BMKCloud ਲਾਗ ਇਨ
1

MRNA-SEQ (NGS) ਹਵਾਲਾ ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਨਾਲ

百迈客云网站 -11

MRNA-SEQ (NGS) ਹਵਾਲਾ ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਨਾਲ

Rna-seq ਪੂਰੀ ਤਰ੍ਹਾਂ ਜੀਵਨ ਅਤੇ ਫਸਲੀ ਵਿਗਿਆਨ ਭਰ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਮਿਆਰੀ ਟੂਲ ਹੈ, ਜੋ ਜੀਨੋਮ ਅਤੇ ਪ੍ਰੋਟੀਮਜ਼ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਪਾੜੇ ਨੂੰ ਦੂਰ ਕਰਦਾ ਹੈ. ਇਸ ਦੀ ਤਾਕਤ ਨਵੀਂ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਦੀ ਖੋਜ ਕਰਨ ਅਤੇ ਉਨ੍ਹਾਂ ਦੇ ਸਮੀਕਰਨ ਨੂੰ ਇਕ ਅਸਾਨ ਵਿਚ ਰੱਖਦੀ ਹੈ. ਇਹ ਤੁਲਨਾਤਮਕ ਰੂਪਾਂਤਰਾਂ ਦੇ ਅਧਿਐਨ ਲਈ ਵੱਖ ਵੱਖ ਗੁਣਾਂ ਜਾਂ ਫੋਟੋਟਾਈਪਸਾਂ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਜੀਨਾਂ ਜਾਂ ਫਨੋਟਾਈਪਸਾਂ ਨਾਲ ਰਾਇਡਿੰਗ ਗੱਤਾਿੰਗ ਕਰਨਾ, ਖ਼ਾਸ ਸ਼ਰਤਾਂ ਅਧੀਨ ਵਿਵਾਦਾਂ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਕਰਨਾ. BMKCloud MrNa (ਹਵਾਲਾ) ਐਪ ਸਮੀਕਰਨ ਦੀ ਮਾਤਰਾ ਨੂੰ ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਕਰਦਾ ਹੈ (Dex), ਅਤੇ ਕ੍ਰਮ ਦੇ brinefultion structure ਾਂਚਾ, ਸਹੂਲਤ ਅਤੇ ਉਪਭੋਗਤਾ-ਦੋਸਤੀ ਨੂੰ ਯਕੀਨੀ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ. ਉਪਭੋਗਤਾ ਆਪਣੇ ਆਰ ਐਨ ਏ-ਸੇਕ ਡੇਟਾ ਨੂੰ ਕਲਾਉਡ ਨੂੰ ਅਪਲੋਡ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਜਿੱਥੇ ਐਪ ਇੱਕ ਵਿਆਪਕ, ਇੱਕ-ਸਟਾਪ ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਹੱਲ ਪੇਸ਼ ਕਰਦਾ ਹੈ. ਇਸ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ, ਇਹ ਗਾਹਕ ਦੇ ਤਜਰਬੇ ਨੂੰ ਤਰਜੀਹ ਦਿੰਦਾ ਹੈ, ਉਪਭੋਗਤਾਵਾਂ ਦੀਆਂ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਲੋੜਾਂ ਲਈ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਓਪਰੇਸ਼ਨਾਂ ਦੀ ਪੇਸ਼ਕਸ਼ ਕਰਦਾ ਹੈ. ਉਪਭੋਗਤਾ ਮਾਪਦੰਡਾਂ ਨੂੰ ਸੈੱਟ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਪਾਈਪਲਾਈਨ ਮਿਸ਼ਨ ਨੂੰ ਆਪਣੇ ਦੁਆਰਾ ਜਮ੍ਹਾਂ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਇਸ ਇੰਟਰਐਕਟਿਵ ਰਿਪੋਰਟ ਨੂੰ ਵੇਖੋ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ: ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਕਲੱਸਟਰਿੰਗ, ਡਾਇਰਾਮਿੰਗ, ਆਦਿ.

