ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ mRNA ਕ੍ਰਮ -PacBio
ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ
● ਪੌਲੀ-ਏ mRNA ਤੋਂ cDNA ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਤਿਆਰੀ
● CCS ਮੋਡ ਵਿੱਚ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ, HiFi ਰੀਡ ਤਿਆਰ ਕਰਨਾ
● ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਦੀਆਂ ਪ੍ਰਤੀਲਿਪੀਆਂ ਦੀ ਕ੍ਰਮਬੱਧਤਾ
● ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਹਵਾਲਾ ਜੀਨੋਮ ਦੀ ਲੋੜ ਨਹੀਂ ਹੁੰਦੀ; ਹਾਲਾਂਕਿ, ਇਸ ਨੂੰ ਰੁਜ਼ਗਾਰ ਦਿੱਤਾ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ
● ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਆਈਸੋਫਾਰਮ lncRNA, ਜੀਨ ਫਿਊਜ਼ਨ, ਪੌਲੀ-ਐਡੀਨਿਲੇਸ਼ਨ, ਅਤੇ ਜੀਨ ਬਣਤਰ ਦੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ
ਸੇਵਾ ਦੇ ਫਾਇਦੇ
●ਉੱਚ ਸ਼ੁੱਧਤਾ: HiFi ਸ਼ੁੱਧਤਾ ਨਾਲ ਪੜ੍ਹਦਾ ਹੈ >99.9% (Q30), NGS ਨਾਲ ਤੁਲਨਾਯੋਗ
● ਵਿਕਲਪਕ ਸਪਲੀਸਿੰਗ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ: ਸਮੁੱਚੀ ਪ੍ਰਤੀਲਿਪੀਆਂ ਦੀ ਕ੍ਰਮਵਾਰ ਆਈਸੋਫਾਰਮ ਪਛਾਣ ਅਤੇ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦੀ ਹੈ
●ਵਿਆਪਕ ਮਹਾਰਤ: 1100 ਤੋਂ ਵੱਧ PacBio ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਦੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟਾਂ ਨੂੰ ਪੂਰਾ ਕਰਨ ਅਤੇ 2300 ਤੋਂ ਵੱਧ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੀ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ ਕਰਨ ਦੇ ਟਰੈਕ ਰਿਕਾਰਡ ਦੇ ਨਾਲ, ਸਾਡੀ ਟੀਮ ਹਰ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਲਈ ਬਹੁਤ ਸਾਰਾ ਤਜਰਬਾ ਲਿਆਉਂਦੀ ਹੈ।
●ਪੋਸਟ-ਵਿਕਰੀ ਸਹਾਇਤਾ: ਸਾਡੀ ਵਚਨਬੱਧਤਾ 3-ਮਹੀਨੇ ਦੀ ਵਿਕਰੀ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਸੇਵਾ ਦੀ ਮਿਆਦ ਦੇ ਨਾਲ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਦੇ ਮੁਕੰਮਲ ਹੋਣ ਤੋਂ ਅੱਗੇ ਵਧਦੀ ਹੈ। ਇਸ ਸਮੇਂ ਦੌਰਾਨ, ਅਸੀਂ ਨਤੀਜਿਆਂ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਕਿਸੇ ਵੀ ਪ੍ਰਸ਼ਨਾਂ ਨੂੰ ਹੱਲ ਕਰਨ ਲਈ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਫਾਲੋ-ਅਪ, ਸਮੱਸਿਆ ਨਿਪਟਾਰਾ ਸਹਾਇਤਾ, ਅਤੇ ਪ੍ਰਸ਼ਨ ਅਤੇ ਉੱਤਰ ਸੈਸ਼ਨ ਦੀ ਪੇਸ਼ਕਸ਼ ਕਰਦੇ ਹਾਂ।
ਨਮੂਨਾ ਲੋੜਾਂ ਅਤੇ ਡਿਲਿਵਰੀ
| ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ | ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਰਣਨੀਤੀ | ਡਾਟਾ ਦੀ ਸਿਫ਼ਾਰਿਸ਼ ਕੀਤੀ ਗਈ | ਗੁਣਵੱਤਾ ਕੰਟਰੋਲ |
| ਪੋਲੀਏ ਨੇ ਭਰਪੂਰ mRNA CCS ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ | PacBio ਸੀਕਵਲ II PacBio Revio | 20/40 ਜੀ.ਬੀ 5/10 M CCS | Q30≥85% |
ਨਮੂਨਾ ਲੋੜਾਂ:
ਨਿਊਕਲੀਓਟਾਈਡਸ:
● ਪੌਦੇ:
ਰੂਟ, ਸਟੈਮ ਜਾਂ ਪੇਟਲ: 450 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ
ਪੱਤਾ ਜਾਂ ਬੀਜ: 300 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ
ਫਲ: 1.2 ਗ੍ਰਾਮ
● ਜਾਨਵਰ:
ਦਿਲ ਜਾਂ ਅੰਤੜੀ: 300 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ
ਵਿਸੇਰਾ ਜਾਂ ਦਿਮਾਗ: 240 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ
ਮਾਸਪੇਸ਼ੀ: 450 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ
ਹੱਡੀਆਂ, ਵਾਲ ਜਾਂ ਚਮੜੀ: 1 ਗ੍ਰਾਮ
● ਆਰਥਰੋਪੋਡਸ:
ਕੀੜੇ: 6 ਜੀ
ਕ੍ਰਾਸਟੇਸੀਆ: 300 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ
● ਪੂਰਾ ਖੂਨ: 1 ਟਿਊਬ
● ਸੈੱਲ: 106 ਸੈੱਲ
| Conc.(ng/μl) | ਮਾਤਰਾ (μg) | ਸ਼ੁੱਧਤਾ | ਇਮਾਨਦਾਰੀ |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ਜੈੱਲ 'ਤੇ ਦਿਖਾਇਆ ਗਿਆ ਸੀਮਤ ਜਾਂ ਕੋਈ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਜਾਂ ਡੀਐਨਏ ਗੰਦਗੀ ਨਹੀਂ ਹੈ। | ਪੌਦਿਆਂ ਲਈ: RIN≥7.5; ਜਾਨਵਰਾਂ ਲਈ: RIN≥8.0; 5.0≥ 28S/18S≥1.0; ਸੀਮਤ ਜਾਂ ਕੋਈ ਬੇਸਲਾਈਨ ਉਚਾਈ ਨਹੀਂ |
ਸਿਫਾਰਸ਼ੀ ਨਮੂਨਾ ਡਿਲੀਵਰੀ
ਕੰਟੇਨਰ: 2 ਮਿਲੀਲੀਟਰ ਸੈਂਟਰਿਫਿਊਜ ਟਿਊਬ (ਟਿਨ ਫੁਆਇਲ ਦੀ ਸਿਫਾਰਸ਼ ਨਹੀਂ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ)
ਨਮੂਨਾ ਲੇਬਲਿੰਗ: ਸਮੂਹ + ਨਕਲ ਜਿਵੇਂ ਕਿ A1, A2, A3; B1, B2, B3.
ਸ਼ਿਪਮੈਂਟ:
1. ਸੁੱਕੀ ਬਰਫ਼: ਨਮੂਨਿਆਂ ਨੂੰ ਬੈਗਾਂ ਵਿੱਚ ਪੈਕ ਕਰਨ ਅਤੇ ਸੁੱਕੀ ਬਰਫ਼ ਵਿੱਚ ਦਫ਼ਨਾਉਣ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ।
2. RNAstable ਟਿਊਬ: RNA ਨਮੂਨੇ RNA ਸਥਿਰਤਾ ਟਿਊਬ (ਜਿਵੇਂ ਕਿ RNAstable®) ਵਿੱਚ ਸੁਕਾਏ ਜਾ ਸਕਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਕਮਰੇ ਦੇ ਤਾਪਮਾਨ ਵਿੱਚ ਭੇਜੇ ਜਾ ਸਕਦੇ ਹਨ।
ਸੇਵਾ ਕਾਰਜ ਪ੍ਰਵਾਹ
ਪ੍ਰਯੋਗ ਡਿਜ਼ਾਈਨ
ਨਮੂਨਾ ਡਿਲੀਵਰੀ
ਆਰਐਨਏ ਕੱਢਣ
ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਉਸਾਰੀ
ਕ੍ਰਮਬੱਧ
ਡਾਟਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
ਵਿਕਰੀ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਦੀਆਂ ਸੇਵਾਵਾਂ
ਹੇਠ ਦਿੱਤੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ:
● ਕੱਚਾ ਡਾਟਾ ਗੁਣਵੱਤਾ ਨਿਯੰਤਰਣ
● ਵਿਕਲਪਕ ਪੋਲੀਡੇਨਾਈਲੇਸ਼ਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (APA)
● ਫਿਊਜ਼ਨ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
● ਵਿਕਲਪਕ ਸਪਲੀਸਿੰਗ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
● ਬੈਂਚਮਾਰਕਿੰਗ ਯੂਨੀਵਰਸਲ ਸਿੰਗਲ-ਕਾਪੀ ਆਰਥੋਲੋਗਸ (BUSCO) ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
● ਨਾਵਲ ਪ੍ਰਤੀਲਿਪੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ: ਕੋਡਿੰਗ ਕ੍ਰਮ (CDS) ਅਤੇ ਕਾਰਜਾਤਮਕ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ
● lncRNA ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ: lncRNA ਅਤੇ ਟੀਚਿਆਂ ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ
