-
BMKMANU S3000_Spatialt transkriptom
Romlig transkriptomikk står i forkant av vitenskapelig innovasjon, og gir forskere mulighet til å fordype seg i intrikate genuttrykksmønstre i vev samtidig som de bevarer deres romlige kontekst. Blant ulike plattformer har BMKGene utviklet BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip, som kan skryte av en forbedret oppløsning på 3,5 µm, når det subcellulære området og muliggjør innstillinger for flernivåoppløsning. S3000-brikken, med omtrent 4 millioner flekker, bruker mikrobrønner lagdelt med perler lastet med romlig strekkodede fangprober. Et cDNA-bibliotek, beriket med romlige strekkoder, utarbeides fra S3000-brikken og sekvenseres deretter på Illumina NovaSeq-plattformen. Kombinasjonen av romlig strekkodede prøver og UMI-er sikrer nøyaktigheten og spesifisiteten til dataene som genereres. BMKManu S3000-brikken er ekstremt allsidig, og tilbyr flernivåoppløsningsinnstillinger som kan finjusteres til forskjellige vev og ønskede detaljnivåer. Denne tilpasningsevnen posisjonerer brikken som et enestående valg for ulike romlige transkriptomiske studier, og sikrer presis romlig klynging med minimalt med støy. Bruken av cellesegmenteringsteknologi med BMKManu S3000 muliggjør avgrensning av transkripsjonelle data til cellegrensene, noe som resulterer i en analyse som har direkte biologisk betydning. Videre resulterer den forbedrede oppløsningen til S3000 i et høyere antall gener og UMI-er oppdaget per celle, noe som muliggjør en mye mer nøyaktig analyse av de romlige transkripsjonsmønstrene og klynging av celler.
-
DNBSEQ ferdiglagde biblioteker
DNBSEQ, utviklet av MGI, er en innovativ NGS-teknologi som har klart å redusere sekvenseringskostnadene ytterligere og øke gjennomstrømningen. Utarbeidelse av DNBSEQ-biblioteker involverer DNA-fragmentering, klargjøring av ssDNA og rullende sirkelamplifisering for å oppnå DNA-nanokulene (DNB). Disse blir deretter lastet på en solid overflate og deretter sekvensert ved kombinatorisk Probe-Anchor Synthesis (cPAS). DNBSEQ-teknologi kombinerer fordelene ved å ha en lav forsterkningsfeilrate med bruk av feilmønstre med høy tetthet med nanoballer, noe som resulterer i sekvensering med høyere gjennomstrømning og nøyaktighet.
Vår ferdiglagde bibliotekssekvenseringstjeneste gjør det mulig for kunder å klargjøre Illumina-sekvenseringsbiblioteker fra forskjellige kilder (mRNA, hele genom, amplikon, 10x-biblioteker, blant andre), som konverteres til MGI-biblioteker i laboratoriene våre for å bli sekvensert i DNBSEQ-T7, noe som gjør det mulig høye datamengder til lavere kostnader.
-
Hi-C-basert kromatininteraksjon
Hi-C er en metode designet for å fange genomisk konfigurasjon ved å kombinere sonderende nærhetsbaserte interaksjoner og sekvensering med høy gjennomstrømning. Metoden er basert på kromatintverrbinding med formaldehyd, etterfulgt av fordøyelse og re-ligering på en måte at kun fragmenter som er kovalent bundet vil danne ligeringsprodukter. Ved å sekvensere disse ligeringsproduktene er det mulig å studere 3D-organiseringen av genomet. Hi-C gjør det mulig å studere fordelingen av delene av genomet som er lett pakket (A-rom, euchromatin) og som er mer sannsynlig å være transkripsjonelt aktive, og regionene som er tettere pakket (B-rom, Heterochromatin). Hi-C kan også brukes til å finne topologisk assosierte domener (TADs), regioner av genomet som har foldede strukturer og som sannsynligvis har lignende uttrykksmønstre, og for å identifisere kromatinløkker, DNA-regioner som er forankret sammen av proteiner og som er ofte beriket med regulatoriske elementer. BMKGenes Hi-C-sekvenseringstjeneste gir forskere mulighet til å utforske de romlige dimensjonene til genomikk, og åpner nye veier for å forstå genomregulering og dens implikasjoner for helse og sykdom.
-
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
Rens total-RNA av høy kvalitet fra plantevev
-
TGuide Smart RNA-sett for blod/celle/vev
TGuide Smart RNA-sett for blod/celle/vev
Det forhåndsfylte reagenssettet for patron/plate for rensing av høyytende, høy renhet, høykvalitets, inhibitorfri total-RNA fra dyrevev/celle/ferskt fullblod
-
TGuide Smart Magnetic Plant DNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant DNA Kit
Rens høykvalitets genomisk DNA fra ulike plantevev
-
TGuide Smart Soil / Krakk DNA-sett
TGuide Smart Soil / Krakk DNA-sett
Renser inhibitorfritt DNA av høy renhet og kvalitet fra jord- og avføringsprøver
-
TGuide Smart DNA-rensesett
Gjenvinner høykvalitets DNA fra PCR-produkt eller agarosegeler.
-
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
Det forhåndsfylte reagenssettet for patron/plate for genomisk DNA-rensing fra blod og buffy coat
-
TGuide Smart Magnetic Tissue DNA Kit
Det forhåndsfylte reagenssettet for patron/plate for genomisk DNA-ekstraksjon fra dyrevev
-
TGuide Smart Universal DNA Kit
Det forhåndsfylte reagenssettet for kassett/plate for rensing av genomisk DNA fra blod, tørket blodflekk, bakterier, celler, spytt, munnpinner, dyrevev, etc.
-
TGuide S16 nukleinsyreekstraktor
TGuide S16 nukleinsyreekstraktor
Brukervennlig Benchtop-instrument, 1-8 eller 16 prøver samtidig
Katalognummer / emballasje
Katt. ingen
ID
Antall forberedelser
OSE-S16-AM
1 sett
-
PacBio 2+3 mRNA-løsning i full lengde
Mens NGS-basert mRNA-sekvensering er et allsidig verktøy for å kvantifisere genuttrykk, begrenser dens avhengighet av korte lesninger effektiviteten i komplekse transkriptomiske analyser. På den annen side bruker PacBio-sekvensering (Iso-Seq) langlest teknologi, som muliggjør sekvensering av mRNA-transkripsjoner i full lengde. Denne tilnærmingen letter en omfattende utforskning av alternativ spleising, genfusjoner og polyadenylering, selv om det ikke er det primære valget for kvantifisering av genuttrykk. 2+3-kombinasjonen bygger bro mellom Illumina og PacBio ved å stole på PacBio HiFi-lesninger for å identifisere det komplette settet med transkripsjonsisoformer og NGS-sekvensering for å kvantifisere de identiske isoformene.
Plattformer: PacBio Sequel II/ PacBio Revio og Illumina NovaSeq;
