-
ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ -ਐਨ.ਜੀ.ਐਸ
ਇੱਕ ਮੈਟਾਜੀਨੋਮ ਜੀਵਾਣੂਆਂ ਦੇ ਮਿਸ਼ਰਤ ਸਮੂਹ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਵਾਤਾਵਰਣ ਅਤੇ ਮਨੁੱਖੀ ਮੈਟਾਜੇਨੋਮ ਦੀ ਕੁੱਲ ਜੈਨੇਟਿਕ ਸਮੱਗਰੀ ਦਾ ਸੰਗ੍ਰਹਿ ਹੈ। ਇਸ ਵਿੱਚ ਕਾਸ਼ਤਯੋਗ ਅਤੇ ਗੈਰ ਕਾਸ਼ਤਯੋਗ ਸੂਖਮ ਜੀਵਾਂ ਦੇ ਜੀਨੋਮ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। NGS ਦੇ ਨਾਲ ਸ਼ਾਟਗਨ ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਇਹਨਾਂ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਜੀਨੋਮਿਕ ਲੈਂਡਸਕੇਪਾਂ ਦਾ ਅਧਿਐਨ ਕਰਨ ਦੇ ਯੋਗ ਬਣਾਉਂਦੀ ਹੈ ਜੋ ਵਾਤਾਵਰਣ ਦੇ ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ ਏਮਬੇਡ ਕੀਤੀ ਗਈ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ ਵਰਗੀਕਰਨ ਤੋਂ ਵੱਧ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਕੇ, ਸਪੀਸੀਜ਼ ਵਿਭਿੰਨਤਾ, ਭਰਪੂਰਤਾ ਦੀ ਗਤੀਸ਼ੀਲਤਾ, ਅਤੇ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਆਬਾਦੀ ਦੇ ਢਾਂਚੇ ਵਿੱਚ ਬਾਰੀਕ ਸਮਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਟੈਕਸੋਨੋਮਿਕ ਅਧਿਐਨਾਂ ਤੋਂ ਪਰੇ, ਸ਼ਾਟਗਨ ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕਸ ਇੱਕ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਦ੍ਰਿਸ਼ਟੀਕੋਣ ਵੀ ਪੇਸ਼ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਨਾਲ ਏਨਕੋਡਡ ਜੀਨਾਂ ਦੀ ਖੋਜ ਅਤੇ ਵਾਤਾਵਰਣ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਵਿੱਚ ਉਹਨਾਂ ਦੀਆਂ ਭੂਮਿਕਾਵਾਂ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਇਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਅੰਤ ਵਿੱਚ, ਜੈਨੇਟਿਕ ਤੱਤਾਂ ਅਤੇ ਵਾਤਾਵਰਣਕ ਕਾਰਕਾਂ ਵਿਚਕਾਰ ਸਬੰਧਾਂ ਦੇ ਨੈਟਵਰਕ ਦੀ ਸਥਾਪਨਾ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਕਮਿਊਨਿਟੀਆਂ ਅਤੇ ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਵਾਤਾਵਰਣਕ ਪਿਛੋਕੜ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਇੰਟਰਪਲੇ ਦੀ ਇੱਕ ਸੰਪੂਰਨ ਸਮਝ ਵਿੱਚ ਯੋਗਦਾਨ ਪਾਉਂਦੀ ਹੈ। ਸਿੱਟੇ ਵਜੋਂ, ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕ ਕ੍ਰਮ ਵਿਭਿੰਨ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਕਮਿਊਨਿਟੀਆਂ ਦੀਆਂ ਜੀਨੋਮਿਕ ਪੇਚੀਦਗੀਆਂ ਨੂੰ ਖੋਲ੍ਹਣ ਲਈ ਇੱਕ ਪ੍ਰਮੁੱਖ ਸਾਧਨ ਵਜੋਂ ਖੜ੍ਹਾ ਹੈ, ਇਹਨਾਂ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਈਕੋਸਿਸਟਮ ਦੇ ਅੰਦਰ ਜੈਨੇਟਿਕਸ ਅਤੇ ਵਾਤਾਵਰਣ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਬਹੁਪੱਖੀ ਸਬੰਧਾਂ ਨੂੰ ਰੌਸ਼ਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: Illumina NovaSeq ਅਤੇ DNBSEQ-T7
-
ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ-ਟੀ.ਜੀ.ਐਸ
ਇੱਕ ਮੈਟਾਜੇਨੋਮ ਜੀਵਾਣੂਆਂ ਦੇ ਇੱਕ ਮਿਸ਼ਰਤ ਭਾਈਚਾਰੇ ਦੀ ਜੈਨੇਟਿਕ ਸਮੱਗਰੀ ਦਾ ਇੱਕ ਸੰਗ੍ਰਹਿ ਹੈ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਵਾਤਾਵਰਣ ਅਤੇ ਮਨੁੱਖੀ ਮੈਟਾਜੇਨੋਮ। ਇਸ ਵਿੱਚ ਕਾਸ਼ਤਯੋਗ ਅਤੇ ਗੈਰ ਕਾਸ਼ਤਯੋਗ ਸੂਖਮ ਜੀਵਾਂ ਦੇ ਜੀਨੋਮ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। ਮੇਟਾਜੇਨੋਮਿਕ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਟੈਕਸੋਨੋਮਿਕ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ ਤੋਂ ਵੱਧ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਕੇ ਵਾਤਾਵਰਣਿਕ ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਇਹਨਾਂ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਜੀਨੋਮਿਕ ਲੈਂਡਸਕੇਪਾਂ ਦੇ ਅਧਿਐਨ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦੀ ਹੈ। ਇਹ ਐਨਕੋਡ ਕੀਤੇ ਜੀਨਾਂ ਅਤੇ ਵਾਤਾਵਰਣ ਦੀਆਂ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਵਿੱਚ ਉਹਨਾਂ ਦੀਆਂ ਭੂਮਿਕਾਵਾਂ ਦੀ ਪੜਚੋਲ ਕਰਕੇ ਇੱਕ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਦ੍ਰਿਸ਼ਟੀਕੋਣ ਦੀ ਪੇਸ਼ਕਸ਼ ਵੀ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਜਦੋਂ ਕਿ ਇਲੁਮਿਨਾ ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ ਦੇ ਨਾਲ ਰਵਾਇਤੀ ਸ਼ਾਟਗਨ ਪਹੁੰਚਾਂ ਨੂੰ ਮੈਟੇਜਨੋਮਿਕ ਅਧਿਐਨਾਂ ਵਿੱਚ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਰਤਿਆ ਗਿਆ ਹੈ, ਨੈਨੋਪੋਰ ਅਤੇ ਪੈਕਬੀਓ ਲੰਬੇ-ਪੜ੍ਹੇ ਕ੍ਰਮ ਦੇ ਆਗਮਨ ਨੇ ਖੇਤਰ ਨੂੰ ਬਦਲ ਦਿੱਤਾ ਹੈ। ਨੈਨੋਪੋਰ ਅਤੇ ਪੈਕਬੀਓ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਡਾਊਨਸਟ੍ਰੀਮ ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣਾਂ ਨੂੰ ਵਧਾਉਂਦੀ ਹੈ, ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਮੈਟਾਜੇਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ, ਵਧੇਰੇ ਨਿਰੰਤਰ ਅਸੈਂਬਲੀਆਂ ਨੂੰ ਯਕੀਨੀ ਬਣਾਉਂਦੀਆਂ ਹਨ। ਰਿਪੋਰਟਾਂ ਦਰਸਾਉਂਦੀਆਂ ਹਨ ਕਿ ਨੈਨੋਪੋਰ-ਅਧਾਰਿਤ ਅਤੇ ਪੈਕਬਾਇਓ-ਅਧਾਰਤ ਮੈਟੇਜਨੋਮਿਕਸ ਨੇ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮਜ਼ (ਮੌਸ, ਈਐੱਲ, ਐਟ ਅਲ., ਨੇਚਰ ਬਾਇਓਟੈਕ, 2020) ਤੋਂ ਸਫਲਤਾਪੂਰਵਕ ਸੰਪੂਰਨ ਅਤੇ ਬੰਦ ਬੈਕਟੀਰੀਅਲ ਜੀਨੋਮ ਤਿਆਰ ਕੀਤੇ ਹਨ। ਨੈਨੋਪੋਰ ਰੀਡਜ਼ ਨੂੰ ਇਲੂਮਿਨਾ ਰੀਡਜ਼ ਦੇ ਨਾਲ ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਕਰਨਾ ਨੈਨੋਪੋਰ ਦੀ ਅੰਦਰੂਨੀ ਘੱਟ ਸ਼ੁੱਧਤਾ ਨੂੰ ਘਟਾਉਂਦੇ ਹੋਏ, ਗਲਤੀ ਸੁਧਾਰ ਲਈ ਇੱਕ ਰਣਨੀਤਕ ਪਹੁੰਚ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਸਿਨਰਜਿਸਟਿਕ ਸੁਮੇਲ ਸੰਭਾਵੀ ਸੀਮਾਵਾਂ ਨੂੰ ਦੂਰ ਕਰਨ ਅਤੇ ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣਾਂ ਦੀ ਸ਼ੁੱਧਤਾ ਅਤੇ ਭਰੋਸੇਯੋਗਤਾ ਨੂੰ ਅੱਗੇ ਵਧਾਉਣ ਲਈ ਇੱਕ ਮਜਬੂਤ ਹੱਲ ਪੇਸ਼ ਕਰਦੇ ਹੋਏ, ਹਰੇਕ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਪਲੇਟਫਾਰਮ ਦੀਆਂ ਸ਼ਕਤੀਆਂ ਦਾ ਲਾਭ ਉਠਾਉਂਦਾ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: Nanopore PromethION 48, Illumia ਅਤੇ PacBio Revio
-
ਪੂਰੇ ਜੀਨੋਮ ਬਿਸਲਫਾਈਟ ਕ੍ਰਮ (WGBS)
ਹੋਲ ਜੀਨੋਮ ਬਿਸਲਫਾਈਟ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (ਡਬਲਯੂ.ਜੀ.ਬੀ.ਐਸ.) ਡੀਐਨਏ ਮੈਥਾਈਲੇਸ਼ਨ ਦੀ ਡੂੰਘਾਈ ਨਾਲ ਖੋਜ ਲਈ ਸੋਨੇ ਦੇ ਮਿਆਰੀ ਵਿਧੀ ਦੇ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਖੜ੍ਹੀ ਹੈ, ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸਾਇਟੋਸਾਈਨ (5-mC) ਵਿੱਚ ਪੰਜਵਾਂ ਸਥਾਨ, ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਅਤੇ ਸੈਲੂਲਰ ਗਤੀਵਿਧੀ ਦਾ ਇੱਕ ਪ੍ਰਮੁੱਖ ਰੈਗੂਲੇਟਰ। WGBS ਦੇ ਅੰਤਰੀਵ ਸਿਧਾਂਤ ਵਿੱਚ ਬਿਸਲਫਾਈਟ ਇਲਾਜ ਸ਼ਾਮਲ ਹੁੰਦਾ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ ਮਿਥਾਈਲੇਟਿਡ ਸਾਇਟੋਸਾਈਨ ਨੂੰ ਬਿਨਾਂ ਕਿਸੇ ਬਦਲਾਅ ਦੇ ਛੱਡਦੇ ਹੋਏ, uracil (C ਤੋਂ U) ਵਿੱਚ ਬਦਲਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਤਕਨੀਕ ਸਿੰਗਲ-ਬੇਸ ਰੈਜ਼ੋਲਿਊਸ਼ਨ ਦੀ ਪੇਸ਼ਕਸ਼ ਕਰਦੀ ਹੈ, ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਨੂੰ ਮੈਥਾਈਲੋਮ ਦੀ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਜਾਂਚ ਕਰਨ ਅਤੇ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਸਥਿਤੀਆਂ, ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਕੈਂਸਰ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਅਸਧਾਰਨ ਮੈਥਾਈਲੇਸ਼ਨ ਪੈਟਰਨਾਂ ਨੂੰ ਬੇਪਰਦ ਕਰਨ ਦੀ ਇਜਾਜ਼ਤ ਦਿੰਦੀ ਹੈ। WGBS ਨੂੰ ਰੁਜ਼ਗਾਰ ਦੇ ਕੇ, ਵਿਗਿਆਨੀ ਜੀਨੋਮ-ਵਿਆਪਕ ਮੈਥਾਈਲੇਸ਼ਨ ਲੈਂਡਸਕੇਪਾਂ ਵਿੱਚ ਬੇਮਿਸਾਲ ਸਮਝ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਜੋ ਕਿ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਅਤੇ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਣ ਵਾਲੇ ਐਪੀਜੇਨੇਟਿਕ ਵਿਧੀਆਂ ਦੀ ਇੱਕ ਸੰਖੇਪ ਸਮਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ।
-
ਹਾਈ ਥ੍ਰੂਪੁੱਟ ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ (ATAC-seq) ਦੇ ਨਾਲ ਟ੍ਰਾਂਸਪੋਸੇਜ਼-ਪਹੁੰਚਯੋਗ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਲਈ ਪਰਖ
ATAC-seq ਇੱਕ ਉੱਚ-ਥਰੂਪੁੱਟ ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ ਤਕਨੀਕ ਹੈ ਜੋ ਜੀਨੋਮ-ਵਿਆਪਕ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਪਹੁੰਚਯੋਗਤਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਵਰਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ। ਇਹ ਵਰਤੋਂ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ 'ਤੇ ਗਲੋਬਲ ਐਪੀਜੇਨੇਟਿਕ ਨਿਯੰਤਰਣ ਦੇ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਤੰਤਰ ਦੀ ਡੂੰਘੀ ਸਮਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਵਿਧੀ ਇੱਕ ਹਾਈਪਰਐਕਟਿਵ Tn5 ਟ੍ਰਾਂਸਪੋਸੇਸ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਅਡਾਪਟਰਾਂ ਨੂੰ ਪਾ ਕੇ ਓਪਨ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਖੇਤਰਾਂ ਨੂੰ ਇੱਕੋ ਸਮੇਂ ਟੁਕੜੇ ਅਤੇ ਟੈਗ ਕਰਨ ਲਈ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਬਾਅਦ ਵਿੱਚ ਪੀਸੀਆਰ ਪ੍ਰਸਾਰਣ ਦੇ ਨਤੀਜੇ ਵਜੋਂ ਇੱਕ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਸਿਰਜਣਾ ਹੁੰਦੀ ਹੈ, ਜੋ ਖਾਸ ਸਪੇਸ-ਟਾਈਮ ਹਾਲਤਾਂ ਵਿੱਚ ਖੁੱਲੇ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਖੇਤਰਾਂ ਦੀ ਵਿਆਪਕ ਪਛਾਣ ਦੀ ਆਗਿਆ ਦਿੰਦੀ ਹੈ। ATAC-seq ਪਹੁੰਚਯੋਗ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਲੈਂਡਸਕੇਪਾਂ ਦਾ ਇੱਕ ਸੰਪੂਰਨ ਦ੍ਰਿਸ਼ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਉਹਨਾਂ ਤਰੀਕਿਆਂ ਦੇ ਉਲਟ ਜੋ ਸਿਰਫ਼ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨ ਫੈਕਟਰ ਬਾਈਡਿੰਗ ਸਾਈਟਾਂ ਜਾਂ ਖਾਸ ਹਿਸਟੋਨ-ਸੰਸ਼ੋਧਿਤ ਖੇਤਰਾਂ 'ਤੇ ਕੇਂਦ੍ਰਤ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਇਹਨਾਂ ਖੁੱਲ੍ਹੇ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਖੇਤਰਾਂ ਨੂੰ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਕਰਕੇ, ATAC-seq ਉਹਨਾਂ ਖੇਤਰਾਂ ਨੂੰ ਸਰਗਰਮ ਰੈਗੂਲੇਟਰੀ ਕ੍ਰਮ ਅਤੇ ਸੰਭਾਵੀ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨ ਫੈਕਟਰ ਬਾਈਡਿੰਗ ਸਾਈਟਾਂ ਦੀ ਸੰਭਾਵਨਾ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਜੋ ਜੀਨੋਮ ਵਿੱਚ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦੇ ਗਤੀਸ਼ੀਲ ਮਾਡੂਲੇਸ਼ਨ ਵਿੱਚ ਕੀਮਤੀ ਸੂਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
