GWAS

Genoombrede associatiestudie (GWAS) heeft tot doel loci te identificeren die geassocieerd zijn met specifieke eigenschappen of fenotypes, vaak van economisch belang of van belang voor de menselijke gezondheid. De BMKCloud GWAS-pijplijnen vereisen een lijst met geïdentificeerde genomische varianten en een lijst met fenotypische variaties. Na kwaliteitscontrole van fenotypes en genotypen worden verschillende statistische modellen toegepast om associatieanalyses uit te voeren. De pijplijn omvat ook analyse van de populatiestructuur, koppelingsonevenwicht en schatting van verwantschap.