Prestaties van verschillende sequentietechnologieën bij het oplossen van metagenomics.
In deze lezing geeft ze een introductie over de toepassingen van verschillende sequencing-technologieën bij het begrijpen van het microbioom, inclusief hun technische workflows, prestaties en enkele casestudies. Het gesprek zal de volgende aspecten behandelen:
● Algemene introductie over huidige methoden voor het profileren van het microbioom
● Amplicon-gebaseerde metabarcoding-sequencing: van monstervoorbereiding tot data-interpretatie
● Wat we nog meer kunnen verwachten van metabarcoding: PacBio-gebaseerde ampliconsequencing over de volledige lengte
● Shotgun-metagenoomsequencing voor een uitgebreider inzicht in functionele genen
● Op nanoporiën gebaseerde metagenoomsequencing