सम्पूर्ण जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रमण (WGBS)
होल जीनोम बिसल्फाइट सिक्वेन्सिङ (WGBS) DNA मेथिलेसनको गहन अन्वेषणको लागि सुनको मानक पद्धतिको रूपमा खडा छ, विशेष गरी साइटोसिन (5-mC) मा पाँचौं स्थान, जीन अभिव्यक्ति र सेलुलर गतिविधिको एक निर्णायक नियामक। अन्तर्निहित WGBS सिद्धान्तले बिसल्फाइट उपचार समावेश गर्दछ, unmethylated cytosines लाई uracil (C to U) मा रूपान्तरण गर्न प्रेरित गर्दछ, जबकि methylated cytosines लाई अपरिवर्तित छोड्छ। यो प्रविधिले एकल-आधार रिजोल्युसन प्रदान गर्दछ, अनुसन्धानकर्ताहरूलाई मेथाइलोमको व्यापक रूपमा अनुसन्धान गर्न र विभिन्न अवस्थाहरू, विशेष गरी क्यान्सरसँग सम्बन्धित असामान्य मेथिलेसन ढाँचाहरू उजागर गर्न अनुमति दिन्छ। WGBS को प्रयोग गरेर, वैज्ञानिकहरूले जीनोम-व्यापी मेथिलेसन ल्यान्डस्केपहरूमा अतुलनीय अन्तर्दृष्टि प्राप्त गर्न सक्छन्, विभिन्न जैविक प्रक्रियाहरू र रोगहरू निम्त्याउने एपिजेनेटिक मेकानिजमहरूको सूक्ष्म समझ प्रदान गर्दछ।
सेवा सुविधाहरू
● सन्दर्भ जीनोम आवश्यक छ।
● Lambda DNA bisulfite रूपान्तरण दक्षता अनुगमन गर्न थपिएको छ।
● Illumina NovaSeq मा अनुक्रमण।
सेवा लाभहरू
●डीएनए मेथिलेसन अनुसन्धानको लागि सुनको मानक: यो परिपक्व मेथिलेसन रूपान्तरण प्रशोधन प्रविधिमा उच्च शुद्धता र राम्रो प्रजनन क्षमता छ।
●वाइड कभरेज र एकल-आधार संकल्प:जीनोम-वाइड स्तरमा मेथिलेसन साइटहरूको पहिचान।
●पूरा प्लेटफर्म:नमूना प्रशोधन, पुस्तकालय निर्माण, बायोइन्फर्मेटिक्स विश्लेषणको अनुक्रमबाट एक-स्टप उत्कृष्ट सेवा प्रदान गर्नुहोस्।
●व्यापक विशेषज्ञता: WGBS अनुक्रमण परियोजनाहरू सफलतापूर्वक विभिन्न प्रजातिहरूको दायरामा पूरा भएको, BMKGENE ले एक दशक भन्दा बढीको अनुभव, एक उच्च कुशल विश्लेषण टोली, व्यापक सामग्री, र उत्कृष्ट बिक्री पछि समर्थन ल्याउँछ।
●ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स विश्लेषणको साथ सामेल हुने सम्भावना: अन्य ओमिक्स डेटा जस्तै RNA-seq सँग WGBS को एकीकृत विश्लेषणको लागि अनुमति दिँदै।
नमूना विनिर्देशहरू
| पुस्तकालय | अनुक्रम रणनीति | सिफारिस गरिएको डाटा आउटपुट | गुणस्तर नियन्त्रण |
| Bisulfite उपचार | Illumina PE150 | 30x गहिराई | Q३० ≥ ८५% Bisulfite रूपान्तरण > 99% |
नमूना आवश्यकताहरू
| एकाग्रता (ng/µL) | कुल रकम (µg) | अतिरिक्त आवश्यकताहरू | |
| जीनोमिक डीएनए | ≥ ५ | ≥ 400 एनजी | सीमित गिरावट वा प्रदूषण |
सेवा कार्य प्रवाह
नमूना वितरण
डीएनए निकासी
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रम
डाटा विश्लेषण
डाटा वितरण
निम्न विश्लेषण समावेश:
● कच्चा अनुक्रम गुणस्तर नियन्त्रण;
● सन्दर्भ जीनोममा म्यापिङ;
● 5mC मिथाइलेटेड आधारहरूको पत्ता लगाउने;
● मेथिलेसन वितरण र एनोटेसनको विश्लेषण;
● भिन्न मेथाइलेटेड क्षेत्रहरू (DMRs) को विश्लेषण;
● DMRs सँग सम्बन्धित जीनहरूको कार्यात्मक एनोटेशन।
5mC मेथिलेसन पत्ता लगाउने: मेथाइलेटेड साइटहरूको प्रकार
मेथिलेसन नक्शा। 5mC मेथिलेसन जीनोम-विस्तृत वितरण
अत्यधिक मिथाइलेटेड क्षेत्रहरूको एनोटेसन
भिन्न मेथाइलेटेड क्षेत्रहरू: सम्बन्धित जीन
भिन्न मेथाइलेटेड क्षेत्रहरू: सम्बद्ध जीनहरूको एनोटेशन (जीन ओन्टोलजी)
प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत BMKGene को सम्पूर्ण जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रमण सेवाहरूद्वारा सहजीकरण गरिएको अनुसन्धान प्रगतिहरू अन्वेषण गर्नुहोस्।
फ्यान, वाई एट अल। (2020) 'पूरा-जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रम प्रयोग गरेर भेडाको कंकालको मांसपेशी विकासको क्रममा डीएनए मेथिलेसन प्रोफाइलहरूको विश्लेषण',BMC जीनोमिक्स, 21(1), पृ. 1-15। doi: 10.1186/S12864-020-6751-5।
Zhao, X. et al। (2022) 'विनाइल क्लोराइडको सम्पर्कमा आएका कामदारहरूमा नोभल डिओक्साइरिबोन्यूक्लिक एसिड मिथाइलेशन विकृति',विष विज्ञान र औद्योगिक स्वास्थ्य, ३८(७), पृष्ठ ३७७–३८८। doi: 10.1177/07482337221098600
जुओ, जे एट अल। (2020) 'जीनोम मेथिलेसन, गैर-कोडिङ RNAs, mRNAs र टमाटर फल पाक्ने मेटाबोलाइट्सको स्तरहरू बीचको सम्बन्ध',प्लान्ट जर्नल, 103(3), पृ. 980-994। doi: 10.1111/TPJ.14778।