ਡੈਮੋ ਨਤੀਜੇ
ਡਾਟਾ ਮਾਈਨਿੰਗ
ਆਯਾਤ ਦੀ ਲੋੜ
ਮੁੱਖ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
ਹਵਾਲਾ
ਡੈਮੋ ਨਤੀਜੇ

ਡਾਟਾ ਮਾਈਨਿੰਗ

ਆਯਾਤ ਦੀ ਲੋੜ

ਪਲੇਟਫਾਰਮ:Illumina, Mgi
ਰਣਨੀਤੀ:Rna-seq
ਖਾਕਾ: ਨਰਾਈਡ, ਸਾਇਡ-ਡੇਟਾ.
ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਕਿਸਮ:ਫਰ-ਬੇਚੈਨ, ਫਰ-ਫਸਟਸਟ੍ਰੈਂਡ ਜਾਂ ਫਰ-ਸ-ਸੈਕਿੰਡਰੈਂਡ
ਲੰਬਾਈ ਪੜ੍ਹੋ:150 ਬੀ.ਪੀ.
ਫਾਈਲ ਕਿਸਮ:* .ਫੋਫ, * .fq, * .ਫੇਸਕ.ਜੀਜ਼ ਜਾਂ *. ਸੁਰੱਖਿਆ. ਸਿਸਟਮ ਕਰੇਗਾਆਪਣੇ ਆਪ ਹੀ .ਫਾਸਟਕਿ .ਟ ਫਾਈਲਾਂ ਦੇ ਨਾਮ ਦੇ ਅਨੁਸਾਰ.ਉਦਾਹਰਣ ਵਜੋਂ * _ 1.6.ਫਾਸਟਕਿ .ਡ * ._.
ਨਮੂਨੇ ਦੀ ਗਿਣਤੀ:ਨੰਬਰ 'ਤੇ ਕੋਈ ਪਾਬੰਦੀਆਂ ਨਹੀਂ ਹਨਨਮੂਨਿਆਂ ਦਾ, ਪਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦਾ ਸਮਾਂ ਇਸ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਦੇ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਵਧੇਗਾਨਮੂਨੇ ਵਧਦੇ ਹਨ.
ਸਿਫਾਰਸ਼ੀ ਡਾਟਾ ਰਕਮ:6 ਜੀ ਪ੍ਰਤੀ ਨਮੂਨਾ

