सम्पूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम अनुक्रमण - Illumina
सुविधाहरू
● पूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोमलाई क्रमबद्ध गर्नको लागि दोहोरो पुस्तकालय: rRNA को कमी पछि PE150 पुस्तकालय तयारी र साइज चयन पछि SE50 पुस्तकालय तयारी
● mRNA, lncRNA, circRNA, र miRNA को अलग-अलग बायोइन्फर्मेटिक्स रिपोर्टहरूमा पूरा जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण
● संयुक्त रिपोर्टमा सबै RNA अभिव्यक्तिको संयुक्त विश्लेषण, ceRNA नेटवर्क विश्लेषण सहित।
सेवा लाभहरू
●नियामक नेटवर्कहरूको गहिरो विश्लेषण: ceRNA नेटवर्क विश्लेषण mRNA, lncRNA, circRNA, र miRNA को संयुक्त अनुक्रम र एक विस्तृत जैव सूचनात्मक कार्यप्रवाह द्वारा सक्षम गरिएको छ।
●व्यापक एनोटेशन: हामी धेरै डाटाबेसहरू प्रयोग गर्दछ कार्यात्मक रूपमा भिन्नता व्यक्त गरिएको जीन्स (DEGs) एनोटेट गर्न र सम्बन्धित संवर्धन विश्लेषण प्रदर्शन गर्न, ट्रान्सक्रिप्टोम प्रतिक्रिया अन्तर्निहित सेलुलर र आणविक प्रक्रियाहरूमा अन्तर्दृष्टि प्रदान गर्दछ।
●व्यापक विशेषज्ञता: विभिन्न अनुसन्धान डोमेनमा 2100 वटा सम्पूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम परियोजनाहरू सफलतापूर्वक बन्द गर्ने ट्र्याक रेकर्डको साथ, हाम्रो टोलीले प्रत्येक परियोजनामा अनुभवको धनी ल्याउँछ।
●कडा गुणस्तर नियन्त्रण: हामी नमूना र पुस्तकालयको तयारीदेखि अनुक्रमण र बायोइन्फर्मेटिक्ससम्म सबै चरणहरूमा कोर नियन्त्रण बिन्दुहरू लागू गर्छौं। यो सावधानीपूर्वक अनुगमनले लगातार उच्च-गुणस्तरको परिणामहरूको वितरण सुनिश्चित गर्दछ।
●पोस्ट-बिक्री समर्थन: हाम्रो प्रतिबद्धता 3-महिना पछि-बिक्री सेवा अवधि संग परियोजना समाप्ति बाहिर विस्तार छ। यस समयमा, हामी परिणामहरूसँग सम्बन्धित कुनै पनि प्रश्नहरू सम्बोधन गर्न परियोजना अनुगमन, समस्या निवारण सहायता, र प्रश्नोत्तर सत्रहरू प्रस्ताव गर्दछौं।
नमूना आवश्यकताहरू र डेलिभरी
| पुस्तकालय | अनुक्रम रणनीति | Data सिफारिस गर्नुभयो | गुणस्तर नियन्त्रण |
| rRNA समाप्त भयो | Illumina PE150 | १६ जीबी | Q30≥85% |
| साइज चयन गरियो | Illumina SE50 | 10-20M पढियो |
नमूना आवश्यकताहरू:
न्यूक्लियोटाइड्स:
| Conc.(ng/μl) | रकम (μg) | शुद्धता | निष्ठा |
| ≥ ८० | ≥ १.६ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 जेलमा देखाइएको सीमित वा कुनै प्रोटीन वा डीएनए प्रदूषण। | RIN≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; सीमित वा कुनै आधार रेखा उचाइ |
सिफारिस गरिएको नमूना वितरण
कन्टेनर: 2 एमएल सेन्ट्रीफ्यूज ट्यूब (टिन पन्नी सिफारिस गरिएको छैन)
नमूना लेबलिंग: समूह + प्रतिकृति जस्तै A1, A2, A3; B1, B2, B3।
ढुवानी:
1. ड्राई-बरफ: नमूनाहरू झोलाहरूमा प्याक गरी ड्राई-बरफमा गाडिनु पर्छ।
2. RNAstable ट्यूबहरू: RNA नमूनाहरू RNA स्थिरीकरण ट्यूब (जस्तै RNAstable®) मा सुकाउन सकिन्छ र कोठाको तापक्रममा पठाउन सकिन्छ।
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिजाइन
नमूना वितरण
आरएनए निकासी
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रम
डाटा विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
बायोइन्फर्मेटिक्स
आरएनए अभिव्यक्ति सिंहावलोकन
भिन्न अभिव्यक्त जीन
ceRNA विश्लेषण
भिन्न रूपमा व्यक्त miRNAs र सम्बन्धित RNAs
प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत BMKGene' सम्पूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम अनुक्रमण सेवाहरू द्वारा सहज भएको अनुसन्धान प्रगतिहरू अन्वेषण गर्नुहोस्।
Dai, Y. et al। (2022) 'कशिन-बेक रोगमा mRNAs, lncRNAs र miRNAs को व्यापक अभिव्यक्ति प्रोफाइल RNA-अनुक्रमण द्वारा पहिचान गरिएको', आणविक ओमिक्स, 18(2), pp. 154-166। doi: 10.1039/D1MO00370D।
लिउ, एन नान एट अल। (२०२२) 'फुल लम्बाई ट्रान्सक्रिप्टोम्स एनालिसिस अफ एपिस सेरानाको शीत-प्रतिरोधको चाङ्गबाइ माउन्टेन इन ओभरविंटरिङ पिरियडमा।', जीन, ८३०, पीपी। १४६५०३–१४६५०३। doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503।
वाङ, XJ et al। (2022) 'सानो सेल फोक्सोको क्यान्सरमा प्रतिस्पर्धा गर्ने अन्तर्जात आरएनए नियमन नेटवर्कहरूको बहु-ओमिक्स एकीकरण-आधारित प्राथमिकता: आणविक विशेषताहरू र औषधि उम्मेद्वारहरू', फ्रन्टियर्स इन ओन्कोलोजी, 12, पृ। 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX।
Xu, P. et al। (2022) 'lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA अभिव्यक्ति प्रोफाइलहरूको एकीकृत विश्लेषणले मूंगफलीमा रूट-नट नेमाटोडहरूको प्रतिक्रियामा सम्भावित संयन्त्रहरूमा नयाँ अन्तरदृष्टि प्रकट गर्दछ', BMC जेनोमिक्स, 23(1), pp. 1-12। doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
यान, जेड एट अल। (२०२२) 'होल-ट्रान्सक्रिप्टोम आरएनए सिक्वेन्सिङले रातो एलईडी विकिरणद्वारा ब्रोकोलीमा पोष्टहार्वेस्ट गुणस्तरको मर्मत सम्भारसँग सम्बन्धित आणविक संयन्त्रलाई हाइलाइट गर्दछ', पोस्टहारभेस्ट जीवविज्ञान र प्रविधि, 188, पृ। 111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878।