● ਮਾਈਕ੍ਰੋਸੈਟੇਲਾਈਟ ਪਛਾਣ (SSR)
BUSCO ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
ਵਿਕਲਪਕ ਸਪਲੀਸਿੰਗ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
ਵਿਕਲਪਕ ਪੋਲੀਡੇਨਿਲੇਸ਼ਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (ਏਪੀਏ)
ਨਾਵਲ ਪ੍ਰਤੀਲਿਪੀ ਦੀ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ
ਇਸ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਨ ਵਿੱਚ BMKGene ਦੀ ਨੈਨੋਪੋਰ ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ mRNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਸੇਵਾਵਾਂ ਦੁਆਰਾ ਸੁਵਿਧਾਜਨਕ ਤਰੱਕੀ ਦੀ ਪੜਚੋਲ ਕਰੋ।
ਮਾ, ਵਾਈ ਐਟ ਅਲ. (2023) 'Nemopilema Nomurai ਜ਼ਹਿਰ ਦੀ ਪਛਾਣ ਲਈ PacBio ਅਤੇ ONT RNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਵਿਧੀਆਂ ਦਾ ਤੁਲਨਾਤਮਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ', ਜੀਨੋਮਿਕਸ, 115(6), p. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
ਚਾਓ, ਕਿਊ. ਆਦਿ. (2019) 'ਪੋਪੁਲਸ ਸਟੈਮ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ ਦੀ ਵਿਕਾਸਸ਼ੀਲ ਗਤੀਸ਼ੀਲਤਾ', ਪਲਾਂਟ ਬਾਇਓਟੈਕਨਾਲੋਜੀ ਜਰਨਲ, 17(1), ਪੀ.ਪੀ. 206–219। doi: 10.1111/PBI.12958.
ਡੇਂਗ, ਐੱਚ. ਐਟ ਅਲ. (2022) 'ਐਕਟੀਨੀਡੀਆ ਲੈਟੀਫੋਲੀਆ (ਇੱਕ ਐਸਕੋਰਬੇਟ-ਅਮੀਰ ਫਲ ਫਸਲ) ਅਤੇ ਐਸੋਸੀਏਟਿਡ ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਮਕੈਨਿਜਮਜ਼ ਦੇ ਫਲਾਂ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਅਤੇ ਪੱਕਣ ਦੌਰਾਨ ਐਸਕੋਰਬਿਕ ਐਸਿਡ ਸਮੱਗਰੀ ਵਿੱਚ ਗਤੀਸ਼ੀਲ ਤਬਦੀਲੀਆਂ', ਅਣੂ ਵਿਗਿਆਨ ਦਾ ਅੰਤਰਰਾਸ਼ਟਰੀ ਰਸਾਲਾ, 23(10), ਪੀ. 5808. doi: 10.3390/IJMS23105808/S1.
ਹੁਆ, ਐਕਸ ਐਟ ਅਲ. (2022) 'ਪੈਰਿਸ ਪੌਲੀਫਾਈਲਾ ਵਿੱਚ ਬਾਇਓਐਕਟਿਵ ਪੌਲੀਫਿਲਿਨਸ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਬਾਇਓਸਿੰਥੈਟਿਕ ਪਾਥਵੇਅ ਜੀਨਾਂ ਦੀ ਪ੍ਰਭਾਵੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ', ਸੰਚਾਰ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ 2022 5:1, 5(1), ਪੀ.ਪੀ. 1-10। doi: 10.1038/s42003-022-03000-z.
ਲਿਊ, ਐੱਮ. ਐਟ ਅਲ. (2023) 'ਕੰਬਾਇੰਡ ਪੈਕਬੀਓ ਆਈਸੋ-ਸੇਕ ਅਤੇ ਇਲੂਮਿਨਾ ਆਰਐਨਏ-ਸੇਕ ਐਨਾਲੀਸਿਸ ਆਫ਼ ਦ ਟੂਟਾ ਐਬਸੋਲੂਟਾ (ਮੇਰਿਕ) ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ ਅਤੇ ਸਾਈਟੋਕ੍ਰੋਮ ਪੀ450 ਜੀਨਸ', ਕੀੜੇ, 14(4), ਪੀ. 363. doi: 10.3390/INSECTS14040363/S1.
ਵੈਂਗ, ਲਿਜੁਨ ਐਟ ਅਲ. (2019) 'Ricinus communis ਵਿੱਚ ricinoleic acid biosynthesis ਦੀ ਬਿਹਤਰ ਸਮਝ ਲਈ Illumina RNA ਕ੍ਰਮ ਦੇ ਨਾਲ ਮਿਲਾ ਕੇ PacBio ਸਿੰਗਲ-ਮੌਲੀਕਿਊਲ ਰੀਅਲ-ਟਾਈਮ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਜਟਿਲਤਾ ਦਾ ਇੱਕ ਸਰਵੇਖਣ', BMC ਜੀਨੋਮਿਕਸ, 20(1), pp. 1-17। doi: 10.1186/S12864-019-5832-9.
