CircRNA

Okrągłe RNA (circRNA) to niekodujące RNA, które tworzą struktury koliste i pełnią wiele ról regulacyjnych, w tym konkurują z miRNA o geny docelowe i wiązanie białek. Potok BMKCloud circRNA jest przeznaczony do analizy bibliotek zubożonych w rRNA z dobrze opisanym i wysokiej jakości genomem referencyjnym. Analiza rozpoczyna się od przycięcia odczytu i kontroli jakości, po czym następuje dopasowanie odczytu do genomu referencyjnego i przewidywanie nowych circRNA, w połączeniu z identyfikacją znanych circRNA z baz danych. Następnie identyfikuje się odpowiednie cele miRNA i gospodarzy circRNA. Analiza ekspresji różnicowej ujawnia circRNA ulegające różnej ekspresji, a odpowiadającym im gospodarzom przypisano adnotacje funkcjonalne w celu wyodrębnienia wzbogaconych funkcji biologicznych.