-
16S/18S/ITS ਐਂਪਲੀਕਨ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ-PacBio
16S ਅਤੇ 18S rRNA ਜੀਨ, ਇੰਟਰਨਲ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਾਈਬਡ ਸਪੇਸਰ (ITS) ਖੇਤਰ ਦੇ ਨਾਲ, ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਅਤੇ ਹਾਈਪਰ-ਵੇਰੀਏਬਲ ਖੇਤਰਾਂ ਦੇ ਸੁਮੇਲ ਦੇ ਕਾਰਨ ਪ੍ਰਮੁੱਖ ਅਣੂ ਫਿੰਗਰਪ੍ਰਿੰਟਿੰਗ ਮਾਰਕਰ ਵਜੋਂ ਕੰਮ ਕਰਦੇ ਹਨ, ਉਹਨਾਂ ਨੂੰ ਪ੍ਰੋਕੈਰੀਓਟਿਕ ਅਤੇ ਯੂਕੇਰੀਓਟਿਕ ਜੀਵਾਂ ਦੀ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਲਈ ਅਨਮੋਲ ਟੂਲ ਬਣਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਇਹਨਾਂ ਖੇਤਰਾਂ ਦਾ ਵਿਸਤਾਰ ਅਤੇ ਕ੍ਰਮ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਵਾਤਾਵਰਣ ਪ੍ਰਣਾਲੀਆਂ ਵਿੱਚ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਰਚਨਾ ਅਤੇ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਦੀ ਜਾਂਚ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਅਲੱਗ-ਥਲੱਗ-ਮੁਕਤ ਪਹੁੰਚ ਦੀ ਪੇਸ਼ਕਸ਼ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਜਦੋਂ ਕਿ ਇਲੂਮਿਨਾ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ 16S ਅਤੇ ITS1 ਦੇ V3-V4 ਵਰਗੇ ਛੋਟੇ ਹਾਈਪਰਵੇਰੀਏਬਲ ਖੇਤਰਾਂ ਨੂੰ ਨਿਸ਼ਾਨਾ ਬਣਾਉਂਦੀ ਹੈ, ਇਹ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਿਤ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ ਕਿ 16S, 18S, ਅਤੇ ITS ਦੀ ਪੂਰੀ ਲੰਬਾਈ ਨੂੰ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਕਰਕੇ ਉੱਤਮ ਟੈਕਸੋਨੋਮਿਕ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕੀਤੀ ਜਾ ਸਕਦੀ ਹੈ। ਇਸ ਵਿਆਪਕ ਪਹੁੰਚ ਦੇ ਨਤੀਜੇ ਵਜੋਂ ਸਹੀ ਵਰਗੀਕ੍ਰਿਤ ਕ੍ਰਮਾਂ ਦੀ ਉੱਚ ਪ੍ਰਤੀਸ਼ਤਤਾ ਹੁੰਦੀ ਹੈ, ਰੈਜ਼ੋਲੂਸ਼ਨ ਦੇ ਪੱਧਰ ਨੂੰ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਨਾ ਜੋ ਕਿ ਸਪੀਸੀਜ਼ ਦੀ ਪਛਾਣ ਤੱਕ ਫੈਲਦਾ ਹੈ। PacBio ਦਾ ਸਿੰਗਲ-ਮੌਲੀਕਿਊਲ ਰੀਅਲ-ਟਾਈਮ (SMRT) ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ ਪਲੇਟਫਾਰਮ ਬਹੁਤ ਹੀ ਸਟੀਕ ਲੰਬੇ ਰੀਡਜ਼ (HiFi) ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਕੇ ਵੱਖਰਾ ਹੈ ਜੋ ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਦੇ ਐਂਪਲੀਕਨਾਂ ਨੂੰ ਕਵਰ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਇਲੁਮਿਨਾ ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ ਦੀ ਸ਼ੁੱਧਤਾ ਦਾ ਮੁਕਾਬਲਾ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਸਮਰੱਥਾ ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਨੂੰ ਇੱਕ ਬੇਮਿਸਾਲ ਫਾਇਦਾ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਨ ਦੀ ਇਜਾਜ਼ਤ ਦਿੰਦੀ ਹੈ - ਜੈਨੇਟਿਕ ਲੈਂਡਸਕੇਪ ਦਾ ਇੱਕ ਪੈਨੋਰਾਮਿਕ ਦ੍ਰਿਸ਼। ਵਿਸਤ੍ਰਿਤ ਕਵਰੇਜ ਸਪੀਸੀਜ਼ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਵਿੱਚ ਰੈਜ਼ੋਲੂਸ਼ਨ ਨੂੰ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਉੱਚਾ ਕਰਦੀ ਹੈ, ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਜਾਂ ਫੰਗਲ ਕਮਿਊਨਿਟੀਆਂ ਦੇ ਅੰਦਰ, ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਲ ਆਬਾਦੀ ਦੀਆਂ ਪੇਚੀਦਗੀਆਂ ਦੀ ਡੂੰਘੀ ਸਮਝ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ।
