●Plattformer:Illumina Novaseq 6000 og Novaseq X Plus
●Sekvenseringsmodus:PE150 og PE250
●Kvalitetskontroll av biblioteker før sekvensering
●Sekvenseringsdata QC og levering:Levering av QC -rapport og rå data i FASTQ -format etter demultiplexing og filtrering Q30 leser
●Allsidigheten av sekvenseringstjenester:Kunden kan velge å sekvensere etter bane, strømningscelle eller med mengde data som kreves (delvis banesekvensering).
●Omfattende erfaring på Illumina Sequencing Platform:med tusenvis av lukkede prosjekter med forskjellige arter.
●Levering av sekvensering av QC -rapport:Med kvalitetsmålinger, datakurs og generell ytelse av sekvenseringsprosjektet.
●Moden sekvenseringsprosess:med kort turn-tid.
●Streng kvalitetskontroll: Vi implementerer strenge QC-krav for å garantere levering av gjennomgående resultater av høy kvalitet.
Plattform | Strømningscelle | Sekvenseringsmodus | Enhet | Estimert utgang |
Novaseq x | 10b (8 baner) | PE150 | Enkeltbane Delvis bane | 375 GB / bane |
25b (8 baner) | PE150 | Enkeltbane Delvis bane | 1000 GB/bane | |
Novaseq 6000 | SP Flow Cell (2 baner) | PE250 | Strømningscelle Enkeltbane Delvis bane | 325-400 m leser / bane |
S4 Flow Cell (4 baner) | PE150 | Strømningscelle Enkeltbane Delvis bane | ~ 800 GB / bane |
Datamengde (x) | Konsentrasjon (qPCR/nm) | Volum | |
Delvis banesekvensering
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
Banesekvensering | Per bane | ≥ 1,5 nm / bibliotekbasseng | ≥ 25 μl / bibliotekbasseng |
I tillegg til konsentrasjon og total mengde, er det også nødvendig med et passende toppmønster.
Merk: Lane-sekvensering av biblioteker med lite mangfold krever Phix Spike-in for å sikre robust basisanrop.
Vi anbefaler å sende inn forhåndsbelagte biblioteker som prøver. Hvis du trenger bmkgene for å utføre bibliotekspooling, kan du henvise til
Bibliotekets krav til delvis banesekvensering.
Hovedtoppen skal være innen 300-450 bp.
Biblioteker skal ha en enkelt hovedtopp, ingen adapterforurensning og ingen primerdimerer.
En rapport om bibliotekets kvalitet er gitt før sekvensering, vurdering av bibliotekbeløp og fragmentering.
Tabell 1. Statistikk om sekvenseringsdata.
Prøve -id | BMKID | Raw leser | Rå data (BP) | Clean Reads (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93.89 | 37.08 |
Figur 1. Kvalitetsfordeling langs leser i hver prøve
Figur 2.. Baseinnholdsfordeling
Figur 3. Distribusjon av leseinnhold i sekvenseringsdata