-
BMKMANU S3000_ਸਪੇਸ਼ੀਅਲ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ
ਸਥਾਨਿਕ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮਿਕਸ ਵਿਗਿਆਨਕ ਨਵੀਨਤਾ ਵਿੱਚ ਸਭ ਤੋਂ ਅੱਗੇ ਹੈ, ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਨੂੰ ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਸਥਾਨਿਕ ਸੰਦਰਭ ਨੂੰ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਰੱਖਦੇ ਹੋਏ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਦੇ ਅੰਦਰ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਪੈਟਰਨਾਂ ਵਿੱਚ ਖੋਜ ਕਰਨ ਲਈ ਸ਼ਕਤੀ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਵੱਖ-ਵੱਖ ਪਲੇਟਫਾਰਮਾਂ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ, BMKGene ਨੇ BMKManu S3000 ਸਪੇਸ਼ੀਅਲ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮ ਚਿੱਪ ਵਿਕਸਿਤ ਕੀਤੀ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ 3.5µm ਦੇ ਵਧੇ ਹੋਏ ਰੈਜ਼ੋਲਿਊਸ਼ਨ, ਸਬਸੈਲੂਲਰ ਰੇਂਜ ਤੱਕ ਪਹੁੰਚਣ, ਅਤੇ ਬਹੁ-ਪੱਧਰੀ ਰੈਜ਼ੋਲਿਊਸ਼ਨ ਸੈਟਿੰਗਾਂ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ। S3000 ਚਿੱਪ, ਲਗਭਗ 4 ਮਿਲੀਅਨ ਸਪਾਟਸ ਦੀ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ, ਸਪੇਸਲੀ ਬਾਰਕੋਡਡ ਕੈਪਚਰ ਪੜਤਾਲਾਂ ਨਾਲ ਲੋਡ ਕੀਤੇ ਮਣਕਿਆਂ ਨਾਲ ਲੇਅਰਡ ਮਾਈਕ੍ਰੋਵੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਨਿਯੁਕਤ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਇੱਕ cDNA ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ, ਸਥਾਨਿਕ ਬਾਰਕੋਡਾਂ ਨਾਲ ਭਰਪੂਰ, S3000 ਚਿੱਪ ਤੋਂ ਤਿਆਰ ਕੀਤੀ ਗਈ ਹੈ ਅਤੇ ਬਾਅਦ ਵਿੱਚ Illumina NovaSeq ਪਲੇਟਫਾਰਮ 'ਤੇ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਕੀਤੀ ਗਈ ਹੈ। ਸਥਾਨਿਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਬਾਰਕੋਡ ਕੀਤੇ ਨਮੂਨਿਆਂ ਅਤੇ UMIs ਦਾ ਸੁਮੇਲ ਤਿਆਰ ਕੀਤੇ ਡੇਟਾ ਦੀ ਸ਼ੁੱਧਤਾ ਅਤੇ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਨੂੰ ਯਕੀਨੀ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ। BMKManu S3000 ਚਿੱਪ ਬਹੁਤ ਹੀ ਬਹੁਪੱਖੀ ਹੈ, ਬਹੁ-ਪੱਧਰੀ ਰੈਜ਼ੋਲਿਊਸ਼ਨ ਸੈਟਿੰਗਾਂ ਦੀ ਪੇਸ਼ਕਸ਼ ਕਰਦੀ ਹੈ ਜੋ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਅਤੇ ਵੇਰਵੇ ਦੇ ਲੋੜੀਂਦੇ ਪੱਧਰਾਂ ਨਾਲ ਬਾਰੀਕ ਟਿਊਨ ਕੀਤੀ ਜਾ ਸਕਦੀ ਹੈ। ਇਹ ਅਨੁਕੂਲਤਾ ਚਿੱਪ ਨੂੰ ਵਿਭਿੰਨ ਸਥਾਨਿਕ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮਿਕਸ ਅਧਿਐਨਾਂ ਲਈ ਇੱਕ ਵਧੀਆ ਵਿਕਲਪ ਦੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਰੱਖਦੀ ਹੈ, ਘੱਟੋ ਘੱਟ ਸ਼ੋਰ ਦੇ ਨਾਲ ਸਟੀਕ ਸਥਾਨਿਕ ਕਲੱਸਟਰਿੰਗ ਨੂੰ ਯਕੀਨੀ ਬਣਾਉਂਦੀ ਹੈ। BMKManu S3000 ਦੇ ਨਾਲ ਸੈੱਲ ਸੈਗਮੈਂਟੇਸ਼ਨ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਸੈੱਲਾਂ ਦੀਆਂ ਸੀਮਾਵਾਂ ਤੱਕ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨਲ ਡੇਟਾ ਦੀ ਹੱਦਬੰਦੀ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦੀ ਹੈ, ਨਤੀਜੇ ਵਜੋਂ ਇੱਕ ਅਜਿਹਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਹੁੰਦਾ ਹੈ ਜਿਸਦਾ ਸਿੱਧਾ ਜੈਵਿਕ ਅਰਥ ਹੁੰਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ, S3000 ਦੇ ਸੁਧਰੇ ਹੋਏ ਰੈਜ਼ੋਲਿਊਸ਼ਨ ਦੇ ਨਤੀਜੇ ਵਜੋਂ ਪ੍ਰਤੀ ਸੈੱਲ ਵਿੱਚ ਉੱਚ ਗਿਣਤੀ ਵਿੱਚ ਜੀਨਾਂ ਅਤੇ UMIs ਦਾ ਪਤਾ ਲਗਾਇਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਨਾਲ ਸਥਾਨਿਕ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨ ਪੈਟਰਨਾਂ ਅਤੇ ਸੈੱਲਾਂ ਦੇ ਕਲੱਸਟਰਿੰਗ ਦਾ ਵਧੇਰੇ ਸਹੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।
-
ਸਿੰਗਲ- ਨਿਊਕਲੀ ਆਰ ਐਨ ਏ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ
ਸਿੰਗਲ-ਸੈੱਲ ਕੈਪਚਰ ਅਤੇ ਕਸਟਮ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਨਿਰਮਾਣ ਤਕਨੀਕਾਂ ਦੇ ਵਿਕਾਸ, ਉੱਚ-ਥਰੂਪੁਟ ਕ੍ਰਮ ਦੇ ਨਾਲ, ਸੈੱਲ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਅਧਿਐਨ ਵਿੱਚ ਕ੍ਰਾਂਤੀ ਲਿਆ ਦਿੱਤੀ ਹੈ। ਇਹ ਸਫਲਤਾ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਸੈੱਲ ਜਨਸੰਖਿਆ ਦੇ ਡੂੰਘੇ ਅਤੇ ਵਧੇਰੇ ਵਿਆਪਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੀ ਆਗਿਆ ਦਿੰਦੀ ਹੈ, ਸਾਰੇ ਸੈੱਲਾਂ 'ਤੇ ਔਸਤ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਨਾਲ ਜੁੜੀਆਂ ਸੀਮਾਵਾਂ ਨੂੰ ਪਾਰ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਅਤੇ ਇਹਨਾਂ ਆਬਾਦੀਆਂ ਦੇ ਅੰਦਰ ਅਸਲ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਨੂੰ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਰੱਖਦੇ ਹਨ। ਜਦੋਂ ਕਿ ਸਿੰਗਲ-ਸੈੱਲ ਆਰਐਨਏ ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ (scRNA-seq) ਦੇ ਅਸਵੀਕਾਰਨਯੋਗ ਫਾਇਦੇ ਹਨ, ਇਹ ਕੁਝ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਵਿੱਚ ਚੁਣੌਤੀਆਂ ਦਾ ਸਾਹਮਣਾ ਕਰਦਾ ਹੈ ਜਿੱਥੇ ਇੱਕ ਸਿੰਗਲ-ਸੈੱਲ ਸਸਪੈਂਸ਼ਨ ਦੀ ਸਿਰਜਣਾ ਮੁਸ਼ਕਲ ਸਾਬਤ ਹੁੰਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਨਵੇਂ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ। BMKGene ਵਿਖੇ, ਅਸੀਂ ਅਤਿ-ਆਧੁਨਿਕ 10X ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਕ੍ਰੋਮੀਅਮ ਟੈਕਨਾਲੋਜੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਸਿੰਗਲ-ਨਿਊਕਲੀਅਸ RNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (snRNA-seq) ਦੀ ਪੇਸ਼ਕਸ਼ ਕਰਕੇ ਇਸ ਰੁਕਾਵਟ ਨੂੰ ਹੱਲ ਕਰਦੇ ਹਾਂ। ਇਹ ਪਹੁੰਚ ਸਿੰਗਲ-ਸੈੱਲ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਯੋਗ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੇ ਸਪੈਕਟ੍ਰਮ ਨੂੰ ਵਿਸ਼ਾਲ ਕਰਦੀ ਹੈ।
