रिड्युस्ड रिप्रेजेन्टेशन बिसल्फाइट सिक्वेन्सिङ (RRBS)
रिड्युस्ड रिप्रेजेन्टेशन बिसल्फाइट सिक्वेन्सिङ (आरआरबीएस) डीएनए मेथिलेसन अनुसन्धानमा होल जीनोम बिसल्फाइट सिक्वेन्सिङ (WGBS) को लागत-प्रभावी र प्रभावकारी विकल्पको रूपमा उभिएको छ। जबकि WGBS ले एकल आधार रिजोल्युसनमा सम्पूर्ण जीनोम जाँच गरेर व्यापक अन्तरदृष्टि प्रदान गर्दछ, यसको उच्च लागत एक सीमित कारक हुन सक्छ। आरआरबीएसले रणनीतिक रूपमा जीनोमको प्रतिनिधि भागलाई छनौट गरी विश्लेषण गरेर यस चुनौतीलाई कम गर्छ। यो पद्धति MspI क्लीभेज द्वारा CpG टापु-समृद्ध क्षेत्रहरूको समृद्धिमा निर्भर गर्दछ र त्यसपछि 200-500/600 bps टुक्राहरूको आकार चयन। फलस्वरूप, केवल CpG टापुहरूको निकटतम क्षेत्रहरू क्रमबद्ध छन्, जबकि टाढाका CpG टापुहरू भएकाहरूलाई विश्लेषणबाट बहिष्कृत गरिएको छ। यो प्रक्रिया, bisulfite अनुक्रम संग संयुक्त, DNA मेथिलेसन को उच्च-रिजोल्युशन पत्ता लगाउन अनुमति दिन्छ, र अनुक्रमण दृष्टिकोण, PE150, विशेष गरी मध्यको सट्टा सम्मिलितहरूको छेउमा केन्द्रित हुन्छ, मेथिलेसन प्रोफाइलिङको दक्षता बढाउँछ। RRBS एउटा अमूल्य उपकरण हो जसले लागत-प्रभावी DNA मेथिलेसन अनुसन्धानलाई सक्षम बनाउँछ र एपिजेनेटिक मेकानिज्महरूको ज्ञान बढाउँछ।
सेवा सुविधाहरू
● सन्दर्भ जीनोम आवश्यक छ।
● Lambda DNA bisulfite रूपान्तरण दक्षता निगरानी गर्न प्रयोग गरिन्छ।
● MspI पाचन क्षमता पनि निगरानी गरिन्छ।
● बिरुवाको नमूनाहरूको लागि डबल इन्जाइम पाचन।
● Illumina NovaSeq मा अनुक्रमण।
सेवा लाभहरू
●WGBS को लागत-प्रभावी र कुशल वैकल्पिक: कम लागतमा र कम नमूना आवश्यकताहरू सहित विश्लेषणलाई सक्षम पार्दै।
●पूरा प्लेटफर्म:नमूना प्रशोधन, पुस्तकालय निर्माण, र बायोइन्फर्मेटिक्स विश्लेषणको अनुक्रमबाट एक-स्टप उत्कृष्ट सेवा प्रदान गर्नुहोस्।
●व्यापक विशेषज्ञता: विभिन्न प्रजातिका विभिन्न दायराहरूमा सफलतापूर्वक सम्पन्न भएका RRBS अनुक्रमण परियोजनाहरूको साथ, BMKGENE ले एक दशकभन्दा बढी अनुभव, एक उच्च कुशल विश्लेषण टोली, व्यापक सामग्री, र उत्कृष्ट बिक्री पछि समर्थन ल्याउँछ।
सेवा विशिष्टताहरू
| पुस्तकालय | अनुक्रम रणनीति | सिफारिस गरिएको डाटा आउटपुट | गुणस्तर नियन्त्रण |
| MspI पचाइएको र Bisulfite उपचार पुस्तकालय | Illumina PE150 | ८ जीबी | Q३० ≥ ८५% Bisulfite रूपान्तरण > 99% MspI काट्ने दक्षता > 95% |
नमूना आवश्यकताहरू
| एकाग्रता (ng/µL) | कुल रकम (µg) |
| |
| जीनोमिक डीएनए | ≥ ३० | ≥ १ | सीमित गिरावट वा प्रदूषण |
सेवा कार्य प्रवाह
नमूना वितरण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रम
डाटा विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
निम्न विश्लेषण समावेश:
● कच्चा अनुक्रम गुणस्तर नियन्त्रण;
● सन्दर्भ जीनोममा म्यापिङ;
● 5mC मिथाइलेटेड आधारहरू र मोटिफ पहिचानको पत्ता लगाउने;
● मेथिलेसन वितरण र नमूना तुलनाको विश्लेषण;
● भिन्न मेथाइलेटेड क्षेत्रहरू (DMRs) को विश्लेषण;
● DMRs सँग सम्बन्धित जीनहरूको कार्यात्मक एनोटेशन।
गुणस्तर नियन्त्रण: पाचन क्षमता (जीनोम म्यापिङमा)
गुणस्तर नियन्त्रण: बिसल्फाइट रूपान्तरण (मेथिलेसन जानकारी निकासीमा)
मेथिलेसन नक्शा: 5mC मेथिलेसन जीनोम-वाइड वितरण
नमूना तुलना: प्रिन्सिपल कम्पोनेन्ट विश्लेषण
भिन्न मेथाइलेटेड क्षेत्रहरू (DMRs) विश्लेषण: हीटम्याप
प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत BMKGene को सम्पूर्ण जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रमण सेवाहरूद्वारा सहजीकरण गरिएको अनुसन्धान प्रगतिहरू अन्वेषण गर्नुहोस्।
Li, Z. et al। (2022) 'CRISPR सक्रियता र paracrine कारकहरूद्वारा Leydig-like कोशिकाहरूमा उच्च निष्ठा पुन: प्रोग्रामिंग',PNAS नेक्सस, १(४)। doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179।
टियान, एच एट अल। (2023) 'चिनियाँ मोनोजाइगोटिक जुम्ल्याहाहरूमा शरीर संरचनाको जीनोम-वाइड डीएनए मेथिलेसन विश्लेषण',क्लिनिकल अनुसन्धान को यूरोपीयन जर्नल, 53(11), p। e14055। doi: 10.1111/ECI.14055।
Wu, Y. et al। (2022) 'डीएनए मेथिलेसन र कम्मर-देखि-हिप अनुपात: चिनियाँ मोनोजाइगोटिक जुम्ल्याहाहरूमा एक एपिजेनोम-वाइड एसोसिएशन अध्ययन',Endocrinological अनुसन्धान को जर्नल, ४५(१२), पृष्ठ २३६५–२३७६। doi: 10.1007/S40618-022-01878-4।
