CircRNA

Circulaire RNA's (circRNA's) zijn niet-coderende RNA's die cirkelvormige structuren vormen en meerdere regulerende rollen vervullen, waaronder het concurreren met miRNA om doelgenen en eiwitbinding. De BMKCloud circRNA-pijplijn is ontworpen voor de analyse van rRNA-arme bibliotheken met een goed geannoteerd en kwalitatief hoogstaand referentiegenoom. De analyse begint met leesaanpassing en kwaliteitscontrole, gevolgd door leesuitlijning met het referentiegenoom en voorspelling van nieuwe circRNA's, gekoppeld aan identificatie van bekende circRNA's uit databases. De overeenkomstige miRNA-doelen en circRNA-gastheren worden vervolgens geïdentificeerd. Differentiële expressieanalyse onthult differentieel tot expressie gebrachte circRNA's, en de overeenkomstige gastheren zijn functioneel geannoteerd om verrijkte biologische functies te extraheren.