Producten

Hi-C is een methode die is ontworpen om de genomische configuratie vast te leggen door het combineren van op nabijheid gebaseerde interacties en sequencing met hoge doorvoer. De methode is gebaseerd op chromatine-verknoping met formaldehyde, gevolgd door vertering en herligatie op een manier dat alleen fragmenten die covalent gebonden zijn, ligatieproducten zullen vormen. Door deze ligatieproducten te sequencen, is het mogelijk de 3D-organisatie van het genoom te bestuderen. Hi-C maakt het mogelijk de verdeling te bestuderen van de delen van het genoom die licht opeengepakt zijn (A-compartimenten, euchromatine) en waarschijnlijker transcriptioneel actief zijn, en de gebieden die dichter opeengepakt zijn (B-compartimenten, Heterochromatine). Hi-C kan ook worden gebruikt om topologisch geassocieerde domeinen (TAD's) te lokaliseren, gebieden van het genoom die gevouwen structuren hebben en waarschijnlijk vergelijkbare expressiepatronen hebben, en om chromatinelussen te identificeren, DNA-gebieden die aan elkaar zijn verankerd door eiwitten en die vaak verrijkt met regulerende elementen. De Hi-C-sequencing-service van BMKGene stelt onderzoekers in staat de ruimtelijke dimensies van genomica te onderzoeken, waardoor nieuwe wegen worden geopend voor het begrijpen van genoomregulatie en de implicaties ervan voor gezondheid en ziekte.