mRNA-seq (NGS) - De novo
mRNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਖਾਸ ਸਥਿਤੀਆਂ ਦੇ ਅਧੀਨ ਸੈੱਲਾਂ ਵਿੱਚ ਸਾਰੇ mRNA ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਦੀ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ ਦੀ ਆਗਿਆ ਦਿੰਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਇਹ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਖੋਜ ਖੇਤਰਾਂ ਵਿੱਚ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਰਤੀ ਜਾਂਦੀ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਹੈ। BMKCloud De novo mRNA-seq ਪਾਈਪਲਾਈਨ ਨੂੰ ਪੌਲੀ-ਏ ਐਨਰਿਚਡ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀਆਂ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ ਜਦੋਂ ਕੋਈ ਹਵਾਲਾ ਜੀਨੋਮ ਉਪਲਬਧ ਨਹੀਂ ਹੈ। ਪਾਈਪਲਾਈਨ ਗੁਣਵੱਤਾ ਨਿਯੰਤਰਣ ਨਾਲ ਸ਼ੁਰੂ ਹੁੰਦੀ ਹੈ, ਇਸਦੇ ਬਾਅਦde novoਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਅਸੈਂਬਲੀ ਅਤੇ ਯੂਨੀਜੀਨ ਸੈੱਟ ਚੋਣ। ਯੂਨੀਜੀਨ ਬਣਤਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕੋਡਿੰਗ ਕ੍ਰਮ (CDS) ਅਤੇ ਸਧਾਰਨ ਕ੍ਰਮ ਦੁਹਰਾਉਣ (SSR) ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਤੋਂ ਬਾਅਦ, ਡਿਫਰੈਂਸ਼ੀਅਲ ਐਕਸਪ੍ਰੈਸ਼ਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਟੈਸਟ ਕੀਤੀਆਂ ਸਥਿਤੀਆਂ ਵਿੱਚ ਵੱਖਰੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਜੀਨਾਂ (DEGs) ਨੂੰ ਲੱਭਦਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਸੂਝ ਕੱਢਣ ਲਈ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਅਤੇ DEGs ਦੀ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ।
ਬਾਇਓਇਨਫੋਰਮੈਟਿਕਸ