ਨਿਊਕਲੀਅਸ ਦਾ ਅਲੱਗ-ਥਲੱਗ ਨਵੀਨਤਾਕਾਰੀ 10X ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਕ੍ਰੋਮੀਅਮ ਚਿੱਪ ਦੁਆਰਾ ਪੂਰਾ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਡਬਲ ਕ੍ਰਾਸਿੰਗ ਦੇ ਨਾਲ ਅੱਠ-ਚੈਨਲ ਮਾਈਕ੍ਰੋਫਲੂਇਡਿਕਸ ਸਿਸਟਮ ਦੀ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਹੁੰਦੀ ਹੈ। ਇਸ ਪ੍ਰਣਾਲੀ ਦੇ ਅੰਦਰ, ਬਾਰਕੋਡ, ਪ੍ਰਾਈਮਰ, ਐਨਜ਼ਾਈਮ, ਅਤੇ ਇੱਕ ਸਿੰਗਲ ਨਿਊਕਲੀਅਸ ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਨ ਵਾਲੇ ਜੈੱਲ ਬੀਡਜ਼ ਨੈਨੋਲੀਟਰ-ਆਕਾਰ ਦੇ ਤੇਲ ਦੀਆਂ ਤੁਪਕਿਆਂ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਜੈੱਲ ਬੀਡ-ਇਨ-ਇਮਲਸ਼ਨ (GEM) ਬਣਾਉਂਦੇ ਹਨ। GEM ਬਣਨ ਤੋਂ ਬਾਅਦ, ਹਰੇਕ GEM ਦੇ ਅੰਦਰ ਸੈੱਲ ਲਾਈਸਿਸ ਅਤੇ ਬਾਰਕੋਡ ਰੀਲੀਜ਼ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। ਇਸ ਤੋਂ ਬਾਅਦ, mRNA ਅਣੂ 10X ਬਾਰਕੋਡ ਅਤੇ ਯੂਨੀਕ ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਆਈਡੈਂਟੀਫਾਇਰ (UMIs) ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਦੇ ਹੋਏ, cDNAs ਵਿੱਚ ਰਿਵਰਸ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨ ਤੋਂ ਗੁਜ਼ਰਦੇ ਹਨ। ਇਹ cDNAs ਫਿਰ ਮਿਆਰੀ ਲੜੀਬੱਧ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਨਿਰਮਾਣ ਦੇ ਅਧੀਨ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਸਿੰਗਲ-ਸੈੱਲ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਾਂ ਦੀ ਇੱਕ ਮਜ਼ਬੂਤ ਅਤੇ ਵਿਆਪਕ ਖੋਜ ਦੀ ਸਹੂਲਤ ਦਿੰਦੇ ਹਨ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: 10× ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਕਰੋਮੀਅਮ ਅਤੇ ਇਲੂਮਿਨਾ ਨੋਵਾਸੇਕ ਪਲੇਟਫਾਰਮ
-
10x ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਵਿਜ਼ੀਅਮ ਸਪੇਸ਼ੀਅਲ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮ
ਸਥਾਨਿਕ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮਿਕਸ ਇੱਕ ਅਤਿ-ਆਧੁਨਿਕ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਹੈ ਜੋ ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਨੂੰ ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਸਥਾਨਿਕ ਸੰਦਰਭ ਨੂੰ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਰੱਖਦੇ ਹੋਏ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਦੇ ਅੰਦਰ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਪੈਟਰਨਾਂ ਦੀ ਜਾਂਚ ਕਰਨ ਦੀ ਇਜਾਜ਼ਤ ਦਿੰਦੀ ਹੈ। ਇਸ ਡੋਮੇਨ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਸ਼ਕਤੀਸ਼ਾਲੀ ਪਲੇਟਫਾਰਮ 10x ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਵਿਜ਼ੀਅਮ ਹੈ ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਇਲੁਮਿਨਾ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਹੈ। 10X ਵਿਜ਼ੀਅਮ ਦਾ ਸਿਧਾਂਤ ਇੱਕ ਮਨੋਨੀਤ ਕੈਪਚਰ ਖੇਤਰ ਦੇ ਨਾਲ ਇੱਕ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਚਿੱਪ 'ਤੇ ਪਿਆ ਹੈ ਜਿੱਥੇ ਟਿਸ਼ੂ ਭਾਗ ਰੱਖੇ ਗਏ ਹਨ। ਇਸ ਕੈਪਚਰ ਖੇਤਰ ਵਿੱਚ ਬਾਰਕੋਡ ਕੀਤੇ ਚਟਾਕ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਹਰੇਕ ਟਿਸ਼ੂ ਦੇ ਅੰਦਰ ਇੱਕ ਵਿਲੱਖਣ ਸਥਾਨਿਕ ਸਥਾਨ ਨਾਲ ਮੇਲ ਖਾਂਦਾ ਹੈ। ਰਿਵਰਸ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ ਦੇ ਦੌਰਾਨ ਟਿਸ਼ੂ ਤੋਂ ਫੜੇ ਗਏ ਆਰਐਨਏ ਅਣੂਆਂ ਨੂੰ ਫਿਰ ਵਿਲੱਖਣ ਅਣੂ ਪਛਾਣਕਰਤਾਵਾਂ (UMIs) ਨਾਲ ਲੇਬਲ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਬਾਰਕੋਡ ਕੀਤੇ ਚਟਾਕ ਅਤੇ UMIs ਇੱਕ ਸਿੰਗਲ-ਸੈੱਲ ਰੈਜ਼ੋਲਿਊਸ਼ਨ 'ਤੇ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦੀ ਸਟੀਕ ਸਥਾਨਿਕ ਮੈਪਿੰਗ ਅਤੇ ਮਾਤਰਾ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਸਥਾਨਿਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਬਾਰਕੋਡ ਕੀਤੇ ਨਮੂਨਿਆਂ ਅਤੇ UMIs ਦਾ ਸੁਮੇਲ ਤਿਆਰ ਕੀਤੇ ਡੇਟਾ ਦੀ ਸ਼ੁੱਧਤਾ ਅਤੇ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਨੂੰ ਯਕੀਨੀ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਸਪੇਸ਼ੀਅਲ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮਿਕਸ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ, ਖੋਜਕਰਤਾ ਸੈੱਲਾਂ ਦੇ ਸਥਾਨਿਕ ਸੰਗਠਨ ਅਤੇ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਦੇ ਅੰਦਰ ਹੋਣ ਵਾਲੇ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਅਣੂ ਪਰਸਪਰ ਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਦੀ ਡੂੰਘੀ ਸਮਝ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਓਨਕੋਲੋਜੀ, ਨਿਊਰੋਸਾਇੰਸ, ਵਿਕਾਸ ਸੰਬੰਧੀ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ, ਇਮਯੂਨੋਲੋਜੀ ਸਮੇਤ ਕਈ ਖੇਤਰਾਂ ਵਿੱਚ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਦੇ ਅੰਤਰੀਵ ਤੰਤਰ ਵਿੱਚ ਅਨਮੋਲ ਸਮਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ। , ਅਤੇ ਬੋਟੈਨੀਕਲ ਅਧਿਐਨ.
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: 10X ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਵਿਜ਼ੀਅਮ ਅਤੇ ਇਲੂਮਿਨਾ ਨੋਵਾਸੇਕ