ਮੁੱਖ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
MRNA-SEQ (ਸੰਦਰਭ) ਦੇ ਮੁੱਖ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕ ਟੂਲਸਪਾਈਪਲਾਈਨ ਇਸ ਤਰ੍ਹਾਂ ਹੈ:
1. ਰਾਸਡਾਟਾ ਕੁਆਲਟੀ ਕੰਟਰੋਲ:
Love ਨੀਵੀਂ-ਕੁਆਲਟੀ ਦੇ ਕ੍ਰਮ, ਅਡੈਪਟਰ ਲੜੀਵਾਰਾਂ ਨੂੰ ਹਟਾਉਣਾ,ਆਦਿ;
• ਸਾਧਨ: ਇਨ-ਹਾ House ਸ ਵਿਕਸਤ ਪਾਈਪਲਾਈਨ;
2. ਇੱਕ ਹਵਾਲਾ ਜੀਨੋਮ ਨੂੰ ਡੇਟਾ ਦੀ ਇਕਸਾਰਤਾ:
Sting ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ ਸਪਲੀਸ-ਜਾਣੂ ਐਲਗੋਰਿਦਮ ਨਾਲ ਪੜ੍ਹਨਾਹਵਾਲਾ ਜੀਨੋਮ.
• ਸਾਧਨ:ਹਿਸੈਟ 2, Samtols
3. ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਗੁਣਵੱਤਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ:
Le ਲੰਬਾਈ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਪਾਓ, ਸੰਤ੍ਰਿਪਤਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਆਦਿ ਪਾਓ;
• ਸਾਧਨ:Samtols;
4. ਕ੍ਰਮ structure ਾਂਚਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ:
• ਵਿਕਲਪਿਕ ਪੁਨਰ ਸਥਾਪਨਾ, ਜੀਨ ructure ਾਂਚੇ ਦਾ ਅਨੁਕੂਲਤਾ,ਨਾਵਲ ਜੀਨ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ, ਆਦਿ;
• ਸਾਧਨ:ਸਟਰਟੀ, gffcompare, ਗੇਟਕ,ਹੀਰਾ, ਇੰਟਰਪ੍ਰੋਸਕਨ, ਅਤੇਹਮਰ.
5. ਵੱਖਰਾ ਸਮੀਕਰਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ:
Steve ਡਿਗਰੀ ਸਕ੍ਰੀਨਿੰਗ, ਸਹਿ-ਸੰਬੰਧ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਕਾਰਜਸ਼ੀਲਖੁਸ਼ਹਾਲੀ;
ਕਈ ਵਿਜ਼ੂਅਲੇਸ਼ਨ ਦੇ ਨਤੀਜੇ;
Rਦੇ ਨਾਲSegsseq, Desseq2, ggplot2, ਡੀਕਸਸੇਕ
ਹਵਾਲਾ
1. ਕਿਮ, ਡੇਹਵਨ ਐਟ ਅਲ. "ਗ੍ਰਾਫ-ਅਧਾਰਤ ਜੀਨੋਮ ਅਲਾਈਨਮੈਂਟ ਅਤੇਹਿਸੈਟ 2 ਅਤੇ ਹਿਸੇਟ-ਜੀਨੋਟਾਈਪ ਨਾਲ ਜੀਨੋਟਾਈਪਿੰਗ. "ਕੁਦਰਤਬਾਇਓਟੈਕਨਾਲੋਜੀ37 (2019): 907 - 915.
2. ਮੈਕੈਂਨਾ, ਐਰੋਨ ਏਟ ਅਲ. "ਜੀਨੋਮ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਟੂਲਕਿੱਟ: ਏਅਗਲੀ-ਪੀੜ੍ਹੀ ਦੇ ਡੀਐਨਏ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ ਮੈਡ੍ਰੈਡਸਸਸਸ .ਨਸੀਵੈਨਿੰਗ ਡੇਟਾ. "ਜੀਨੋਮ ਰਿਸਰਚ20 9 (2010): 1297-303.
3. ਲੀ, ਹੈਂਗ ਐਟ ਅਲ ਅਲ. "ਕ੍ਰਮ ਅਨੁਕੂਲਤਾ / ਮੈਪ ਫਾਰਮੈਟ ਅਤੇSamtols. "ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕਸ25 (2009): 2078 - 2079.
4. ਪੇਰੀ, ਮਿਹੈਲਾ ਐਟ ਅਲ. "ਸਟਰਟੀ ਸੁਧਾਰ ਕਰਦਾ ਹੈrna-seq ਰੀਡ ਤੋਂ ਇੱਕ ਪ੍ਰਤੀਲਿਪੀ ਦਾ ਪੁਨਰ ਨਿਰਮਾਣ. "ਕੁਦਰਤਬਾਇਓਟੈਕਨਾਲੋਜੀ33 (2015): 290-295.
5. ਪਿਆਰ, ਮਾਈਕਲ I. ਅਤੇ ਅਲ. "ਫੋਲਡ ਤਬਦੀਲੀ ਦਾ ਸੰਚਾਲਨ ਅਨੁਮਾਨ ਅਤੇDENSEQ2 ਨਾਲ rna-seq ਡਾਟਾ ਲਈ ਫੈਲਾਅ. "ਜੀਨੋਮਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ15 (2014): ਐਨ. ਪਾਗ
6. ਐਡੀ, ਸੀਨ ਆਰ .. ਐਕਸਰਲੇਟਡ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲ ਐਚਐਮਐਮ ਖੋਜ. "Plos ਕੰਪਿ ut ਟੇਸ਼ਨਲ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨ7 (2011): ਐਨ. ਪਾਗ

ਇੱਕ ਹਵਾਲਾ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰੋ

ਆਪਣਾ ਸੁਨੇਹਾ ਇੱਥੇ ਲਿਖੋ ਅਤੇ ਸਾਨੂੰ ਭੇਜੋ

ਆਪਣਾ ਸੁਨੇਹਾ ਸਾਡੇ ਕੋਲ ਭੇਜੋ: