ਹਾਈ-ਸੀ ਆਧਾਰਿਤ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ
ਹਾਈ-ਸੀ ਇੱਕ ਢੰਗ ਹੈ ਜੋ ਪ੍ਰੋਬਿੰਗ ਨੇੜਤਾ-ਅਧਾਰਿਤ ਪਰਸਪਰ ਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਅਤੇ ਉੱਚ-ਥਰੂਪੁੱਟ ਕ੍ਰਮ ਨੂੰ ਜੋੜ ਕੇ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ ਸੰਰਚਨਾ ਨੂੰ ਹਾਸਲ ਕਰਨ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ। ਮੰਨਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ ਕਿ ਇਹਨਾਂ ਪਰਸਪਰ ਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਦੀ ਤੀਬਰਤਾ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮਜ਼ 'ਤੇ ਸਰੀਰਕ ਦੂਰੀ ਨਾਲ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸਬੰਧਿਤ ਹੈ। ਇਸਲਈ, ਹਾਈ-ਸੀ ਡੇਟਾ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਡਰਾਫਟ ਜੀਨੋਮ ਵਿੱਚ ਇਕੱਠੇ ਕੀਤੇ ਕ੍ਰਮਾਂ ਦੇ ਕਲੱਸਟਰਿੰਗ, ਆਰਡਰਿੰਗ ਅਤੇ ਦਿਸ਼ਾ ਨਿਰਦੇਸ਼ਨ ਲਈ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਉਹਨਾਂ ਨੂੰ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ ਦੀ ਇੱਕ ਨਿਸ਼ਚਤ ਸੰਖਿਆ ਵਿੱਚ ਐਂਕਰਿੰਗ ਕਰਨ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਆਬਾਦੀ-ਅਧਾਰਤ ਜੈਨੇਟਿਕ ਨਕਸ਼ੇ ਦੀ ਅਣਹੋਂਦ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ-ਪੱਧਰ ਦੇ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਨੂੰ ਸ਼ਕਤੀ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਹਰ ਇੱਕ ਜੀਨੋਮ ਨੂੰ ਹਾਈ-ਸੀ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ।
ਸੇਵਾ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ
● PE150 ਦੇ ਨਾਲ Illumina NovaSeq 'ਤੇ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ।
● ਸੇਵਾ ਲਈ ਟਿਸ਼ੂ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ, ਐਕਸਟਰੈਕਟ ਕੀਤੇ ਨਿਊਕਲੀਕ ਐਸਿਡ ਦੀ ਬਜਾਏ, ਫਾਰਮਲਡੀਹਾਈਡ ਨਾਲ ਕ੍ਰਾਸ-ਲਿੰਕ ਕਰਨ ਅਤੇ DNA-ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਪਰਸਪਰ ਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਨੂੰ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਰੱਖਣ ਲਈ।
● ਹਾਈ-ਸੀ ਪ੍ਰਯੋਗ ਵਿੱਚ ਬਾਇਓਟਿਨ ਨਾਲ ਸਟਿੱਕੀ ਸਿਰਿਆਂ ਦੀ ਪਾਬੰਦੀ ਅਤੇ ਅੰਤਮ ਮੁਰੰਮਤ ਸ਼ਾਮਲ ਹੁੰਦੀ ਹੈ, ਇਸਦੇ ਬਾਅਦ ਪਰਸਪਰ ਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਨੂੰ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਰੱਖਦੇ ਹੋਏ ਨਤੀਜੇ ਵਜੋਂ ਧੁੰਦਲੇ ਸਿਰਿਆਂ ਦਾ ਚੱਕਰੀਕਰਨ ਹੁੰਦਾ ਹੈ। ਫਿਰ ਡੀਐਨਏ ਨੂੰ ਸਟ੍ਰੈਪਟਾਵਿਡਿਨ ਮਣਕਿਆਂ ਨਾਲ ਹੇਠਾਂ ਖਿੱਚਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਅਗਲੀ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਤਿਆਰੀ ਲਈ ਸ਼ੁੱਧ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।
