ਹੀਟਮੈਪ
ਹੀਟਮੈਪ ਟੂਲ ਇੱਕ ਮੈਟ੍ਰਿਕਸ ਡੇਟਾ ਫਾਈਲ ਨੂੰ ਇਨਪੁਟ ਵਜੋਂ ਸਵੀਕਾਰ ਕਰਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਉਪਭੋਗਤਾਵਾਂ ਨੂੰ ਡੇਟਾ ਨੂੰ ਫਿਲਟਰ ਕਰਨ, ਆਮ ਬਣਾਉਣ ਅਤੇ ਕਲੱਸਟਰ ਕਰਨ ਦੀ ਆਗਿਆ ਦਿੰਦਾ ਹੈ। ਹੀਟਮੈਪ ਲਈ ਪ੍ਰਾਇਮਰੀ ਵਰਤੋਂ ਦਾ ਕੇਸ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿਚਕਾਰ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਪੱਧਰ ਦਾ ਕਲੱਸਟਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਹੈ।
ਜੀਨ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ
ਜੀਨ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਟੂਲ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਡੇਟਾਬੇਸ ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ ਇਨਪੁਟ ਫਾਸਟਾ ਫਾਈਲਾਂ ਦੇ ਕ੍ਰਮ ਅਲਾਈਨਮੈਂਟ ਦੇ ਅਧਾਰ ਤੇ ਜੀਨ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਬੇਸਿਕ ਲੋਕਲ ਅਲਾਈਨਮੈਂਟ ਸਰਚ ਟੂਲ (BLAST)
BLAST ਟੂਲ NCBI BLAST ਦਾ ਇੱਕ BMKCloud ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਸੰਸਕਰਣ ਹੈ ਅਤੇ BMKCloud ਖਾਤੇ ਵਿੱਚ ਅੱਪਲੋਡ ਕੀਤੇ ਗਏ ਡੇਟਾ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ ਉਹੀ ਫੰਕਸ਼ਨ ਕਰਨ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ।
CDS_UTR ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ
CDS_UTR ਪੂਰਵ-ਅਨੁਮਾਨ ਟੂਲ ਨੂੰ ਜਾਣੇ-ਪਛਾਣੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਡੇਟਾਬੇਸ ਅਤੇ ORF ਪੂਰਵ-ਅਨੁਮਾਨ ਦੇ ਨਤੀਜਿਆਂ ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ BLAST ਨਤੀਜਿਆਂ ਦੇ ਆਧਾਰ 'ਤੇ ਦਿੱਤੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਕ੍ਰਮਾਂ ਵਿੱਚ ਕੋਡਿੰਗ ਖੇਤਰਾਂ (CDS) ਅਤੇ ਗੈਰ-ਕੋਡਿੰਗ ਖੇਤਰਾਂ (UTR) ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ ਕਰਨ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ।
ਮੈਨਹਟਨ ਪਲਾਟ
ਮੈਨਹਟਨ ਪਲਾਟ ਟੂਲ ਉੱਚ ਨਮੂਨੇ ਦੇ ਪ੍ਰਯੋਗਾਂ ਦੇ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਨ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਜੀਨੋਮ-ਵਾਈਡ ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨ ਅਧਿਐਨ (GWAS) ਵਿੱਚ ਵਰਤਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।
ਸਰਕੋਸ ਡਾਇਗ੍ਰਾਮ
CIRCOS ਡਾਇਗ੍ਰਾਮ ਟੂਲ ਇਸ ਗੱਲ ਦਾ ਕੁਸ਼ਲ ਦ੍ਰਿਸ਼ਟੀਕੋਣ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ ਕਿ ਜੀਨੋਮਿਕ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਨੂੰ ਜੀਨੋਮ ਵਿੱਚ ਕਿਵੇਂ ਵੰਡਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਆਮ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਵਿੱਚ ਮਾਤਰਾਤਮਕ ਸਥਾਨ, SNPs, InDels, ਢਾਂਚਾਗਤ ਅਤੇ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਵੇਰੀਐਂਟ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ।
ਜੀਨ ਓਨਟੋਲੋਜੀ (ਜੀਓ) ਸੰਸ਼ੋਧਨ
GO ਐਨਰਿਚਮੈਂਟ ਟੂਲ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਟੂਲ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਾਇਮਰੀ ਸੌਫਟਵੇਅਰ ਟੌਪਜੀਓ-ਬਾਇਓਕੰਡਕਟਰ ਪੈਕੇਜ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਜੀਓ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਨਤੀਜਿਆਂ ਦੀ ਵਿਜ਼ੂਅਲਾਈਜ਼ੇਸ਼ਨ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ।
ਵੇਟਿਡ ਜੀਨ ਕੋ-ਐਕਸਪ੍ਰੇਸ਼ਨ ਨੈੱਟਵਰਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (WGCNA)
WGCNA ਜੀਨ ਕੋ-ਐਕਸਪ੍ਰੇਸ਼ਨ ਮੋਡੀਊਲ ਦੀ ਖੋਜ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਰਤਿਆ ਜਾਣ ਵਾਲਾ ਡਾਟਾ ਮਾਈਨਿੰਗ ਤਰੀਕਾ ਹੈ। ਇਹ ਮਾਈਕ੍ਰੋਏਰੇ ਅਤੇ NGS ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਡੇਟਾ ਸਮੇਤ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਸਮੀਕਰਨ ਡੇਟਾਸੈੱਟ 'ਤੇ ਲਾਗੂ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।
ਇੰਟਰਪ੍ਰੋਸਕੈਨ
ਇੰਟਰਪ੍ਰੋਸਕੈਨ ਟੂਲ ਇੰਟਰਪ੍ਰੋ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਕ੍ਰਮ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਵਰਗੀਕਰਨ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
KEGG Enrichment 'ਤੇ ਜਾਓ
GO KEGG ਐਨਰੀਚਮੈਂਟ ਟੂਲ ਇੱਕ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕੀਤੇ ਜੀਨ ਸੈੱਟ ਅਤੇ ਸੰਬੰਧਿਤ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਦੇ ਆਧਾਰ 'ਤੇ ਇੱਕ GO ਐਨਰੀਚਮੈਂਟ ਹਿਸਟੋਗ੍ਰਾਮ, ਕੇਈਜੀਜੀ ਐਨਰੀਚਮੈਂਟ ਹਿਸਟੋਗ੍ਰਾਮ ਅਤੇ ਕੇਈਜੀਜੀ ਐਨਰੀਚਮੈਂਟ ਪਾਥਵੇਅ ਬਣਾਉਣ ਲਈ ਡਿਜ਼ਾਈਨ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ।