteki (mapa szczytowa)
Główny pik powinien znajdować się w granicach 300-450 pz.
Biblioteki powinny mieć jeden główny pik, brak zanieczyszczenia adaptera i bez dimerów starterów.
Skontaktuj się z nami, jeśli twoje próbki nie spełniają wymagań materiałowych.
Przepływ pracy serwisowej
Kontrola jakości biblioteki
Sekwencjonowanie
Kontrola jakości danych
Dostawa projektu
Biblioteka Raport QC
Raport na temat jakości biblioteki przedstawiono przed sekwencjonowaniem, oceną kwoty biblioteki i fragmentacji.
Sekwencjonowanie raportu QC
Tabela 1. Statystyki dotyczące sekwencjonowania danych.
| Próbka id | Bmkid | Raw odczyty | Surowe dane (BP) | Czyste odczyty (%) | Q20 (%) | P30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870,120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37,08 |
Rysunek 1. Rozkład jakości wzdłuż odczytów w każdej próbce
Rysunek 2. Podstawowy rozkład treści
Rysunek 3. Rozkład zawartości odczytu w danych sekwencjonowania
