ਪੌਦਾ/ਜਾਨਵਰ ਸੰਪੂਰਨ ਜੀਨੋਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ
ਸੇਵਾ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ
● ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਤਿਆਰੀ ਮਿਆਰੀ ਜਾਂ PCR-ਮੁਕਤ ਹੋ ਸਕਦੀ ਹੈ
● 4 ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਪਲੇਟਫਾਰਮਾਂ ਵਿੱਚ ਉਪਲਬਧ: Illumina NovaSeq, MGI T7, Nanopore Promethion P48, ਜਾਂ PacBio Revio।
● ਰੂਪਾਂ ਦੀ ਖੋਜ 'ਤੇ ਕੇਂਦ੍ਰਿਤ ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ: SNP, InDel, SV ਅਤੇ CNV
ਸੇਵਾ ਦੇ ਫਾਇਦੇ
●ਵਿਆਪਕ ਮਹਾਰਤ ਅਤੇ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਨ ਰਿਕਾਰਡ: 1000 ਤੋਂ ਵੱਧ ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਲਈ ਜੀਨੋਮ ਕ੍ਰਮ ਵਿੱਚ ਸੰਚਿਤ ਤਜਰਬੇ ਦੇ ਨਤੀਜੇ ਵਜੋਂ 5000 ਤੋਂ ਵੱਧ ਦੇ ਸੰਚਤ ਪ੍ਰਭਾਵ ਕਾਰਕ ਦੇ ਨਾਲ 1000 ਤੋਂ ਵੱਧ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਿਤ ਕੇਸ ਹੋਏ ਹਨ।
●ਵਿਆਪਕ ਬਾਇਓਇਨਫੋਰਮੈਟਿਕਸ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ: ਪਰਿਵਰਤਨ ਕਾਲਿੰਗ ਅਤੇ ਫੰਕਸ਼ਨ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਸਮੇਤ।
● ਵਿਕਰੀ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਸਹਾਇਤਾ:ਸਾਡੀ ਵਚਨਬੱਧਤਾ 3-ਮਹੀਨੇ ਦੀ ਵਿਕਰੀ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਸੇਵਾ ਦੀ ਮਿਆਦ ਦੇ ਨਾਲ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਦੇ ਮੁਕੰਮਲ ਹੋਣ ਤੋਂ ਪਰੇ ਹੈ। ਇਸ ਸਮੇਂ ਦੌਰਾਨ, ਅਸੀਂ ਨਤੀਜਿਆਂ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਕਿਸੇ ਵੀ ਪ੍ਰਸ਼ਨਾਂ ਨੂੰ ਹੱਲ ਕਰਨ ਲਈ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਫਾਲੋ-ਅਪ, ਸਮੱਸਿਆ ਨਿਪਟਾਰਾ ਸਹਾਇਤਾ, ਅਤੇ ਪ੍ਰਸ਼ਨ ਅਤੇ ਉੱਤਰ ਸੈਸ਼ਨ ਦੀ ਪੇਸ਼ਕਸ਼ ਕਰਦੇ ਹਾਂ।
●ਵਿਆਪਕ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ: ਅਸੀਂ ਪਛਾਣੀਆਂ ਗਈਆਂ ਭਿੰਨਤਾਵਾਂ ਦੇ ਨਾਲ ਜੀਨਾਂ ਨੂੰ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਤੌਰ 'ਤੇ ਐਨੋਟੇਟ ਕਰਨ ਲਈ ਕਈ ਡੇਟਾਬੇਸ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹਾਂ ਅਤੇ ਸੰਬੰਧਿਤ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਦੇ ਹਾਂ, ਕਈ ਖੋਜ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟਾਂ 'ਤੇ ਸੂਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੇ ਹਾਂ।
