ਨੈਨੋਪੋਰ ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਪ੍ਰਤੀਲਿਪੀ

ਨੈਨੋਪੋਰ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਕ੍ਰਮ ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਦੇ ਸੀਡੀਐਨਏ ਨੂੰ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਕਰਨ ਲਈ, ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਆਈਸੋਫਾਰਮ ਦੀ ਸਹੀ ਪਛਾਣ ਅਤੇ ਮਾਤਰਾ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਸ਼ਕਤੀਸ਼ਾਲੀ ਤਰੀਕਾ ਹੈ। BMKCloud ਨੈਨੋਪੋਰ ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਪਾਈਪਲਾਈਨ ਨੂੰ ਜੀਨ ਅਤੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਪੱਧਰ ਦੋਵਾਂ 'ਤੇ ਗੁਣਾਤਮਕ ਅਤੇ ਮਾਤਰਾਤਮਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੇ ਹੋਏ, ਇੱਕ ਉੱਚ-ਗੁਣਵੱਤਾ ਚੰਗੀ-ਐਨੋਟੇਟਡ ਸੰਦਰਭ ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ ਨੈਨੋਪੋਰ ਪਲੇਟਫਾਰਮ 'ਤੇ ਤਿਆਰ ਕੀਤੇ ਗਏ RNA-Seq ਡੇਟਾ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ। ਗੁਣਵੱਤਾ ਨਿਯੰਤਰਣ ਤੋਂ ਬਾਅਦ, ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਦੇ ਗੈਰ-ਚਾਇਮੇਰਿਕ (FLNC) ਕ੍ਰਮ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕੀਤੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਬੇਲੋੜੀਆਂ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਨੂੰ ਹਟਾਉਣ ਲਈ ਸੰਦਰਭ ਜੀਨੋਮ ਨਾਲ ਸਹਿਮਤੀ ਕ੍ਰਮਾਂ ਨੂੰ ਮੈਪ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਸੈਟ ਤੋਂ, ਸਮੀਕਰਨ ਦੀ ਮਾਤਰਾ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਵੱਖਰੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਜੀਨਾਂ ਅਤੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਕਾਰਜਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਐਨੋਟੇਟ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ। ਪਾਈਪਲਾਈਨ ਵਿੱਚ ਵਿਕਲਪਕ ਪੌਲੀਏਡੀਨਿਲੇਸ਼ਨ (ਏਪੀਏ) ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਵਿਕਲਪਕ ਸਪਲੀਸਿੰਗ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਸਧਾਰਨ ਕ੍ਰਮ ਦੁਹਰਾਓ (SSR) ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, lncRNA ਅਤੇ ਸੰਬੰਧਿਤ ਟੀਚਿਆਂ ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ, ਕੋਡਿੰਗ ਕ੍ਰਮ (ਸੀਡੀਐਸ), ਜੀਨ ਪਰਿਵਾਰਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨ ਫੈਕਟਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਨੋਵੇਲਜੀਨੇਸ਼ਨ ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ। ਅਤੇ ਦੀ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਪ੍ਰਤੀਲਿਪੀਆਂ