-
ਸਿੰਗਲ- ਨਿਊਕਲੀ ਆਰ ਐਨ ਏ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ
ਸਿੰਗਲ-ਸੈੱਲ ਕੈਪਚਰ ਅਤੇ ਕਸਟਮ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਨਿਰਮਾਣ ਤਕਨੀਕਾਂ ਦੇ ਵਿਕਾਸ, ਉੱਚ-ਥਰੂਪੁਟ ਕ੍ਰਮ ਦੇ ਨਾਲ, ਸੈੱਲ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਅਧਿਐਨ ਵਿੱਚ ਕ੍ਰਾਂਤੀ ਲਿਆ ਦਿੱਤੀ ਹੈ। ਇਹ ਸਫਲਤਾ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਸੈੱਲ ਜਨਸੰਖਿਆ ਦੇ ਡੂੰਘੇ ਅਤੇ ਵਧੇਰੇ ਵਿਆਪਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੀ ਆਗਿਆ ਦਿੰਦੀ ਹੈ, ਸਾਰੇ ਸੈੱਲਾਂ 'ਤੇ ਔਸਤ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਨਾਲ ਜੁੜੀਆਂ ਸੀਮਾਵਾਂ ਨੂੰ ਪਾਰ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਅਤੇ ਇਹਨਾਂ ਆਬਾਦੀਆਂ ਦੇ ਅੰਦਰ ਅਸਲ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਨੂੰ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਰੱਖਦੇ ਹਨ। ਜਦੋਂ ਕਿ ਸਿੰਗਲ-ਸੈੱਲ ਆਰਐਨਏ ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ (scRNA-seq) ਦੇ ਅਸਵੀਕਾਰਨਯੋਗ ਫਾਇਦੇ ਹਨ, ਇਹ ਕੁਝ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਵਿੱਚ ਚੁਣੌਤੀਆਂ ਦਾ ਸਾਹਮਣਾ ਕਰਦਾ ਹੈ ਜਿੱਥੇ ਇੱਕ ਸਿੰਗਲ-ਸੈੱਲ ਸਸਪੈਂਸ਼ਨ ਦੀ ਸਿਰਜਣਾ ਮੁਸ਼ਕਲ ਸਾਬਤ ਹੁੰਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਨਵੇਂ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ। BMKGene ਵਿਖੇ, ਅਸੀਂ ਅਤਿ-ਆਧੁਨਿਕ 10X ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਕ੍ਰੋਮੀਅਮ ਟੈਕਨਾਲੋਜੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਸਿੰਗਲ-ਨਿਊਕਲੀਅਸ RNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (snRNA-seq) ਦੀ ਪੇਸ਼ਕਸ਼ ਕਰਕੇ ਇਸ ਰੁਕਾਵਟ ਨੂੰ ਹੱਲ ਕਰਦੇ ਹਾਂ। ਇਹ ਪਹੁੰਚ ਸਿੰਗਲ-ਸੈੱਲ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਯੋਗ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੇ ਸਪੈਕਟ੍ਰਮ ਨੂੰ ਵਿਸ਼ਾਲ ਕਰਦੀ ਹੈ।
ਨਿਊਕਲੀਅਸ ਦਾ ਅਲੱਗ-ਥਲੱਗ ਨਵੀਨਤਾਕਾਰੀ 10X ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਕ੍ਰੋਮੀਅਮ ਚਿੱਪ ਦੁਆਰਾ ਪੂਰਾ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਡਬਲ ਕ੍ਰਾਸਿੰਗ ਦੇ ਨਾਲ ਅੱਠ-ਚੈਨਲ ਮਾਈਕ੍ਰੋਫਲੂਇਡਿਕਸ ਸਿਸਟਮ ਦੀ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਹੁੰਦੀ ਹੈ। ਇਸ ਪ੍ਰਣਾਲੀ ਦੇ ਅੰਦਰ, ਬਾਰਕੋਡ, ਪ੍ਰਾਈਮਰ, ਐਨਜ਼ਾਈਮ, ਅਤੇ ਇੱਕ ਸਿੰਗਲ ਨਿਊਕਲੀਅਸ ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਨ ਵਾਲੇ ਜੈੱਲ ਬੀਡਜ਼ ਨੈਨੋਲੀਟਰ-ਆਕਾਰ ਦੇ ਤੇਲ ਦੀਆਂ ਤੁਪਕਿਆਂ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਜੈੱਲ ਬੀਡ-ਇਨ-ਇਮਲਸ਼ਨ (GEM) ਬਣਾਉਂਦੇ ਹਨ। GEM ਬਣਨ ਤੋਂ ਬਾਅਦ, ਹਰੇਕ GEM ਦੇ ਅੰਦਰ ਸੈੱਲ ਲਾਈਸਿਸ ਅਤੇ ਬਾਰਕੋਡ ਰੀਲੀਜ਼ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। ਇਸ ਤੋਂ ਬਾਅਦ, mRNA ਅਣੂ 10X ਬਾਰਕੋਡ ਅਤੇ ਯੂਨੀਕ ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਆਈਡੈਂਟੀਫਾਇਰ (UMIs) ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਦੇ ਹੋਏ, cDNAs ਵਿੱਚ ਰਿਵਰਸ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨ ਤੋਂ ਗੁਜ਼ਰਦੇ ਹਨ। ਇਹ cDNAs ਫਿਰ ਮਿਆਰੀ ਲੜੀਬੱਧ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਨਿਰਮਾਣ ਦੇ ਅਧੀਨ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਸਿੰਗਲ-ਸੈੱਲ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਾਂ ਦੀ ਇੱਕ ਮਜ਼ਬੂਤ ਅਤੇ ਵਿਆਪਕ ਖੋਜ ਦੀ ਸਹੂਲਤ ਦਿੰਦੇ ਹਨ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: 10× ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਕਰੋਮੀਅਮ ਅਤੇ ਇਲੂਮਿਨਾ ਨੋਵਾਸੇਕ ਪਲੇਟਫਾਰਮ
-
10x ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਵਿਜ਼ੀਅਮ ਸਪੇਸ਼ੀਅਲ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮ
ਸਥਾਨਿਕ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮਿਕਸ ਇੱਕ ਅਤਿ-ਆਧੁਨਿਕ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਹੈ ਜੋ ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਨੂੰ ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਸਥਾਨਿਕ ਸੰਦਰਭ ਨੂੰ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਰੱਖਦੇ ਹੋਏ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਦੇ ਅੰਦਰ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਪੈਟਰਨਾਂ ਦੀ ਜਾਂਚ ਕਰਨ ਦੀ ਇਜਾਜ਼ਤ ਦਿੰਦੀ ਹੈ। ਇਸ ਡੋਮੇਨ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਸ਼ਕਤੀਸ਼ਾਲੀ ਪਲੇਟਫਾਰਮ 10x ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਵਿਜ਼ੀਅਮ ਹੈ ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਇਲੁਮਿਨਾ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਹੈ। 10X ਵਿਜ਼ੀਅਮ ਦਾ ਸਿਧਾਂਤ ਇੱਕ ਮਨੋਨੀਤ ਕੈਪਚਰ ਖੇਤਰ ਦੇ ਨਾਲ ਇੱਕ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਚਿੱਪ 'ਤੇ ਪਿਆ ਹੈ ਜਿੱਥੇ ਟਿਸ਼ੂ ਭਾਗ ਰੱਖੇ ਗਏ ਹਨ। ਇਸ ਕੈਪਚਰ ਖੇਤਰ ਵਿੱਚ ਬਾਰਕੋਡ ਕੀਤੇ ਚਟਾਕ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਹਰੇਕ ਟਿਸ਼ੂ ਦੇ ਅੰਦਰ ਇੱਕ ਵਿਲੱਖਣ ਸਥਾਨਿਕ ਸਥਾਨ ਨਾਲ ਮੇਲ ਖਾਂਦਾ ਹੈ। ਰਿਵਰਸ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ ਦੇ ਦੌਰਾਨ ਟਿਸ਼ੂ ਤੋਂ ਫੜੇ ਗਏ ਆਰਐਨਏ ਅਣੂਆਂ ਨੂੰ ਫਿਰ ਵਿਲੱਖਣ ਅਣੂ ਪਛਾਣਕਰਤਾਵਾਂ (UMIs) ਨਾਲ ਲੇਬਲ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਬਾਰਕੋਡ ਕੀਤੇ ਚਟਾਕ ਅਤੇ UMIs ਇੱਕ ਸਿੰਗਲ-ਸੈੱਲ ਰੈਜ਼ੋਲਿਊਸ਼ਨ 'ਤੇ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦੀ ਸਟੀਕ ਸਥਾਨਿਕ ਮੈਪਿੰਗ ਅਤੇ ਮਾਤਰਾ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਸਥਾਨਿਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਬਾਰਕੋਡ ਕੀਤੇ ਨਮੂਨਿਆਂ ਅਤੇ UMIs ਦਾ ਸੁਮੇਲ ਤਿਆਰ ਕੀਤੇ ਡੇਟਾ ਦੀ ਸ਼ੁੱਧਤਾ ਅਤੇ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਨੂੰ ਯਕੀਨੀ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਸਪੇਸ਼ੀਅਲ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮਿਕਸ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ, ਖੋਜਕਰਤਾ ਸੈੱਲਾਂ ਦੇ ਸਥਾਨਿਕ ਸੰਗਠਨ ਅਤੇ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਦੇ ਅੰਦਰ ਹੋਣ ਵਾਲੇ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਅਣੂ ਪਰਸਪਰ ਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਦੀ ਡੂੰਘੀ ਸਮਝ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਓਨਕੋਲੋਜੀ, ਨਿਊਰੋਸਾਇੰਸ, ਵਿਕਾਸ ਸੰਬੰਧੀ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ, ਇਮਯੂਨੋਲੋਜੀ ਸਮੇਤ ਕਈ ਖੇਤਰਾਂ ਵਿੱਚ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਦੇ ਅੰਤਰੀਵ ਤੰਤਰ ਵਿੱਚ ਅਨਮੋਲ ਸਮਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ। , ਅਤੇ ਬੋਟੈਨੀਕਲ ਅਧਿਐਨ.
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: 10X ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਵਿਜ਼ੀਅਮ ਅਤੇ ਇਲੂਮਿਨਾ ਨੋਵਾਸੇਕ
-
ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ mRNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ-ਨੈਨੋਪੋਰ
ਜਦੋਂ ਕਿ NGS-ਅਧਾਰਿਤ mRNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਨੂੰ ਮਾਪਣ ਲਈ ਇੱਕ ਬਹੁਮੁਖੀ ਸੰਦ ਹੈ, ਇਸਦੀ ਛੋਟੀ ਰੀਡਜ਼ 'ਤੇ ਨਿਰਭਰਤਾ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣਾਂ ਵਿੱਚ ਇਸਦੀ ਪ੍ਰਭਾਵਸ਼ੀਲਤਾ ਨੂੰ ਸੀਮਤ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਦੂਜੇ ਪਾਸੇ, ਨੈਨੋਪੋਰ ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ ਲੰਬੀ-ਪੜ੍ਹੀ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਨੂੰ ਰੁਜ਼ਗਾਰ ਦਿੰਦੀ ਹੈ, ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਵਾਲੇ mRNA ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਦੀ ਕ੍ਰਮ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦੀ ਹੈ। ਇਹ ਪਹੁੰਚ ਵਿਕਲਪਕ ਸਪਲੀਸਿੰਗ, ਜੀਨ ਫਿਊਜ਼ਨ, ਪੌਲੀ-ਐਡੀਨਿਲੇਸ਼ਨ, ਅਤੇ mRNA ਆਈਸੋਫਾਰਮ ਦੀ ਮਾਤਰਾ ਦੀ ਇੱਕ ਵਿਆਪਕ ਖੋਜ ਦੀ ਸਹੂਲਤ ਦਿੰਦੀ ਹੈ।
