lncRNA

Lange niet-coderende RNA's (lncRNA) zijn RNA's langer dan 200 nucleotiden met een laag coderingspotentieel maar met kritische regulerende functies. De BMKCloud lncRNA -pijplijn is ontworpen om rRNA -uitgeputte bibliotheken te analyseren met een hoogwaardige, goed geannoteerd referentiegenoom, door lncRNA en mRNA -expressie samen te analyseren. Na leesbezit en kwaliteitscontrole, worden lezingen uitgelijnd met het referentiegenoom om transcripten te assembleren, en de daaropvolgende genstructuuranalyse onthult alternatieve splicing en nieuwe genen. Transcripten worden geïdentificeerd als mRNA's of lncRNA's, en differentiële expressieanalyse identificeert differentieel tot expressie gebrachte lncrNA's, hun doelen en differentieel tot expressie gebrachte genen (DEG's). Zowel DEG's als differentieel tot expressie gebrachte lncRNA -doelen zijn functioneel geannoteerd om verrijkte functionele categorieën te vinden.