Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Produkter

Illumina ferdiglagde biblioteker

Illumina Sequencing -teknologi, basert på sekvensering av syntese (SBS), er en globalt omfavnet NGS -innovasjon, ansvarlig for å generere over 90% av verdens sekvenseringsdata. Prinsippet om SBS innebærer avbildning av fluorescerende merkede reversible terminatorer som hver DNTP tilsettes, og deretter spaltes for å tillate inkorporering av neste base. Med alle fire reversible terminatorbundne DNTP-er som er til stede i hver sekvenseringssyklus, minimerer naturlig konkurranse inkorporeringsskjevhet. Denne allsidige teknologien støtter både en-lest og sammenkoblede biblioteker, og serverer en rekke genomiske applikasjoner. Illumina Sequencings kapasiteter med høy gjennomstrømning og presisjonsposisjoner det som en hjørnestein i genomikkforskning, og gir forskere til å avdekke vanskeligheter med genomer med uovertruffen detaljer og effektivitet.

Vår ferdiglagde bibliotekets sekvenseringstjeneste gjør det mulig for kunder å utarbeide sekvenseringsbiblioteker fra forskjellige kilder (mRNA, hele genom, amplikon, 10x biblioteker, blant andre). Deretter kan disse bibliotekene sendes til våre sekvenseringssentre for kvalitetskontroll og sekvensering i Illumina -plattformer.


Tjenestedetaljer

Demo -resultat

Funksjoner

Plattformer:Illumina Novaseq 6000 og Novaseq X Plus

Sekvenseringsmodus:PE150 og PE250

Kvalitetskontroll av biblioteker før sekvensering

Sekvenseringsdata QC og levering:Levering av QC -rapport og rå data i FASTQ -format etter demultiplexing og filtrering Q30 leser

 

 

Tjenestefordeler

Allsidigheten av sekvenseringstjenester:Kunden kan velge å sekvensere etter bane, strømningscelle eller med mengde data som kreves (delvis banesekvensering).

Omfattende erfaring på Illumina Sequencing Platform:med tusenvis av lukkede prosjekter med forskjellige arter. 

Levering av sekvensering av QC -rapport:Med kvalitetsmålinger, datakurs og generell ytelse av sekvenseringsprosjektet.

Moden sekvenseringsprosess:med kort turn-tid.

Streng kvalitetskontroll: Vi implementerer strenge QC-krav for å garantere levering av gjennomgående resultater av høy kvalitet.

 

 

Eksempelplattformer

Plattform

Strømningscelle

Sekvenseringsmodus

Enhet

Estimert utgang

Novaseq x

10b (8 baner)

PE150

Enkeltbane

Delvis bane

375 GB / bane

25b (8 baner)

PE150

Enkeltbane

Delvis bane

1000 GB/bane

Novaseq 6000

SP Flow Cell (2 baner)

PE250

Strømningscelle

Enkeltbane

Delvis bane

325-400 m leser / bane

S4 Flow Cell (4 baner)

PE150

Strømningscelle

Enkeltbane

Delvis bane

~ 800 GB / bane

Prøvekrav

 

Datamengde (x)

Konsentrasjon (qPCR/nm)

Volum

Delvis banesekvensering

 

 

X ≤ 10 GB

≥ 1 nm

≥ 25 μl

10 GB <x ≤ 50 GB

≥ 2 nm

≥ 25 μl

50 GB <x ≤ 100 GB

≥ 3 nm

≥ 25 μl

X> 100 GB

≥ 4 nm

≥ 25 μl

Banesekvensering

Per bane

≥ 1,5 nm / bibliotekbasseng

≥ 25 μl / bibliotekbasseng

I tillegg til konsentrasjon og total mengde, er det også nødvendig med et passende toppmønster.

Merk: Lane-sekvensering av biblioteker med lite mangfold krever Phix Spike-in for å sikre robust basisanrop.

Vi anbefaler å sende inn forhåndsbelagte biblioteker som prøver. Hvis du trenger bmkgene for å utføre bibliotekspooling, kan du henvise til

Bibliotekets krav til delvis banesekvensering.

Bibliotekstørrelse (toppkart)

Hovedtoppen skal være innen 300-450 bp.
Biblioteker skal ha en enkelt hovedtopp, ingen adapterforurensning og ingen primerdimerer.

Ta kontakt med oss ​​hvis prøvene dine ikke oppfyller startmaterialets krav.

Tjenestearbeidsflyt

prøveforberedelse

Bibliotekets kvalitetskontroll

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Datakvalitetskontroll

Eksempel QC

Prosjektlevering


  • Tidligere:
  • NESTE:

  • Bibliotek QC -rapport

    En rapport om bibliotekets kvalitet er gitt før sekvensering, vurdering av bibliotekbeløp og fragmentering.

     

    Sekvensering av QC -rapport

     

    Tabell 1. Statistikk om sekvenseringsdata.

    Prøve -id

    BMKID

    Raw leser

    Rå data (BP)

    Clean Reads (%)

    Q20 (%)

    Q30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96.00

    98,95

    93.89

    37.08

    Figur 1. Kvalitetsfordeling langs leser i hver prøve

    A9

    Figur 2.. Baseinnholdsfordeling

    A10

    Figur 3. Distribusjon av leseinnhold i sekvenseringsdata

    A11

     

    Få et tilbud

    Skriv meldingen din her og send den til oss

    Send meldingen din til oss: