● ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਤਿਆਰੀ ਤੋਂ ਪਹਿਲਾਂ ਪੌਲੀ mRNA ਨੂੰ ਕੈਪਚਰ ਕਰਨਾ
● ਕਿਸੇ ਵੀ ਸੰਦਰਭ ਜੀਨੋਮ ਤੋਂ ਸੁਤੰਤਰ: ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਦੇ ਡੀ ਨੋਵੋ ਅਸੈਂਬਲੀ 'ਤੇ ਆਧਾਰਿਤ, ਯੂਨੀਜੀਨਾਂ ਦੀ ਇੱਕ ਸੂਚੀ ਤਿਆਰ ਕਰਨਾ ਜੋ ਮਲਟੀਪਲ ਡੇਟਾਬੇਸ (NR, Swiss-Prot, COG, KOG, eggNOG, Pfam, GO, KEGG) ਨਾਲ ਐਨੋਟੇਟ ਕੀਤੇ ਗਏ ਹਨ।
● ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਅਤੇ ਪ੍ਰਤੀਲਿਪੀ ਬਣਤਰ ਦਾ ਵਿਆਪਕ ਬਾਇਓਇਨਫੋਰਮੈਟਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
●ਵਿਆਪਕ ਮਹਾਰਤ: BMKGENE ਵਿਖੇ 600,000 ਤੋਂ ਵੱਧ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੀ ਪ੍ਰੋਸੈਸਿੰਗ ਦੇ ਟਰੈਕ ਰਿਕਾਰਡ ਦੇ ਨਾਲ, ਵਿਭਿੰਨ ਨਮੂਨੇ ਦੀਆਂ ਕਿਸਮਾਂ ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਸੈੱਲ ਕਲਚਰ, ਟਿਸ਼ੂ ਅਤੇ ਸਰੀਰ ਦੇ ਤਰਲ ਪਦਾਰਥਾਂ ਨੂੰ ਫੈਲਾਉਂਦੇ ਹੋਏ, ਸਾਡੀ ਟੀਮ ਹਰ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਲਈ ਬਹੁਤ ਸਾਰਾ ਤਜਰਬਾ ਲਿਆਉਂਦੀ ਹੈ। ਅਸੀਂ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਖੋਜ ਡੋਮੇਨਾਂ ਵਿੱਚ 100,000 mRNA-Seq ਪ੍ਰੋਜੈਕਟਾਂ ਨੂੰ ਸਫਲਤਾਪੂਰਵਕ ਬੰਦ ਕਰ ਦਿੱਤਾ ਹੈ।
●ਸਖ਼ਤ ਗੁਣਵੱਤਾ ਨਿਯੰਤਰਣ: ਅਸੀਂ ਨਮੂਨੇ ਅਤੇ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਤਿਆਰੀ ਤੋਂ ਲੈ ਕੇ ਕ੍ਰਮ ਅਤੇ ਬਾਇਓਇਨਫੋਰਮੈਟਿਕਸ ਤੱਕ, ਸਾਰੇ ਪੜਾਵਾਂ ਵਿੱਚ ਕੋਰ ਕੰਟਰੋਲ ਪੁਆਇੰਟ ਲਾਗੂ ਕਰਦੇ ਹਾਂ। ਇਹ ਸੁਚੱਜੀ ਨਿਗਰਾਨੀ ਲਗਾਤਾਰ ਉੱਚ-ਗੁਣਵੱਤਾ ਦੇ ਨਤੀਜਿਆਂ ਦੀ ਡਿਲਿਵਰੀ ਨੂੰ ਯਕੀਨੀ ਬਣਾਉਂਦੀ ਹੈ।
● ਵਿਆਪਕ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ: ਅਸੀਂ ਵੱਖੋ-ਵੱਖਰੇ ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਵਾਲੇ ਜੀਨਾਂ (DEGs) ਨੂੰ ਕਾਰਜਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਐਨੋਟੇਟ ਕਰਨ ਅਤੇ ਅਨੁਸਾਰੀ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ ਮਲਟੀਪਲ ਡੇਟਾਬੇਸ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹਾਂ, ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆ ਦੇ ਅਧੀਨ ਸੈਲੂਲਰ ਅਤੇ ਅਣੂ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ 'ਤੇ ਸਮਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੇ ਹਾਂ।