-
16S/18S/ITS ਐਂਪਲੀਕਨ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ-NGS
ਇਲੂਮਿਨਾ ਟੈਕਨਾਲੋਜੀ ਦੇ ਨਾਲ ਐਮਪਲੀਕੋਨ ਕ੍ਰਮ, ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ 16S, 18S, ਅਤੇ ITS ਜੈਨੇਟਿਕ ਮਾਰਕਰਾਂ ਨੂੰ ਨਿਸ਼ਾਨਾ ਬਣਾਉਣਾ, ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਕਮਿਊਨਿਟੀਆਂ ਦੇ ਅੰਦਰ ਫਾਈਲੋਜੀਨੀ, ਵਰਗੀਕਰਨ, ਅਤੇ ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਦੀ ਭਰਪੂਰਤਾ ਨੂੰ ਖੋਲ੍ਹਣ ਲਈ ਇੱਕ ਸ਼ਕਤੀਸ਼ਾਲੀ ਤਰੀਕਾ ਹੈ। ਇਸ ਪਹੁੰਚ ਵਿੱਚ ਹਾਊਸਕੀਪਿੰਗ ਜੈਨੇਟਿਕ ਮਾਰਕਰਾਂ ਦੇ ਹਾਈਪਰਵੇਰੀਏਬਲ ਖੇਤਰਾਂ ਨੂੰ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਕਰਨਾ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ। ਦੁਆਰਾ ਮੂਲ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਅਣੂ ਫਿੰਗਰਪ੍ਰਿੰਟ ਵਜੋਂ ਪੇਸ਼ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀਵੌਇਸਸ ਐਟ ਅਲ1977 ਵਿੱਚ, ਇਸ ਤਕਨੀਕ ਨੇ ਅਲੱਗ-ਥਲੱਗ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣਾਂ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਕਰਕੇ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ ਵਿੱਚ ਕ੍ਰਾਂਤੀ ਲਿਆ ਦਿੱਤੀ ਹੈ। 16S (ਬੈਕਟੀਰੀਆ), 18S (ਫੰਜਾਈ), ਅਤੇ ਇੰਟਰਨਲ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਾਈਬਡ ਸਪੇਸਰ (ITS, ਫੰਜਾਈ) ਦੇ ਕ੍ਰਮ ਦੁਆਰਾ, ਖੋਜਕਰਤਾ ਨਾ ਸਿਰਫ਼ ਭਰਪੂਰ ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਸਗੋਂ ਦੁਰਲੱਭ ਅਤੇ ਅਣਪਛਾਤੀ ਕਿਸਮਾਂ ਦੀ ਵੀ ਪਛਾਣ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ। ਇੱਕ ਪ੍ਰਮੁੱਖ ਸਾਧਨ ਵਜੋਂ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਅਪਣਾਇਆ ਗਿਆ, ਐਂਪਲੀਕਨ ਸੀਕੈਂਸਿੰਗ ਮਨੁੱਖੀ ਮੂੰਹ, ਅੰਤੜੀਆਂ, ਟੱਟੀ ਅਤੇ ਇਸ ਤੋਂ ਪਰੇ ਸਮੇਤ ਵਿਭਿੰਨ ਵਾਤਾਵਰਣਾਂ ਵਿੱਚ ਵਿਭਿੰਨ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਲ ਰਚਨਾਵਾਂ ਨੂੰ ਸਮਝਣ ਲਈ ਸਹਾਇਕ ਬਣ ਗਈ ਹੈ।
-
ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਅਤੇ ਫੰਗਲ ਹੋਲ ਜੀਨੋਮ ਰੀ-ਸੀਕੈਂਸਿੰਗ
ਬੈਕਟੀਰੀਅਲ ਅਤੇ ਫੰਗਲ ਪੂਰੇ-ਜੀਨੋਮ ਰੀ-ਸੀਕੈਂਸਿੰਗ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਜੀਨੋਮਜ਼ ਦੀ ਸੰਪੂਰਨਤਾ ਅਤੇ ਤੁਲਨਾ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾ ਕੇ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਨੂੰ ਅੱਗੇ ਵਧਾਉਣ ਲਈ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹਨ। ਇਹ ਫਰਮੈਂਟੇਸ਼ਨ ਇੰਜੀਨੀਅਰਿੰਗ, ਉਦਯੋਗਿਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਦੇ ਅਨੁਕੂਲਨ, ਅਤੇ ਸੈਕੰਡਰੀ ਮੈਟਾਬੋਲਿਜ਼ਮ ਮਾਰਗਾਂ ਦੀ ਖੋਜ ਦੀ ਸਹੂਲਤ ਦਿੰਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ, ਦਵਾਈ, ਖੇਤੀਬਾੜੀ, ਅਤੇ ਵਾਤਾਵਰਣ ਵਿਗਿਆਨ ਵਿੱਚ ਵਿਆਪਕ ਪ੍ਰਭਾਵਾਂ ਦੇ ਨਾਲ, ਵਾਤਾਵਰਣ ਅਨੁਕੂਲਤਾ ਨੂੰ ਸਮਝਣ, ਤਣਾਅ ਨੂੰ ਅਨੁਕੂਲ ਬਣਾਉਣ, ਅਤੇ ਜੈਨੇਟਿਕ ਵਿਕਾਸ ਦੀ ਗਤੀਸ਼ੀਲਤਾ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਨ ਲਈ ਉੱਲੀ ਅਤੇ ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਦੀ ਮੁੜ-ਕ੍ਰਮਬੱਧਤਾ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹੈ।
-
PacBio-ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ 16S/18S/ITS ਐਂਪਲੀਕਨ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ
ਐਮਪਲੀਕਨ (16S/18S/ITS) ਪਲੇਟਫਾਰਮ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਸਾਲਾਂ ਦੇ ਤਜ਼ਰਬੇ ਨਾਲ ਵਿਕਸਤ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਮਿਆਰੀ ਬੁਨਿਆਦੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ: ਬੁਨਿਆਦੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਮੌਜੂਦਾ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਖੋਜ ਦੀ ਮੁੱਖ ਧਾਰਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਸਮੱਗਰੀ ਨੂੰ ਕਵਰ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਸਮੱਗਰੀ ਅਮੀਰ ਅਤੇ ਵਿਆਪਕ ਹੈ, ਅਤੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੇ ਨਤੀਜੇ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਰਿਪੋਰਟਾਂ ਦੇ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਪੇਸ਼ ਕੀਤੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ; ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੀ ਸਮੱਗਰੀ ਵਿਭਿੰਨ ਹੈ. ਨਮੂਨੇ ਚੁਣੇ ਜਾ ਸਕਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਲੋੜਾਂ ਨੂੰ ਮਹਿਸੂਸ ਕਰਨ ਲਈ, ਬੁਨਿਆਦੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਰਿਪੋਰਟ ਅਤੇ ਖੋਜ ਉਦੇਸ਼ ਦੇ ਅਨੁਸਾਰ ਮਾਪਦੰਡਾਂ ਨੂੰ ਲਚਕਦਾਰ ਢੰਗ ਨਾਲ ਸੈੱਟ ਕੀਤਾ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ। ਵਿੰਡੋਜ਼ ਓਪਰੇਟਿੰਗ ਸਿਸਟਮ, ਸਧਾਰਨ ਅਤੇ ਤੇਜ਼।
-
PacBio-ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ (ਗੈਰ-ਸੰਦਰਭ)
ਪੈਸੀਫਿਕ ਬਾਇਓਸਾਇੰਸਸ (PacBio) ਆਈਸੋਫਾਰਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਡੇਟਾ ਨੂੰ ਇਨਪੁਟ ਦੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਲੈ ਕੇ, ਇਹ ਐਪ ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਦੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਕ੍ਰਮ (ਅਸੈਂਬਲੀ ਤੋਂ ਬਿਨਾਂ) ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਦੇ ਯੋਗ ਹੈ। ਸੰਦਰਭ ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਦੇ ਕ੍ਰਮਾਂ ਨੂੰ ਮੈਪ ਕਰਕੇ, ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਨੂੰ ਜਾਣੇ-ਪਛਾਣੇ ਜੀਨਾਂ, ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ, ਕੋਡਿੰਗ ਖੇਤਰਾਂ, ਆਦਿ ਦੁਆਰਾ ਅਨੁਕੂਲਿਤ ਕੀਤਾ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਸਥਿਤੀ ਵਿੱਚ, mRNA ਬਣਤਰਾਂ ਦੀ ਵਧੇਰੇ ਸਹੀ ਪਛਾਣ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਵਿਕਲਪਕ ਸਪਲੀਸਿੰਗ, ਆਦਿ, ਪ੍ਰਾਪਤ ਕੀਤੀ ਜਾ ਸਕਦੀ ਹੈ। NGS ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਡੇਟਾ ਦੇ ਨਾਲ ਸੰਯੁਕਤ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਸਮੀਕਰਨ ਵਿੱਚ ਵਧੇਰੇ ਵਿਆਪਕ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਅਤੇ ਵਧੇਰੇ ਸਹੀ ਮਾਤਰਾ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ ਵੱਡੇ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਡਾਊਨਸਟ੍ਰੀਮ ਡਿਫਰੈਂਸ਼ੀਅਲ ਸਮੀਕਰਨ ਅਤੇ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੂੰ ਲਾਭ ਪਹੁੰਚਾਉਂਦਾ ਹੈ।
-
ਘਟੀ ਹੋਈ ਪ੍ਰਤੀਨਿਧਤਾ ਬਿਸਲਫਾਈਟ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (RRBS)