ਸੇਵਾ ਦੇ ਫਾਇਦੇ
ਹਾਈ-ਸੀ ਦੀ ਸੰਖੇਪ ਜਾਣਕਾਰੀ
(ਲਿਬਰਮੈਨ-ਏਡਨ ਈ ਏਟ ਅਲ.,ਵਿਗਿਆਨ, 2009)
●ਜੈਨੇਟਿਕ ਜਨਸੰਖਿਆ ਡੇਟਾ ਦੀ ਜ਼ਰੂਰਤ ਨੂੰ ਖਤਮ ਕਰਨਾ:ਹਾਈ-ਸੀ ਕੰਟੀਗ ਐਂਕਰਿੰਗ ਲਈ ਲੋੜੀਂਦੀ ਜ਼ਰੂਰੀ ਜਾਣਕਾਰੀ ਨੂੰ ਬਦਲਦਾ ਹੈ।
●ਉੱਚ ਮਾਰਕਰ ਘਣਤਾ:90% ਤੋਂ ਉੱਪਰ ਉੱਚ ਕੋਂਟੀਗ ਐਂਕਰਿੰਗ ਅਨੁਪਾਤ ਵੱਲ ਅਗਵਾਈ ਕਰਦਾ ਹੈ।
●ਵਿਆਪਕ ਮਹਾਰਤ ਅਤੇ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਨ ਰਿਕਾਰਡ:BMKGene ਕੋਲ 1000 ਵੱਖ-ਵੱਖ ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਅਤੇ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਪੇਟੈਂਟਾਂ ਤੋਂ ਹਾਈ-ਸੀ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਦੇ 2000 ਤੋਂ ਵੱਧ ਕੇਸਾਂ ਦਾ ਵਿਸ਼ਾਲ ਅਨੁਭਵ ਹੈ। 200 ਤੋਂ ਵੱਧ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਿਤ ਮਾਮਲਿਆਂ ਵਿੱਚ 2000 ਤੋਂ ਵੱਧ ਦਾ ਸੰਚਤ ਪ੍ਰਭਾਵ ਕਾਰਕ ਹੈ।
●ਉੱਚ ਕੁਸ਼ਲ ਬਾਇਓਇਨਫੋਰਮੈਟਿਕਸ ਟੀਮ:ਹਾਈ-ਸੀ ਪ੍ਰਯੋਗਾਂ ਅਤੇ ਡੇਟਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਇਨ-ਹਾਊਸ ਪੇਟੈਂਟ ਅਤੇ ਸੌਫਟਵੇਅਰ ਕਾਪੀਰਾਈਟਸ ਦੇ ਨਾਲ, ਸਵੈ-ਵਿਕਸਤ ਵਿਜ਼ੂਅਲਾਈਜ਼ੇਸ਼ਨ ਡੇਟਾ ਸੌਫਟਵੇਅਰ ਮੈਨੂਅਲ ਬਲਾਕ ਮੂਵਿੰਗ, ਰਿਵਰਸਿੰਗ, ਰੀਵੋਕਿੰਗ ਅਤੇ ਰੀਡੋਇੰਗ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ।
●ਪੋਸਟ-ਸੇਲ ਸਪੋਰਟ:ਸਾਡੀ ਵਚਨਬੱਧਤਾ 3-ਮਹੀਨੇ ਦੀ ਵਿਕਰੀ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਸੇਵਾ ਦੀ ਮਿਆਦ ਦੇ ਨਾਲ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਦੇ ਮੁਕੰਮਲ ਹੋਣ ਤੋਂ ਪਰੇ ਹੈ। ਇਸ ਸਮੇਂ ਦੌਰਾਨ, ਅਸੀਂ ਨਤੀਜਿਆਂ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਕਿਸੇ ਵੀ ਪ੍ਰਸ਼ਨਾਂ ਨੂੰ ਹੱਲ ਕਰਨ ਲਈ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਫਾਲੋ-ਅਪ, ਸਮੱਸਿਆ ਨਿਪਟਾਰਾ ਸਹਾਇਤਾ, ਅਤੇ ਪ੍ਰਸ਼ਨ ਅਤੇ ਉੱਤਰ ਸੈਸ਼ਨ ਦੀ ਪੇਸ਼ਕਸ਼ ਕਰਦੇ ਹਾਂ।
●ਵਿਆਪਕ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ: ਅਸੀਂ ਪਛਾਣੀਆਂ ਗਈਆਂ ਭਿੰਨਤਾਵਾਂ ਦੇ ਨਾਲ ਜੀਨਾਂ ਨੂੰ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਤੌਰ 'ਤੇ ਐਨੋਟੇਟ ਕਰਨ ਲਈ ਕਈ ਡੇਟਾਬੇਸ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹਾਂ ਅਤੇ ਅਨੁਸਾਰੀ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਦੇ ਹਾਂ, ਕਈ ਖੋਜ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟਾਂ 'ਤੇ ਸੂਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੇ ਹਾਂ।
ਸੇਵਾ ਨਿਰਧਾਰਨ
| ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਤਿਆਰੀ | ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਰਣਨੀਤੀ | ਸਿਫਾਰਸ਼ੀ ਡਾਟਾ ਆਉਟਪੁੱਟ | ਗੁਣਵੱਤਾ ਨਿਯੰਤਰਣ |
| ਹਾਈ-ਸੀ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ | Illumina NovaSeq PE150 | 100x | Q30 ≥ 85% |
ਨਮੂਨਾ ਲੋੜਾਂ
| ਟਿਸ਼ੂ | ਲੋੜੀਂਦੀ ਰਕਮ |
| ਪਸ਼ੂ ਵਿਸੇਰਾ | ≥ 2 ਗ੍ਰਾਮ |
| ਜਾਨਵਰ ਮਾਸਪੇਸ਼ੀ | |
| ਥਣਧਾਰੀ ਖੂਨ | ≥ 2 ਮਿ.ਲੀ |
| ਪੋਲਟਰੀ/ਮੱਛੀ ਦਾ ਖੂਨ | |
| ਪੌਦਾ - ਤਾਜ਼ੇ ਪੱਤੇ | ≥ 3 ਗ੍ਰਾਮ |
| ਸੰਸਕ੍ਰਿਤ ਸੈੱਲ | ≥ 1x107 |
| ਕੀੜੇ | ≥ 2 ਗ੍ਰਾਮ |
ਸੇਵਾ ਕਾਰਜ ਪ੍ਰਵਾਹ
ਪ੍ਰਯੋਗ ਡਿਜ਼ਾਈਨ
ਨਮੂਨਾ ਡਿਲੀਵਰੀ
ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਉਸਾਰੀ
ਕ੍ਰਮਬੱਧ
ਡਾਟਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
ਵਿਕਰੀ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਦੀਆਂ ਸੇਵਾਵਾਂ
1) ਕੱਚਾ ਡਾਟਾ QC
2) Hi-C ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ QC: ਵੈਧ Hi-C ਪਰਸਪਰ ਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਦਾ ਅਨੁਮਾਨ
3) ਹਾਈ-ਸੀ ਅਸੈਂਬਲੀ: ਸਮੂਹਾਂ ਵਿੱਚ ਕੰਟਿਗਸ ਦਾ ਕਲੱਸਟਰਿੰਗ, ਹਰ ਇੱਕ ਸਮੂਹ ਵਿੱਚ ਕੰਟਿਗ ਆਰਡਰਿੰਗ ਅਤੇ ਕੰਟੀਗ ਓਰੀਐਂਟੇਸ਼ਨ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕਰਨਾ।
4) ਹਾਈ-ਸੀ ਮੁਲਾਂਕਣ
ਹਾਈ-ਸੀ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ QC - ਹਾਈ-ਸੀ ਵੈਧ ਪਰਸਪਰ ਜੋੜਿਆਂ ਦਾ ਅਨੁਮਾਨ
ਹਾਈ-ਸੀ ਅਸੈਂਬਲੀ - ਅੰਕੜੇ
ਅਸੈਂਬਲੀ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਦਾ ਮੁਲਾਂਕਣ - ਬਿੰਨਾਂ ਵਿਚਕਾਰ ਸਿਗਨਲ ਤੀਬਰਤਾ ਦਾ ਹੀਟਮੈਪ
ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਨਾਂ ਦੇ ਕਿਉਰੇਟਿਡ ਸੰਗ੍ਰਹਿ ਦੁਆਰਾ BMKGene ਦੀਆਂ Hi-C ਅਸੈਂਬਲੀ ਸੇਵਾਵਾਂ ਦੁਆਰਾ ਸੁਵਿਧਾਜਨਕ ਤਰੱਕੀ ਦੀ ਪੜਚੋਲ ਕਰੋ।
Tian, T. et al. (2023) 'ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਅਤੇ ਇੱਕ ਪ੍ਰਮੁੱਖ ਸੋਕਾ-ਰੋਧਕ ਮੱਕੀ ਦੇ ਜਰਮਪਲਾਜ਼ਮ ਦਾ ਜੈਨੇਟਿਕ ਡਿਸਕਸ਼ਨ', ਨੇਚਰ ਜੈਨੇਟਿਕਸ 2023 55:3, 55(3), ਪੀ.ਪੀ. 496-506। doi: 10.1038/s41588-023-01297-y.
ਵੈਂਗ, ZL ਐਟ ਅਲ. (2020) 'ਏ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ-ਸਕੇਲ ਅਸੈਂਬਲੀ ਆਫ਼ ਦ ਏਸ਼ੀਅਨ ਹਨੀਬੀ ਐਪਿਸ ਸੇਰਾਨਾ ਜੀਨੋਮ', ਫਰੰਟੀਅਰਜ਼ ਇਨ ਜੈਨੇਟਿਕਸ, 11, ਪੀ. 524140. doi: 10.3389/FGENE.2020.00279/BIBTEX.
Zhang, F. et al. (2023) 'ਸੋਲਾਨੇਸੀ ਪਰਿਵਾਰ ਵਿਚ ਦੋ ਜੀਨੋਮ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਕੇ ਟ੍ਰੋਪੇਨ ਐਲਕਾਲਾਇਡ ਬਾਇਓਸਿੰਥੇਸਿਸ ਦਾ ਵਿਕਾਸ ਕਰਨਾ', ਨੇਚਰ ਕਮਿਊਨੀਕੇਸ਼ਨਜ਼ 2023 14:1, 14(1), ਪੀ.ਪੀ. 1-18। doi: 10.1038/s41467-023-37133-4.
Zhang, X. et al. (2020) 'ਬੈਂਨੀਅਨ ਟ੍ਰੀ ਅਤੇ ਪੋਲੀਨੇਟਰ ਵੈਸਪ ਦੇ ਜੀਨੋਮਜ਼ ਪ੍ਰੋਵਾਈਡ ਇਨਸਾਈਟਸ ਇਨ ਫਿਗ-ਵੈਸਪ ਕੋਇਵੋਲੂਸ਼ਨ', ਸੈੱਲ, 183(4), ਪੀ.ਪੀ. 875-889.e17। doi: 10.1016/J.CELL.2020.09.043