●ਪੋਸਟ-ਵਿਕਰੀ ਸਹਾਇਤਾ: ਸਾਡੀ ਵਚਨਬੱਧਤਾ 3-ਮਹੀਨੇ ਦੀ ਵਿਕਰੀ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਸੇਵਾ ਦੀ ਮਿਆਦ ਦੇ ਨਾਲ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਦੇ ਮੁਕੰਮਲ ਹੋਣ ਤੋਂ ਅੱਗੇ ਵਧਦੀ ਹੈ। ਇਸ ਸਮੇਂ ਦੌਰਾਨ, ਅਸੀਂ ਨਤੀਜਿਆਂ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਕਿਸੇ ਵੀ ਪ੍ਰਸ਼ਨਾਂ ਨੂੰ ਹੱਲ ਕਰਨ ਲਈ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਫਾਲੋ-ਅਪ, ਸਮੱਸਿਆ ਨਿਪਟਾਰਾ ਸਹਾਇਤਾ, ਅਤੇ ਪ੍ਰਸ਼ਨ ਅਤੇ ਉੱਤਰ ਸੈਸ਼ਨ ਦੀ ਪੇਸ਼ਕਸ਼ ਕਰਦੇ ਹਾਂ।
ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ | ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਰਣਨੀਤੀ | ਡਾਟਾ ਦੀ ਸਿਫ਼ਾਰਿਸ਼ ਕੀਤੀ ਗਈ | ਗੁਣਵੱਤਾ ਕੰਟਰੋਲ |
ਪੌਲੀ ਏ ਭਰਪੂਰ | ਇਲੁਮਿਨਾ PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 ਜੀ.ਬੀ | Q30≥85% |
ਨਿਊਕਲੀਓਟਾਈਡਸ:
Conc.(ng/μl) | ਮਾਤਰਾ (μg) | ਸ਼ੁੱਧਤਾ | ਇਮਾਨਦਾਰੀ |
≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ਜੈੱਲ 'ਤੇ ਦਿਖਾਇਆ ਗਿਆ ਸੀਮਤ ਜਾਂ ਕੋਈ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਜਾਂ ਡੀਐਨਏ ਗੰਦਗੀ ਨਹੀਂ ਹੈ। | ਪੌਦਿਆਂ ਲਈ: RIN≥4.0; ਜਾਨਵਰਾਂ ਲਈ: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; ਸੀਮਤ ਜਾਂ ਕੋਈ ਬੇਸਲਾਈਨ ਉਚਾਈ ਨਹੀਂ |
● ਪੌਦੇ:
ਰੂਟ, ਸਟੈਮ ਜਾਂ ਪੇਟਲ: 450 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ
ਪੱਤਾ ਜਾਂ ਬੀਜ: 300 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ
ਫਲ: 1.2 ਗ੍ਰਾਮ
● ਜਾਨਵਰ:
ਦਿਲ ਜਾਂ ਅੰਤੜੀ: 300 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ
ਵਿਸੇਰਾ ਜਾਂ ਦਿਮਾਗ: 240 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ
ਮਾਸਪੇਸ਼ੀ: 450 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ
ਹੱਡੀਆਂ, ਵਾਲ ਜਾਂ ਚਮੜੀ: 1 ਗ੍ਰਾਮ
● ਆਰਥਰੋਪੋਡਸ:
ਕੀੜੇ: 6 ਜੀ
ਕ੍ਰਾਸਟੇਸੀਆ: 300 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ
● ਪੂਰਾ ਖੂਨ: 1 ਟਿਊਬ
● ਸੈੱਲ: 106 ਸੈੱਲ
ਕੰਟੇਨਰ: 2 ਮਿਲੀਲੀਟਰ ਸੈਂਟਰਿਫਿਊਜ ਟਿਊਬ (ਟਿਨ ਫੁਆਇਲ ਦੀ ਸਿਫਾਰਸ਼ ਨਹੀਂ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ)
ਨਮੂਨਾ ਲੇਬਲਿੰਗ: ਸਮੂਹ + ਨਕਲ ਜਿਵੇਂ ਕਿ A1, A2, A3; B1, B2, B3.
