ਪੈਕਬੀਓ ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ

PacBio ਫੁੱਲ-ਲੰਬਾਈ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ, Isoseq, ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਆਈਸੋਫਾਰਮ ਦੀ ਸਹੀ ਪਛਾਣ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਵਿਕਲਪਕ ਪੌਲੀਏਡੀਨਿਲੇਸ਼ਨ ਅਤੇ ਸਪਲੀਸਿੰਗ 'ਤੇ ਰੌਸ਼ਨੀ ਪਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਅਤੇ ਵਧੇਰੇ ਸਹੀ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵੱਲ ਅਗਵਾਈ ਕਰਦਾ ਹੈ। BMKCloud PacBio ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਪਾਈਪਲਾਈਨ ਨੂੰ ਸਰਕੂਲਰ ਸਹਿਮਤੀ ਕ੍ਰਮ (CCS) ਮੋਡ ਵਿੱਚ ਕ੍ਰਮਬੱਧ cDNA ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀਆਂ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ ਅਤੇ ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਦੇ ਗੈਰ-ਚਿਮੇਰਿਕ (FLNC) ਕ੍ਰਮਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਜੋ ਫਿਰ ਗੈਰ-ਰਿਡੰਡੈਂਟ ਟਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਵਿੱਚ ਕਲੱਸਟਰ ਕੀਤੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ। ਇੱਕ ਬਾਅਦ ਵਿੱਚ BUSCO ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਦੀ ਸੰਪੂਰਨਤਾ ਦਾ ਮੁਲਾਂਕਣ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਅਸੈਂਬਲਡ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ ਤੋਂ, ਮਲਟੀਪਲ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕੀਤੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ: ਵਿਕਲਪਕ ਸਪਲੀਸਿੰਗ, ਸਧਾਰਨ ਕ੍ਰਮ ਦੁਹਰਾਓ (SSR), lncRNA ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ ਅਤੇ ਸੰਬੰਧਿਤ ਟੀਚੇ ਵਾਲੇ ਜੀਨਾਂ, ਨਾਵਲ ਜੀਨਾਂ ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ, ਜੀਨ ਪਰਿਵਾਰਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨ ਫੈਕਟਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਅਤੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਦੀ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਵਿਆਖਿਆ।