-
BMKMANU S3000_ruimtelijk transcriptoom
Ruimtelijke transcriptomics lopen voorop bij wetenschappelijke innovatie en stellen onderzoekers in staat zich te verdiepen in ingewikkelde genexpressiepatronen in weefsels, terwijl hun ruimtelijke context behouden blijft. Te midden van verschillende platforms heeft BMKGene de BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip ontwikkeld, die een verbeterde resolutie van 3,5 µm biedt, het subcellulaire bereik bereikt en resolutie-instellingen op meerdere niveaus mogelijk maakt. De S3000-chip, met ongeveer 4 miljoen spots, maakt gebruik van microwells gelaagd met kralen geladen met ruimtelijk gecodeerde capture-sondes. Een cDNA-bibliotheek, verrijkt met ruimtelijke barcodes, wordt bereid vanaf de S3000-chip en vervolgens gesequenced op het Illumina NovaSeq-platform. De combinatie van ruimtelijk gebarcodeerde monsters en UMI's garandeert de nauwkeurigheid en specificiteit van de gegenereerde gegevens. De BMKManu S3000-chip is extreem veelzijdig en biedt resolutie-instellingen op meerdere niveaus die nauwkeurig kunnen worden afgestemd op verschillende weefsels en gewenste detailniveaus. Dit aanpassingsvermogen positioneert de chip als een uitstekende keuze voor diverse ruimtelijke transcriptomics-studies, waardoor nauwkeurige ruimtelijke clustering met minimale ruis wordt gegarandeerd. Het gebruik van celsegmentatietechnologie met BMKManu S3000 maakt de afbakening van transcriptionele gegevens tot de grenzen van cellen mogelijk, wat resulteert in een analyse die een directe biologische betekenis heeft. Bovendien resulteert de verbeterde resolutie van S3000 in een groter aantal gedetecteerde genen en UMI's per cel, waardoor een veel nauwkeurigere analyse van de ruimtelijke transcriptiepatronen en clustering van cellen mogelijk is.
-
Vooraf gemaakte DNBSEQ-bibliotheken
DNBSEQ, ontwikkeld door MGI, is een innovatieve NGS-technologie die erin is geslaagd de sequencing-kosten verder te verlagen en de doorvoer te verhogen. De bereiding van DNBSEQ-bibliotheken omvat DNA-fragmentatie, bereiding van ssDNA en rollende cirkelamplificatie om de DNA-nanoballen (DNB) te verkrijgen. Deze worden vervolgens op een vast oppervlak geladen en vervolgens gesequenced door combinatorische Probe-Anchor Synthesis (cPAS). DNBSEQ-technologie combineert de voordelen van een laag amplificatiefoutenpercentage met het gebruik van foutpatronen met hoge dichtheid met nanoballen, wat resulteert in sequencing met een hogere doorvoer en nauwkeurigheid.
Onze kant-en-klare bibliotheeksequencing-service stelt klanten in staat Illumina-sequencing-bibliotheken uit diverse bronnen (onder andere mRNA, volledig genoom, amplicon, 10x-bibliotheken) te maken, die in onze laboratoria worden omgezet naar MGI-bibliotheken om te worden gesequenced in DNBSEQ-T7, waardoor hoge datahoeveelheden tegen lagere kosten.
-
Op Hi-C gebaseerde chromatine-interactie
Hi-C is een methode die is ontworpen om de genomische configuratie vast te leggen door het combineren van op nabijheid gebaseerde interacties en sequencing met hoge doorvoer. De methode is gebaseerd op chromatine-verknoping met formaldehyde, gevolgd door vertering en herligatie op een manier dat alleen fragmenten die covalent gebonden zijn, ligatieproducten zullen vormen. Door deze ligatieproducten te sequencen, is het mogelijk de 3D-organisatie van het genoom te bestuderen. Hi-C maakt het mogelijk de verdeling te bestuderen van de delen van het genoom die licht opeengepakt zijn (A-compartimenten, euchromatine) en waarschijnlijker transcriptioneel actief zijn, en de gebieden die dichter opeengepakt zijn (B-compartimenten, Heterochromatine). Hi-C kan ook worden gebruikt om topologisch geassocieerde domeinen (TAD's) te lokaliseren, gebieden van het genoom die gevouwen structuren hebben en waarschijnlijk vergelijkbare expressiepatronen hebben, en om chromatinelussen te identificeren, DNA-gebieden die aan elkaar zijn verankerd door eiwitten en die vaak verrijkt met regulerende elementen. De Hi-C-sequencing-service van BMKGene stelt onderzoekers in staat de ruimtelijke dimensies van genomica te onderzoeken, waardoor nieuwe wegen worden geopend voor het begrijpen van genoomregulatie en de implicaties ervan voor gezondheid en ziekte.
-
TGuide Smart Magnetic Plant RNA-kit
TGuide Smart Magnetic Plant RNA-kit
Zuiver hoogwaardig totaal RNA uit plantenweefsels
-
TGuide Smart bloed-/cel-/weefsel-RNA-kit
TGuide Smart bloed-/cel-/weefsel-RNA-kit
De voorgevulde cartridge-/plaatreagenskit voor de zuivering van hoogproductief, zeer zuiver, hoogwaardig, remmervrij totaal RNA uit dierlijk weefsel/cel/vers volbloed
-
TGuide slimme magnetische planten-DNA-kit
TGuide slimme magnetische planten-DNA-kit
Zuiver genomisch DNA van hoge kwaliteit uit verschillende plantenweefsels
-
TGuide Smart Bodem / Ontlasting DNA-kit
TGuide Smart Bodem / Ontlasting DNA-kit
Zuivert remmervrij DNA van hoge zuiverheid en kwaliteit uit grond- en ontlastingsmonsters
-
TGuide Smart DNA-zuiveringskit
Herstelt DNA van hoge kwaliteit uit PCR-producten of agarosegels.
-
TGuide Smart Blood Genomische DNA-kit
TGuide Smart Blood Genomische DNA-kit
De voorgevulde cartridge/plaatreagenskit voor genomische DNA-zuivering uit bloed en buffy coat
-
TGuide slimme magnetische weefsel-DNA-kit
De voorgevulde cartridge-/plaatreagenskit voor genomische DNA-extractie uit dierlijke weefsels
-
TGuide Smart Universele DNA-kit
De voorgevulde cartridge-/plaatreagenskit voor het zuiveren van genomisch DNA uit bloed, gedroogde bloedvlekken, bacteriën, cellen, speeksel, orale uitstrijkjes, dierlijke weefsels, enz.
-
TGuide S16 Nucleïnezuurextractor
TGuide S16 Nucleïnezuurextractor
Eenvoudig te gebruiken tafelinstrument, 1-8 of 16 monsters tegelijkertijd
Catalogusnummer / verpakking
Kat. Nee
ID
Aantal voorbereidingen
OSE-S16-AM
1 set
-
PacBio 2+3 mRNA-oplossing van volledige lengte
Hoewel op NGS gebaseerde mRNA-sequencing een veelzijdig hulpmiddel is voor het kwantificeren van genexpressie, beperkt de afhankelijkheid van korte metingen de werkzaamheid ervan in complexe transcriptomische analyses. Aan de andere kant maakt PacBio-sequencing (Iso-Seq) gebruik van long-read-technologie, waardoor de sequencing van mRNA-transcripten van volledige lengte mogelijk is. Deze aanpak vergemakkelijkt een alomvattende verkenning van alternatieve splitsing, genfusies en polyadenylatie, hoewel het niet de primaire keuze is voor kwantificering van genexpressie. De 2+3-combinatie overbrugt de kloof tussen Illumina en PacBio door te vertrouwen op PacBio HiFi-lezingen om de volledige set transcript-isovormen te identificeren en NGS-sequencing om de identieke isovormen te kwantificeren.
Platformen: PacBio Sequel II/ PacBio Revio en Illumina NovaSeq;