ਸੇਵਾ ਨਿਰਧਾਰਨ
| ਰੂਪਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ ਜਾਣੀ ਹੈ | ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਰਣਨੀਤੀ | ਸਿਫਾਰਸ਼ ਕੀਤੀ ਡੂੰਘਾਈ |
| SNP ਅਤੇ InDel | Illumina NovaSeq PE150 ਜਾਂ MGI T7 | 10x |
| SV ਅਤੇ CNV (ਘੱਟ ਸਹੀ) | 30 ਗੁਣਾ | |
| SV ਅਤੇ CNV (ਵਧੇਰੇ ਸਹੀ) | ਨੈਨੋਪੋਰ ਪ੍ਰੋਮ P48 | 20x |
| SNPs, Indels, SV ਅਤੇ CNV | PacBio Revio | 10x |
ਨਮੂਨਾ ਲੋੜਾਂ
| ਟਿਸ਼ੂ ਜਾਂ ਐਕਸਟਰੈਕਟ ਕੀਤੇ ਨਿਊਕਲੀਕ ਐਸਿਡ | ਇਲੂਮਿਨਾ/ਐਮਜੀਆਈ | ਨੈਨੋਪੋਰ | PacBio
| ||
| ਪਸ਼ੂ ਵਿਸੇਰਾ | 0.5-1 ਜੀ | ≥ 3.5 ਗ੍ਰਾਮ
| ≥ 3.5 ਗ੍ਰਾਮ
| ||
| ਜਾਨਵਰ ਮਾਸਪੇਸ਼ੀ | ≥ 5 ਗ੍ਰਾਮ
| ≥ 5 ਗ੍ਰਾਮ
| |||
| ਥਣਧਾਰੀ ਖੂਨ | 1.5 ਮਿ.ਲੀ | ≥ 0.5 ਮਿ.ਲੀ
| ≥ 5 ਮਿ.ਲੀ
| ||
| ਪੋਲਟਰੀ/ਮੱਛੀ ਦਾ ਖੂਨ | ≥ 0.1 ਮਿ.ਲੀ
| ≥ 0.5 ਮਿ.ਲੀ
| |||
| ਪੌਦਾ - ਤਾਜ਼ੇ ਪੱਤੇ | 1-2 ਜੀ | ≥ 2 ਗ੍ਰਾਮ
| ≥ 5 ਗ੍ਰਾਮ
| ||
| ਸੰਸਕ੍ਰਿਤ ਸੈੱਲ |
| ≥ 1x107
| ≥ 1x108
| ||
| ਕੀੜੇ ਨਰਮ ਟਿਸ਼ੂ/ਵਿਅਕਤੀਗਤ | 0.5-1 ਜੀ | ≥ 1 ਗ੍ਰਾਮ
| ≥ 3 ਗ੍ਰਾਮ
| ||
| ਡੀਐਨਏ ਕੱਢਿਆ
| ਇਕਾਗਰਤਾ: ≥ 1 ng/ µL ਮਾਤਰਾ: ≥ 30 ਐੱਨ.ਜੀ ਸੀਮਤ ਜਾਂ ਕੋਈ ਪਤਨ ਜਾਂ ਗੰਦਗੀ ਨਹੀਂ
| ਇਕਾਗਰਤਾ ਰਕਮ
OD260/280
OD260/230
ਸੀਮਤ ਜਾਂ ਕੋਈ ਪਤਨ ਜਾਂ ਗੰਦਗੀ ਨਹੀਂ
| ≥ 40 ng/ µL 4 µg/ਫਲੋ ਸੈੱਲ/ਨਮੂਨਾ
1.7-2.2
≥1.5 | ਇਕਾਗਰਤਾ ਰਕਮ
OD260/280
OD260/230
ਸੀਮਤ ਜਾਂ ਕੋਈ ਪਤਨ ਜਾਂ ਗੰਦਗੀ ਨਹੀਂ | ≥ 50 ng/ µL 10 µg/ਫਲੋ ਸੈੱਲ/ਨਮੂਨਾ
1.7-2.2
1.8-2.5 |
| PCR-ਮੁਕਤ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਤਿਆਰੀ: ਗਾੜ੍ਹਾਪਣ≥ 40 ng/ µL ਮਾਤਰਾ≥ 500 ਐੱਨ.ਜੀ | |||||
ਸੇਵਾ ਕਾਰਜ ਪ੍ਰਵਾਹ
ਨਮੂਨਾ ਡਿਲੀਵਰੀ
ਡੀਐਨਏ ਕੱਢਣ
ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਉਸਾਰੀ
ਕ੍ਰਮਬੱਧ
ਡਾਟਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
ਡਾਟਾ ਡਿਲੀਵਰੀ
ਹੇਠ ਦਿੱਤੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ:
- ਕੱਚਾ ਡਾਟਾ ਗੁਣਵੱਤਾ ਕੰਟਰੋਲ
- ਹਵਾਲਾ ਜੀਨੋਮ ਲਈ ਅਲਾਈਨਮੈਂਟ ਦੇ ਅੰਕੜੇ
- ਵੇਰੀਐਂਟ ਪਛਾਣ: SNP, InDel, SV ਅਤੇ CNV
- ਰੂਪਾਂ ਦੀ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ
ਸੰਦਰਭ ਜੀਨੋਮ ਲਈ ਅਲਾਈਨਮੈਂਟ ਦੇ ਅੰਕੜੇ - ਕ੍ਰਮ ਡੂੰਘਾਈ ਵੰਡ
ਕਈ ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ SNP ਕਾਲਿੰਗ
InDel ਪਛਾਣ - CDS ਖੇਤਰ ਅਤੇ ਜੀਨੋਮ-ਵਿਆਪਕ ਖੇਤਰ ਵਿੱਚ InDel ਲੰਬਾਈ ਦੇ ਅੰਕੜੇ
ਜੀਨੋਮ ਵਿੱਚ ਵੇਰੀਐਂਟ ਡਿਸਟ੍ਰੀਬਿਊਸ਼ਨ - ਸਰਕੋਸ ਪਲਾਟ
ਪਛਾਣੇ ਗਏ ਰੂਪਾਂ ਦੇ ਨਾਲ ਜੀਨਾਂ ਦੀ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਵਿਆਖਿਆ - ਜੀਨ ਓਨਟੋਲੋਜੀ
ਚਾਈ, ਕਿਊ. ਆਦਿ. (2023) 'A glutathione S-transferase GhTT19 ਕਪਾਹ ਵਿੱਚ ਐਂਥੋਸਾਈਨਿਨ ਇਕੱਠਾ ਕਰਨ ਨੂੰ ਨਿਯਮਤ ਕਰਨ ਦੁਆਰਾ ਫੁੱਲਾਂ ਦੀਆਂ ਪੱਤੀਆਂ ਦੇ ਪਿਗਮੈਂਟੇਸ਼ਨ ਨੂੰ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕਰਦਾ ਹੈ', ਪਲਾਂਟ ਬਾਇਓਟੈਕਨਾਲੋਜੀ ਜਰਨਲ, 21(2), ਪੀ. 433. doi: 10.1111/PBI.13965.
ਚੇਂਗ, ਐੱਚ. ਐਟ ਅਲ. (2023) 'ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ-ਪੱਧਰ ਦਾ ਜੰਗਲੀ ਹੇਵੀਆ ਬ੍ਰਾਸੀਲੀਨਿਸ ਜੀਨੋਮ ਰਬੜ ਦੀ ਉਪਜ ਨੂੰ ਉੱਚਾ ਚੁੱਕਣ ਲਈ ਜੀਨੋਮਿਕ-ਸਹਾਇਤਾ ਪ੍ਰਾਪਤ ਪ੍ਰਜਨਨ ਅਤੇ ਕੀਮਤੀ ਸਥਾਨਾਂ ਲਈ ਨਵੇਂ ਸਾਧਨ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ', ਪਲਾਂਟ ਬਾਇਓਟੈਕਨਾਲੋਜੀ ਜਰਨਲ, 21(5), ਪੀ.ਪੀ. 1058–1072। doi: 10.1111/PBI.14018.
ਲੀ, ਏ. ਆਦਿ. (2021) 'ਜੀਨੋਮ ਆਫ਼ ਦਾ ਈਸਟੁਆਰਾਈਨ ਓਇਸਟਰ ਜਲਵਾਯੂ ਪ੍ਰਭਾਵ ਅਤੇ ਅਨੁਕੂਲ ਪਲਾਸਟਿਕਤਾ ਦੀ ਜਾਣਕਾਰੀ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ', ਸੰਚਾਰ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ 2021 4:1, 4(1), ਪੀ.ਪੀ. 1-12। doi: 10.1038/s42003-021-02823-6.
ਜ਼ੇਂਗ, ਟੀ. ਐਟ ਅਲ. (2022) 'ਸਮੇਂ ਦੇ ਨਾਲ ਚੀਨੀ ਸਵਦੇਸ਼ੀ ਮੁਰਗੀਆਂ ਵਿੱਚ ਜੀਨੋਮ ਅਤੇ ਮੈਥਿਲੇਸ਼ਨ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਸਪੀਸੀਜ਼ ਕੰਜ਼ਰਵੇਸ਼ਨ ਵਿੱਚ ਸਮਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ', ਸੰਚਾਰ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ, 5(1), ਪੀਪੀ. 1-12। doi: 10.1038/s42003-022-03907-7.
