Heatmap -skuffen brukes til varmekarttegning, som kan filtrere, normalisere og klynge matriksdata. Den brukes mest til klyngeanalyse av genuttrykksnivå mellom forskjellige prøver.
Fest biologiske funksjoner til sekvenser i FASTA -fil ved å justere sekvenser til database, inkludert NR, KEGG, COG, SwissProt, skjelv, KOG, PFAM.
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) er en algoritme og program for å finne regioner med lignende biologiske sekvenser. Den sammenligner disse sekvensene med sekvensdatbaser og beregner den statistiske betydningen. BLAST består av fire typer verktøy basert på sekvenstype: Blastn, Lastp, BLASTX og TBLASTN.