ਨੈਨੋਪੋਰ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ, ਇੱਕ ਵਿਧੀ ਜੋ ਨੈਨੋਪੋਰ ਸਿੰਗਲ-ਮੌਲੀਕਿਊਲ ਰੀਅਲ-ਟਾਈਮ ਇਲੈਕਟ੍ਰੀਕਲ ਸਿਗਨਲਾਂ 'ਤੇ ਨਿਰਭਰ ਕਰਦੀ ਹੈ, ਅਸਲ-ਸਮੇਂ ਵਿੱਚ ਨਤੀਜੇ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਮੋਟਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੁਆਰਾ ਨਿਰਦੇਸ਼ਿਤ, ਡਬਲ-ਸਟ੍ਰੈਂਡਡ ਡੀਐਨਏ ਇੱਕ ਬਾਇਓਫਿਲਮ ਵਿੱਚ ਏਮਬੇਡ ਕੀਤੇ ਨੈਨੋਪੋਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨਾਲ ਜੁੜਦਾ ਹੈ, ਜਦੋਂ ਇਹ ਇੱਕ ਵੋਲਟੇਜ ਫਰਕ ਦੇ ਅਧੀਨ ਨੈਨੋਪੋਰ ਚੈਨਲ ਵਿੱਚੋਂ ਲੰਘਦਾ ਹੈ ਤਾਂ ਇਹ ਬੰਦ ਹੋ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਡੀਐਨਏ ਸਟ੍ਰੈਂਡ 'ਤੇ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਅਧਾਰਾਂ ਦੁਆਰਾ ਤਿਆਰ ਕੀਤੇ ਗਏ ਵਿਲੱਖਣ ਬਿਜਲਈ ਸਿਗਨਲਾਂ ਨੂੰ ਅਸਲ-ਸਮੇਂ ਵਿੱਚ ਖੋਜਿਆ ਅਤੇ ਵਰਗੀਕ੍ਰਿਤ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਸਹੀ ਅਤੇ ਨਿਰੰਤਰ ਨਿਊਕਲੀਓਟਾਈਡ ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਸਹੂਲਤ ਦਿੰਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਨਵੀਨਤਾਕਾਰੀ ਪਹੁੰਚ ਛੋਟੀ-ਪੜ੍ਹੀ ਸੀਮਾਵਾਂ ਨੂੰ ਦੂਰ ਕਰਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਤੁਰੰਤ ਨਤੀਜਿਆਂ ਦੇ ਨਾਲ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮਿਕ ਅਧਿਐਨਾਂ ਸਮੇਤ, ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਜੀਨੋਮਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਇੱਕ ਗਤੀਸ਼ੀਲ ਪਲੇਟਫਾਰਮ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੀ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: ਨੈਨੋਪੋਰ ਪ੍ਰੋਮੇਥੀਅਨ 48
-
ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ mRNA ਕ੍ਰਮ -PacBio
ਜਦੋਂ ਕਿ NGS-ਅਧਾਰਿਤ mRNA ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਨੂੰ ਮਾਪਣ ਲਈ ਇੱਕ ਬਹੁਮੁਖੀ ਸੰਦ ਹੈ, ਇਸਦੀ ਛੋਟੀ ਰੀਡਜ਼ 'ਤੇ ਨਿਰਭਰਤਾ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣਾਂ ਵਿੱਚ ਇਸਦੀ ਵਰਤੋਂ ਨੂੰ ਸੀਮਤ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਦੂਜੇ ਪਾਸੇ, PacBio ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (Iso-Seq) ਲੰਬੇ ਸਮੇਂ ਤੋਂ ਪੜ੍ਹੀ ਜਾਣ ਵਾਲੀ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੀ ਹੈ, ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਵਾਲੇ mRNA ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਦੀ ਕ੍ਰਮ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦੀ ਹੈ। ਇਹ ਪਹੁੰਚ ਵਿਕਲਪਕ ਸਪਲੀਸਿੰਗ, ਜੀਨ ਫਿਊਜ਼ਨ, ਅਤੇ ਪੌਲੀ-ਐਡੀਨਿਲੇਸ਼ਨ ਦੀ ਇੱਕ ਵਿਆਪਕ ਖੋਜ ਦੀ ਸਹੂਲਤ ਦਿੰਦੀ ਹੈ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਲੋੜੀਂਦੇ ਡੇਟਾ ਦੀ ਉੱਚ ਮਾਤਰਾ ਦੇ ਕਾਰਨ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦੀ ਮਾਤਰਾ ਲਈ ਹੋਰ ਵਿਕਲਪ ਹਨ। PacBio ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਸਿੰਗਲ-ਮੌਲੀਕਿਊਲ, ਰੀਅਲ-ਟਾਈਮ (SMRT) ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ 'ਤੇ ਨਿਰਭਰ ਕਰਦੀ ਹੈ, ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਵਾਲੇ mRNA ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਨੂੰ ਕੈਪਚਰ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਵੱਖਰਾ ਫਾਇਦਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਇਸ ਨਵੀਨਤਾਕਾਰੀ ਪਹੁੰਚ ਵਿੱਚ ਜ਼ੀਰੋ-ਮੋਡ ਵੇਵਗਾਈਡਜ਼ (ZMWs) ਅਤੇ ਮਾਈਕ੍ਰੋਫੈਬਰੀਕੇਟਿਡ ਖੂਹਾਂ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ ਜੋ ਕ੍ਰਮ ਦੇ ਦੌਰਾਨ ਡੀਐਨਏ ਪੋਲੀਮੇਰੇਜ਼ ਗਤੀਵਿਧੀ ਦੇ ਅਸਲ-ਸਮੇਂ ਦੇ ਨਿਰੀਖਣ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਇਹਨਾਂ ZMWs ਦੇ ਅੰਦਰ, PacBio ਦਾ ਡੀਐਨਏ ਪੋਲੀਮੇਰੇਜ਼ ਡੀਐਨਏ ਦੇ ਇੱਕ ਪੂਰਕ ਸਟ੍ਰੈਂਡ ਦਾ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਲੰਬੇ ਰੀਡਜ਼ ਤਿਆਰ ਕਰਦਾ ਹੈ ਜੋ ਪੂਰੀ mRNA ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਨੂੰ ਫੈਲਾਉਂਦਾ ਹੈ। ਸਰਕੂਲਰ ਕੰਸੈਂਸਸ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (CCS) ਮੋਡ ਵਿੱਚ PacBio ਓਪਰੇਸ਼ਨ ਇੱਕੋ ਅਣੂ ਨੂੰ ਵਾਰ-ਵਾਰ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਕਰਕੇ ਸ਼ੁੱਧਤਾ ਨੂੰ ਵਧਾਉਂਦਾ ਹੈ। ਤਿਆਰ ਕੀਤੇ ਗਏ HiFi ਰੀਡਾਂ ਦੀ NGS ਨਾਲ ਤੁਲਨਾਯੋਗ ਸ਼ੁੱਧਤਾ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮਿਕ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਦੇ ਇੱਕ ਵਿਆਪਕ ਅਤੇ ਭਰੋਸੇਮੰਦ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਯੋਗਦਾਨ ਪਾਉਂਦੀ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: PacBio ਸੀਕਵਲ II; PacBio Revio
-
ਯੂਕੇਰੀਓਟਿਕ mRNA ਕ੍ਰਮ-ਐਨ.ਜੀ.ਐਸ
mRNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ, ਇੱਕ ਬਹੁਮੁਖੀ ਤਕਨਾਲੋਜੀ, ਖਾਸ ਹਾਲਤਾਂ ਦੇ ਅਧੀਨ ਸੈੱਲਾਂ ਦੇ ਅੰਦਰ ਸਾਰੇ mRNA ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਦੀ ਵਿਆਪਕ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ ਨੂੰ ਸ਼ਕਤੀ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਇਸਦੇ ਵਿਆਪਕ ਕਾਰਜਾਂ ਦੇ ਨਾਲ, ਇਹ ਅਤਿ-ਆਧੁਨਿਕ ਸਾਧਨ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਾਂ, ਜੀਨ ਬਣਤਰਾਂ, ਅਤੇ ਵਿਭਿੰਨ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਅਣੂ ਵਿਧੀਆਂ ਦਾ ਪਰਦਾਫਾਸ਼ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਬੁਨਿਆਦੀ ਖੋਜ, ਕਲੀਨਿਕਲ ਡਾਇਗਨੌਸਟਿਕਸ, ਅਤੇ ਡਰੱਗ ਡਿਵੈਲਪਮੈਂਟ ਵਿੱਚ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਅਪਣਾਇਆ ਗਿਆ, mRNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਸੈਲੂਲਰ ਗਤੀਸ਼ੀਲਤਾ ਅਤੇ ਜੈਨੇਟਿਕ ਰੈਗੂਲੇਸ਼ਨ ਦੀਆਂ ਪੇਚੀਦਗੀਆਂ ਵਿੱਚ ਸਮਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਵੱਖ-ਵੱਖ ਖੇਤਰਾਂ ਵਿੱਚ ਇਸਦੀ ਸੰਭਾਵਨਾ ਬਾਰੇ ਉਤਸੁਕਤਾ ਪੈਦਾ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7
-
ਗੈਰ-ਸੰਦਰਭ ਅਧਾਰਤ mRNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ-NGS
mRNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਖਾਸ ਸ਼ਰਤਾਂ ਅਧੀਨ ਸੈੱਲਾਂ ਦੇ ਅੰਦਰ ਸਾਰੇ mRNA ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਦੀ ਵਿਆਪਕ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ ਨੂੰ ਸ਼ਕਤੀ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਇਹ ਅਤਿ-ਆਧੁਨਿਕ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਇੱਕ ਸ਼ਕਤੀਸ਼ਾਲੀ ਸਾਧਨ ਵਜੋਂ ਕੰਮ ਕਰਦੀ ਹੈ, ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਾਂ, ਜੀਨ ਬਣਤਰਾਂ, ਅਤੇ ਵਿਭਿੰਨ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਅਣੂ ਵਿਧੀਆਂ ਦਾ ਪਰਦਾਫਾਸ਼ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਬੁਨਿਆਦੀ ਖੋਜ, ਕਲੀਨਿਕਲ ਡਾਇਗਨੌਸਟਿਕਸ, ਅਤੇ ਡਰੱਗ ਡਿਵੈਲਪਮੈਂਟ ਵਿੱਚ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਅਪਣਾਇਆ ਗਿਆ, mRNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਸੈਲੂਲਰ ਡਾਇਨਾਮਿਕਸ ਅਤੇ ਜੈਨੇਟਿਕ ਰੈਗੂਲੇਸ਼ਨ ਦੀਆਂ ਪੇਚੀਦਗੀਆਂ ਵਿੱਚ ਸਮਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7
-
ਲੰਬੀ ਗੈਰ-ਕੋਡਿੰਗ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ-ਇਲੂਮਿਨਾ
ਲੰਬੇ ਗੈਰ-ਕੋਡਿੰਗ RNAs (lncRNAs) 200 ਨਿਊਕਲੀਓਟਾਈਡਾਂ ਤੋਂ ਲੰਬੇ ਹੁੰਦੇ ਹਨ ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਕੋਲ ਘੱਟੋ-ਘੱਟ ਕੋਡਿੰਗ ਸਮਰੱਥਾ ਹੁੰਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਗੈਰ-ਕੋਡਿੰਗ RNA ਦੇ ਅੰਦਰ ਪ੍ਰਮੁੱਖ ਤੱਤ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। ਨਿਊਕਲੀਅਸ ਅਤੇ ਸਾਇਟੋਪਲਾਜ਼ਮ ਵਿੱਚ ਪਾਏ ਜਾਂਦੇ ਹਨ, ਇਹ ਆਰਐਨਏ ਐਪੀਜੇਨੇਟਿਕ, ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨਲ, ਅਤੇ ਪੋਸਟ-ਟਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨਲ ਰੈਗੂਲੇਸ਼ਨ ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਣ ਭੂਮਿਕਾਵਾਂ ਨਿਭਾਉਂਦੇ ਹਨ, ਸੈਲੂਲਰ ਅਤੇ ਅਣੂ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਨੂੰ ਆਕਾਰ ਦੇਣ ਵਿੱਚ ਉਹਨਾਂ ਦੀ ਮਹੱਤਤਾ ਨੂੰ ਰੇਖਾਂਕਿਤ ਕਰਦੇ ਹਨ। LncRNA ਕ੍ਰਮ ਸੈੱਲ ਵਿਭਿੰਨਤਾ, ਓਨਟੋਜਨੇਸਿਸ, ਅਤੇ ਮਨੁੱਖੀ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਸ਼ਕਤੀਸ਼ਾਲੀ ਸਾਧਨ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: Illumina NovaSeq
-
ਛੋਟਾ RNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ-ਇਲੂਮਿਨਾ
ਛੋਟੇ RNA (sRNA) ਅਣੂਆਂ ਵਿੱਚ ਮਾਈਕ੍ਰੋਆਰਐਨਏ (miRNAs), ਛੋਟੇ ਦਖਲ ਦੇਣ ਵਾਲੇ RNAs (siRNAs), ਅਤੇ piwi-ਇੰਟਰੈਕਟਿੰਗ RNAs (piRNAs) ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਇਹਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ, miRNAs, ਲਗਭਗ 18-25 ਨਿਊਕਲੀਓਟਾਈਡ ਲੰਬੇ, ਵੱਖ-ਵੱਖ ਸੈਲੂਲਰ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਵਿੱਚ ਉਹਨਾਂ ਦੀਆਂ ਮੁੱਖ ਨਿਯੰਤ੍ਰਕ ਭੂਮਿਕਾਵਾਂ ਲਈ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਤੌਰ 'ਤੇ ਧਿਆਨ ਦੇਣ ਯੋਗ ਹਨ। ਟਿਸ਼ੂ-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਅਤੇ ਪੜਾਅ-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਸਮੀਕਰਨ ਪੈਟਰਨਾਂ ਦੇ ਨਾਲ, miRNAs ਵੱਖ-ਵੱਖ ਕਿਸਮਾਂ ਵਿੱਚ ਉੱਚ ਸੁਰੱਖਿਆ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਿਤ ਕਰਦੇ ਹਨ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: Illumina NovaSeq
-
ਸਰਕਆਰਐਨਏ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ-ਇਲੁਮਿਨਾ
ਸਰਕੂਲਰ ਆਰਐਨਏ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (ਸਰਕੂਲਰ ਆਰਐਨਏ-ਸੀਕ) ਸਰਕੂਲਰ ਆਰਐਨਏ ਦਾ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲ ਅਤੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨਾ ਹੈ, ਆਰਐਨਏ ਅਣੂਆਂ ਦੀ ਇੱਕ ਸ਼੍ਰੇਣੀ ਜੋ ਗੈਰ-ਕੈਨੋਨੀਕਲ ਸਪਲੀਸਿੰਗ ਘਟਨਾਵਾਂ ਦੇ ਕਾਰਨ ਬੰਦ ਲੂਪ ਬਣਾਉਂਦੇ ਹਨ, ਇਸ ਆਰਐਨਏ ਨੂੰ ਵਧੀ ਹੋਈ ਸਥਿਰਤਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਜਦੋਂ ਕਿ ਕੁਝ ਸਰਕਆਰਐਨਏ ਨੂੰ ਮਾਈਕ੍ਰੋਆਰਐਨਏ ਸਪੰਜਾਂ ਵਜੋਂ ਕੰਮ ਕਰਦੇ ਦਿਖਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ, ਮਾਈਕ੍ਰੋਆਰਐਨਏ ਨੂੰ ਵੱਖ ਕਰਨਾ ਅਤੇ ਉਹਨਾਂ ਨੂੰ ਆਪਣੇ ਟੀਚੇ ਵਾਲੇ ਐਮਆਰਐਨਏ ਨੂੰ ਨਿਯੰਤ੍ਰਿਤ ਕਰਨ ਤੋਂ ਰੋਕਦਾ ਹੈ, ਦੂਜੇ ਸਰਕਆਰਐਨਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨਾਲ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ ਪਾ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਨੂੰ ਸੰਚਾਲਿਤ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਜਾਂ ਸੈਲੂਲਰ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਵਿੱਚ ਭੂਮਿਕਾ ਨਿਭਾ ਸਕਦੇ ਹਨ। circRNA ਸਮੀਕਰਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਇਹਨਾਂ ਅਣੂਆਂ ਦੀਆਂ ਰੈਗੂਲੇਟਰੀ ਭੂਮਿਕਾਵਾਂ ਅਤੇ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਸੈਲੂਲਰ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ, ਵਿਕਾਸ ਦੇ ਪੜਾਵਾਂ, ਅਤੇ ਬਿਮਾਰੀ ਦੀਆਂ ਸਥਿਤੀਆਂ ਵਿੱਚ ਉਹਨਾਂ ਦੀ ਮਹੱਤਤਾ ਬਾਰੇ ਸੂਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦੇ ਸੰਦਰਭ ਵਿੱਚ RNA ਨਿਯਮ ਦੀ ਗੁੰਝਲਤਾ ਦੀ ਡੂੰਘੀ ਸਮਝ ਵਿੱਚ ਯੋਗਦਾਨ ਪਾਉਂਦਾ ਹੈ।
-
ਪੂਰੀ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ - ਇਲੂਮਿਨਾ
ਸਮੁੱਚੀ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਵਿਭਿੰਨ ਆਰਐਨਏ ਅਣੂਆਂ ਨੂੰ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲ ਕਰਨ, ਕੋਡਿੰਗ (mRNA) ਅਤੇ ਗੈਰ-ਕੋਡਿੰਗ ਆਰਐਨਏ (lncRNA, circRNA, ਅਤੇ miRNA) ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਵਿਆਪਕ ਪਹੁੰਚ ਪੇਸ਼ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਇਹ ਤਕਨੀਕ ਇੱਕ ਦਿੱਤੇ ਪਲ 'ਤੇ ਖਾਸ ਸੈੱਲਾਂ ਦੇ ਪੂਰੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਨੂੰ ਕੈਪਚਰ ਕਰਦੀ ਹੈ, ਜਿਸ ਨਾਲ ਸੈਲੂਲਰ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਦੀ ਸੰਪੂਰਨ ਸਮਝ ਹੁੰਦੀ ਹੈ। "ਕੁੱਲ ਆਰਐਨਏ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ" ਵਜੋਂ ਵੀ ਜਾਣਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਇਸਦਾ ਉਦੇਸ਼ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਰੈਗੂਲੇਟਰੀ ਨੈਟਵਰਕਾਂ ਦਾ ਪਰਦਾਫਾਸ਼ ਕਰਨਾ ਹੈ, ਡੂੰਘਾਈ ਨਾਲ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਕਰਨਾ ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਮੁਕਾਬਲਾ ਕਰਨ ਵਾਲੇ ਐਂਡੋਜੇਨਸ ਆਰਐਨਏ (ਸੀਆਰਐਨਏ) ਅਤੇ ਸੰਯੁਕਤ ਆਰਐਨਏ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ। ਇਹ ਫੰਕਸ਼ਨਲ ਚਰਿੱਤਰੀਕਰਨ ਵੱਲ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਕਦਮ ਦੀ ਨਿਸ਼ਾਨਦੇਹੀ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ circRNA-miRNA-mRNA-ਅਧਾਰਤ CERNA ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਨ ਵਾਲੇ ਰੈਗੂਲੇਟਰੀ ਨੈਟਵਰਕ ਨੂੰ ਖੋਲ੍ਹਣ ਵਿੱਚ।