ਸ਼ਿਪਮੈਂਟ:
1. ਸੁੱਕੀ ਬਰਫ਼: ਨਮੂਨਿਆਂ ਨੂੰ ਬੈਗਾਂ ਵਿੱਚ ਪੈਕ ਕਰਨ ਅਤੇ ਸੁੱਕੀ ਬਰਫ਼ ਵਿੱਚ ਦਫ਼ਨਾਉਣ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ।
2. RNAstable ਟਿਊਬ: RNA ਨਮੂਨੇ RNA ਸਥਿਰਤਾ ਟਿਊਬ (ਜਿਵੇਂ ਕਿ RNAstable®) ਵਿੱਚ ਸੁਕਾਏ ਜਾ ਸਕਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਕਮਰੇ ਦੇ ਤਾਪਮਾਨ ਵਿੱਚ ਭੇਜੇ ਜਾ ਸਕਦੇ ਹਨ।
ਬਾਇਓਇਨਫੋਰਮੈਟਿਕਸ
ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਅਤੇ ਯੂਨੀਜੀਨ ਚੋਣ
ਯੂਨੀਜੀਨ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ
ਜੈਵਿਕ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀਆਂ ਦਾ ਨਮੂਨਾ ਸਬੰਧ ਅਤੇ ਮੁਲਾਂਕਣ
ਵੱਖਰੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਜੀਨ (DEGs)
DEGs ਦੀ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ
DEGs ਦੀ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਸੰਸ਼ੋਧਨ
ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਨਾਂ ਦੇ ਕਿਉਰੇਟਿਡ ਸੰਗ੍ਰਹਿ ਦੁਆਰਾ BMKGene ਦੀ ਯੂਕੇਰੀਓਟਿਕ NGS mRNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਸੇਵਾਵਾਂ ਦੁਆਰਾ ਸੁਵਿਧਾਜਨਕ ਤਰੱਕੀ ਦੀ ਪੜਚੋਲ ਕਰੋ।
ਸ਼ੇਨ, ਐੱਫ. ਐਟ ਅਲ. (2020) 'ਡੀ ਨੋਵੋ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਅਤੇ ਅਮੂਰ ਕੈਟਫਿਸ਼ (ਸਿਲੁਰਸ ਐਸੋਟਸ) ਦੇ ਗੋਨਾਡਾਂ ਵਿੱਚ ਲਿੰਗ-ਪੱਖੀ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ', ਜੀਨੋਮਿਕਸ, 112(3), ਪੀ.ਪੀ. 2603–2614। doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.
Zhang, C. et al. (2016) 'ਪਿਆਜ਼ ਵਿਚ ਬਲਬ ਸੋਜ ਅਤੇ ਵਿਕਾਸ ਦੌਰਾਨ ਸੂਕਰੋਸ ਮੈਟਾਬੋਲਿਜ਼ਮ ਦਾ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (ਐਲੀਅਮ ਸੇਪਾ ਐਲ.)', ਫਰੰਟੀਅਰਜ਼ ਇਨ ਪਲਾਂਟ ਸਾਇੰਸ, 7 (ਸਤੰਬਰ), ਪੀ. 212763. doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.
ਜ਼ੂ, ਸੀ. ਐਟ ਅਲ. (2017) 'ਡੀ ਨੋਵੋ ਅਸੈਂਬਲੀ, ਸਰਕੋਚੇਲਿਚਥੀਸ ਸਾਈਨੇਨਸਿਸ ਦੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ ਲਈ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਅਤੇ ਵਿਆਖਿਆ', PLOS ONE, 12(2)। doi: 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966.
ਜ਼ੂ, ਐਲ. ਐਟ ਅਲ. (2021) 'ਡੀ ਨੋਵੋ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਪੋਡੋਕਾਰਪਸ ਮੈਕਰੋਫਿਲਸ ਦੀ ਨਮਕ ਸਹਿਣਸ਼ੀਲਤਾ ਦੀ ਸੂਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ ਖਾਰੇਪਣ ਤਣਾਅ ਦੇ ਤਹਿਤ', ਬੀਐਮਸੀ ਪਲਾਂਟ ਬਾਇਓਲੋਜੀ, 21(1), ਪੀਪੀ. 1-17। doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9.