Klein RNA

Kleine RNA's zijn korte, niet-coderende RNA's met een gemiddelde lengte van 18-30 nt, inclusief miRNA, siRNA en piRNA, die een belangrijke rol spelen in regulerende processen. De BMKCloud sRNA-pijplijn biedt zowel standaard- als aangepaste analyses voor miRNA-identificatie. Na het bijsnijden en de kwaliteitscontrole worden de lezingen uitgelijnd met meerdere databases om sRNA's te classificeren en miRNA's te selecteren en in kaart te brengen aan het referentiegenoom. miRNA's worden geïdentificeerd op basis van bekende miRNA-databases, die informatie verschaffen over de secundaire structuur, miRNA-familie en doelgenen. Differentiële expressieanalyse identificeert differentieel tot expressie gebrachte miRNA's en de overeenkomstige doelgenen worden functioneel geannoteerd om verrijkte categorieën te vinden.