ਘਟੀ ਹੋਈ ਪ੍ਰਤੀਨਿਧਤਾ ਬਿਸਲਫਾਈਟ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (ਆਰਆਰਬੀਐਸ) ਡੀਐਨਏ ਮੈਥਿਲੇਸ਼ਨ ਖੋਜ ਵਿੱਚ ਹੋਲ ਜੀਨੋਮ ਬਿਸਲਫਾਈਟ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (ਡਬਲਯੂਜੀਬੀਐਸ) ਦੇ ਇੱਕ ਲਾਗਤ-ਪ੍ਰਭਾਵਸ਼ਾਲੀ ਅਤੇ ਕੁਸ਼ਲ ਵਿਕਲਪ ਵਜੋਂ ਉਭਰੀ ਹੈ। ਜਦੋਂ ਕਿ WGBS ਸਿੰਗਲ ਬੇਸ ਰੈਜ਼ੋਲਿਊਸ਼ਨ 'ਤੇ ਪੂਰੇ ਜੀਨੋਮ ਦੀ ਜਾਂਚ ਕਰਕੇ ਵਿਆਪਕ ਸੂਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਇਸਦੀ ਉੱਚ ਕੀਮਤ ਇੱਕ ਸੀਮਤ ਕਾਰਕ ਹੋ ਸਕਦੀ ਹੈ। RRBS ਰਣਨੀਤਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਪ੍ਰਤੀਨਿਧੀ ਹਿੱਸੇ ਦਾ ਚੋਣਵੇਂ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਕੇ ਇਸ ਚੁਣੌਤੀ ਨੂੰ ਘੱਟ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਵਿਧੀ MspI ਕਲੀਵੇਜ ਦੁਆਰਾ CpG ਟਾਪੂ-ਅਮੀਰ ਖੇਤਰਾਂ ਦੇ ਸੰਸ਼ੋਧਨ 'ਤੇ ਨਿਰਭਰ ਕਰਦੀ ਹੈ ਅਤੇ 200-500/600 bps ਟੁਕੜਿਆਂ ਦੇ ਆਕਾਰ ਦੀ ਚੋਣ ਦੁਆਰਾ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ। ਸਿੱਟੇ ਵਜੋਂ, ਸਿਰਫ਼ CpG ਟਾਪੂਆਂ ਦੇ ਨਜ਼ਦੀਕੀ ਖੇਤਰਾਂ ਨੂੰ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ, ਜਦੋਂ ਕਿ ਦੂਰ ਦੇ CpG ਟਾਪੂਆਂ ਵਾਲੇ ਖੇਤਰਾਂ ਨੂੰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਤੋਂ ਬਾਹਰ ਰੱਖਿਆ ਗਿਆ ਹੈ। ਇਹ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ, ਬਾਈਸਲਫਾਈਟ ਕ੍ਰਮ ਦੇ ਨਾਲ ਮਿਲ ਕੇ, ਡੀਐਨਏ ਮੈਥਾਈਲੇਸ਼ਨ ਦੇ ਉੱਚ-ਰੈਜ਼ੋਲੂਸ਼ਨ ਖੋਜ ਦੀ ਆਗਿਆ ਦਿੰਦੀ ਹੈ, ਅਤੇ ਸੀਕੈਂਸਿੰਗ ਪਹੁੰਚ, PE150, ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਮੱਧ ਦੀ ਬਜਾਏ ਸੰਮਿਲਨਾਂ ਦੇ ਸਿਰਿਆਂ 'ਤੇ ਕੇਂਦ੍ਰਤ ਕਰਦੀ ਹੈ, ਮਿਥਾਈਲੇਸ਼ਨ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ ਦੀ ਕੁਸ਼ਲਤਾ ਨੂੰ ਵਧਾਉਂਦੀ ਹੈ। RRBS ਇੱਕ ਅਨਮੋਲ ਟੂਲ ਹੈ ਜੋ ਕਿ ਲਾਗਤ-ਪ੍ਰਭਾਵਸ਼ਾਲੀ ਡੀਐਨਏ ਮੈਥਾਈਲੇਸ਼ਨ ਖੋਜ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਐਪੀਜੇਨੇਟਿਕ ਵਿਧੀਆਂ ਦੇ ਗਿਆਨ ਨੂੰ ਅੱਗੇ ਵਧਾਉਂਦਾ ਹੈ।
-
ਪ੍ਰੋਕੈਰੀਓਟਿਕ ਆਰਐਨਏ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ
ਆਰਐਨਏ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਖਾਸ ਸ਼ਰਤਾਂ ਅਧੀਨ ਸੈੱਲਾਂ ਦੇ ਅੰਦਰ ਸਾਰੇ ਆਰਐਨਏ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਦੀ ਵਿਆਪਕ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ ਨੂੰ ਸ਼ਕਤੀ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਇਹ ਅਤਿ-ਆਧੁਨਿਕ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਇੱਕ ਸ਼ਕਤੀਸ਼ਾਲੀ ਸਾਧਨ ਵਜੋਂ ਕੰਮ ਕਰਦੀ ਹੈ, ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਾਂ, ਜੀਨ ਬਣਤਰਾਂ, ਅਤੇ ਵਿਭਿੰਨ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਅਣੂ ਵਿਧੀਆਂ ਦਾ ਪਰਦਾਫਾਸ਼ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਬੁਨਿਆਦੀ ਖੋਜ, ਕਲੀਨਿਕਲ ਡਾਇਗਨੌਸਟਿਕਸ, ਅਤੇ ਡਰੱਗ ਡਿਵੈਲਪਮੈਂਟ ਵਿੱਚ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਅਪਣਾਇਆ ਗਿਆ, ਆਰਐਨਏ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਸੈਲੂਲਰ ਗਤੀਸ਼ੀਲਤਾ ਅਤੇ ਜੈਨੇਟਿਕ ਰੈਗੂਲੇਸ਼ਨ ਦੀਆਂ ਪੇਚੀਦਗੀਆਂ ਵਿੱਚ ਸਮਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਸਾਡੀ ਪ੍ਰੋਕੈਰੀਓਟਿਕ ਆਰਐਨਏ ਨਮੂਨਾ ਪ੍ਰੋਸੈਸਿੰਗ ਪ੍ਰੋਕੈਰੀਓਟਿਕ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮਜ਼ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤੀ ਗਈ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਆਰਆਰਐਨਏ ਦੀ ਕਮੀ ਅਤੇ ਦਿਸ਼ਾਤਮਕ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਤਿਆਰੀ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: Illumina NovaSeq
-
ਮੈਟਾਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ
ਇਲੂਮਿਨਾ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਟੈਕਨਾਲੋਜੀ ਦਾ ਲਾਭ ਉਠਾਉਂਦੇ ਹੋਏ, BMKGENE ਦੀ ਮੈਟਾਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਸੇਵਾ ਮਿੱਟੀ, ਪਾਣੀ, ਸਮੁੰਦਰ, ਟੱਟੀ, ਅਤੇ ਅੰਤੜੀਆਂ ਵਰਗੇ ਕੁਦਰਤੀ ਵਾਤਾਵਰਣਾਂ ਦੇ ਅੰਦਰ, ਯੂਕੇਰੀਓਟਸ ਤੋਂ ਪ੍ਰੋਕੈਰੀਓਟਸ ਅਤੇ ਵਾਇਰਸਾਂ ਤੱਕ ਫੈਲਣ ਵਾਲੇ ਰੋਗਾਣੂਆਂ ਦੀ ਵਿਭਿੰਨ ਲੜੀ ਦੇ ਗਤੀਸ਼ੀਲ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦਾ ਪਰਦਾਫਾਸ਼ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਸਾਡੀ ਵਿਆਪਕ ਸੇਵਾ ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਨੂੰ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਲ ਕਮਿਊਨਿਟੀਆਂ ਦੇ ਸੰਪੂਰਨ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਾਂ ਦੀ ਖੋਜ ਕਰਨ ਲਈ ਸ਼ਕਤੀ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਟੈਕਸੋਨੋਮਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਤੋਂ ਪਰੇ, ਸਾਡੀ ਮੈਟਾਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਸੇਵਾ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਵਿੱਚ ਖੋਜ ਦੀ ਸਹੂਲਤ ਦਿੰਦੀ ਹੈ, ਵਿਭਿੰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਜੀਨਾਂ ਅਤੇ ਉਹਨਾਂ ਦੀਆਂ ਭੂਮਿਕਾਵਾਂ 'ਤੇ ਰੌਸ਼ਨੀ ਪਾਉਂਦੀ ਹੈ। ਜਦੋਂ ਤੁਸੀਂ ਇਹਨਾਂ ਵਿਭਿੰਨ ਵਾਤਾਵਰਣਿਕ ਸਥਾਨਾਂ ਦੇ ਅੰਦਰ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ, ਵਰਗੀਕਰਨ ਵਿਭਿੰਨਤਾ, ਅਤੇ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਗਤੀਸ਼ੀਲਤਾ ਦੇ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਲੈਂਡਸਕੇਪਾਂ ਨੂੰ ਨੈਵੀਗੇਟ ਕਰਦੇ ਹੋ ਤਾਂ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਸੂਝ-ਬੂਝ ਦੇ ਭੰਡਾਰ ਨੂੰ ਉਜਾਗਰ ਕਰੋ।
-
ਡੀ ਨੋਵੋ ਫੰਗਲ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ
BMKGENE ਫੰਗਲ ਜੀਨੋਮ ਲਈ ਬਹੁਪੱਖੀ ਹੱਲ ਪੇਸ਼ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਵਿਭਿੰਨ ਖੋਜ ਲੋੜਾਂ ਅਤੇ ਲੋੜੀਂਦੇ ਜੀਨੋਮ ਸੰਪੂਰਨਤਾ ਨੂੰ ਪੂਰਾ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਕੱਲੇ ਛੋਟੇ-ਪੜ੍ਹੇ ਇਲੂਮਿਨਾ ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਨਾ ਇੱਕ ਡਰਾਫਟ ਜੀਨੋਮ ਬਣਾਉਣ ਦੀ ਆਗਿਆ ਦਿੰਦਾ ਹੈ। ਨੈਨੋਪੋਰ ਜਾਂ ਪੈਕਬੀਓ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਛੋਟੇ-ਪੜ੍ਹੇ ਅਤੇ ਲੰਬੇ-ਪੜ੍ਹੇ ਜਾਣ ਵਾਲੇ ਕ੍ਰਮ ਨੂੰ ਲੰਬੇ ਕੰਨਟੀਗਸ ਦੇ ਨਾਲ ਇੱਕ ਵਧੇਰੇ ਸ਼ੁੱਧ ਫੰਗਲ ਜੀਨੋਮ ਲਈ ਜੋੜਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ, ਹਾਈ-ਸੀ ਕ੍ਰਮ ਨੂੰ ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਕਰਨਾ ਸਮਰੱਥਾਵਾਂ ਨੂੰ ਹੋਰ ਵਧਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਇੱਕ ਸੰਪੂਰਨ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ-ਪੱਧਰ ਦੇ ਜੀਨੋਮ ਦੀ ਪ੍ਰਾਪਤੀ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ।
